Summary

Samenvatting Genoom (BMW21614)

0 purchase

Course
Genoom (BMW21614)

Institution
Universiteit Utrecht (UU)

Samenvatting van het vak Genoom (BMW21614) van Biomedische Wetenschappen. Bevat de volgende onderwerpen: PCR, restrictie-enzymen, DNA-gelelectroforese, genomische banken en cDNA banken, overexpressie, fusie-eiwitten, reporter-genen, Sanger sequencing, Next Generation Sequencing, DNA-klonering, plaa...

[Show more]

Preview 2 out of 7 pages

View example

Uploaded on March 24, 2023
Number of pages 7
Written in 2018/2019
Type Summary

onderzoekstechnieken
pcr
rt pcr
restrictie enzymen
gel elektroforese
overexpressie
fusie eiwitten
reporter genen
sanger sequencing
dna klonering
plaatsgerichte mutagenese
next generation sequencing
rn

Institution
Universiteit Utrecht (UU)
Education
Biomedische Wetenschappen
Course
Genoom (BMW21614)

$5.93

Add to cart

Add to wishlist

100% satisfaction guarantee
Immediately available after payment
Both online and in PDF
No strings attached

DNA-technieken
 Onderzoek
o PCR
o Restrictie-enzymen
o DNA-gelelectroforese
o Genomische banken en cDNA banken
o Overexpressie
o Fusie-eiwitten
o Reporter-genen
o Sanger sequencing
o Next Generation Sequencing
 Manipulatie
o Restrictie-enzymen
o DNA-klonering
o Plaatsgerichte mutagenese
o Overexpressie
o RNA-interferentie (shRNA’s)
o CRISPR/Cas9 gene editing

RNA-technieken
 In-situ hybridisatie
 RT-PCR
 cDNA
 RNA-seq

Manipulatie/onderzoekstechnieken
 RNA-interferentie
 Plasmides, kloneren, kloneringsvectoren, expressievectoren, cDNA-banken, genomische banken
 Fusie-eiwitten
 Reporter-genen (GFP)
 Inductie van bèta-galactosidase, spectrofotometer
 SDS-PAGE en Western Blot
 GST-pull down
 Co-IP
 ChIP
 CRISPR/Cas9 gene editing

(In-situ) hybridisatie
 Doel: lokalisatie RNA of DNA
 Methode:
o Inbrengen korte stukjes fluorescerend DNA of RNA
o DNA: uitsmelten
o Hybridisatie op specifieke sequentie

PCR
 Doel: DNA selecteren en vermeerderen voor onderzoek
 Methode: thermocycling
o Denaturatie: dubbelstrengs  enkelstrengs
o Annealing: baseparing primers

, o Elongation: enkelstrengs  dubbelstrengs
 Benodigdheden:
o DNA-fragment dat je wil vermeerderen
o Forward en reverse primer (die aan 3’ kant van fragment binden op beide strengen)
o DNA-polymerase
o dNTP’s
o Buffer
o Water
 Voorwaarden primers:
o Complementair aan beide kanten gen
o Niet complementair aan elkaar
o Geen interne baseparing
o 15-30 baseparen lang
o Zo veel mogelijk uit G en C

RT-PCR
 Doel: RNA selecteren, vermeerderen en vergelijken
 RNA te instabiel als fragment in PCR  RT-PCR
 Methode: maken van cDNA
o Isoleren (m)RNA
o (m)RNA  RNA/DNA met reverse transcriptase en poly-T-primer (bindt poly-A-staart)
o RNA/DNA  DNA/DNA met RNA degradatie en DNA-polymerase (RNA als primer)
 Welke cDNA’s dit oplevert is afhankelijk van de aanwezige RNA’s in het sample zaten
 Kwantitatieve RT-PCR
o Twee cDNA’s worden vermeerderd met PCR
o Toevoegen eiwit dat fluoresceert als het dubbelstrengs DNA bindt
o Hoe meer DNA  hoe meer fluorescentie
o Aantal cycli nodig om maximale fluorescentie te berijken: mate voor hoeveelheid mRNA
in sample

Plaats-specifieke mutagenese
 Doel: specifieke mutatie aanbrengen
 Methode:
o PCR met gemuteerde primer
o Primer bindt specifieke sequentie  mutatie
o Replicatie
o Verwijderen bacterieel (gemethyleerd) DNA met DNP1

Restrictie-enzymen
 Herkennen palindromische sequentie in DNA
o Sticky ends: 3’ of 5’ overhang
 5’ overhang kan blunt gemaakt worden
 3’ overhang niet
o Blunt ends: geen overhang
 Doelen:
o Inbrengen gen in expressievector
o Sequentie-onderzoek: knipt enzym wel of niet
 Methode: inbrengen gen in expressievector
o Restrictie-enzymen: knip gen uit insert vector

The benefits of buying summaries with Stuvia:

Guaranteed quality through customer reviews

Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.

Quick and easy check-out

You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.

Focus on what matters

Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!

Frequently asked questions

What do I get when I buy this document?

You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.

Satisfaction guarantee: how does it work?

Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.

Who am I buying these notes from?

Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller biomedstudent1. Stuvia facilitates payment to the seller.

Will I be stuck with a subscription?

No, you only buy these notes for $5.93. You're not tied to anything after your purchase.

Can Stuvia be trusted?

4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)

69052 documents were sold in the last 30 days

Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 15 years now

Start selling