Summary
Samenvatting Campbell and Reece: H20
- Course
- Institution
- Book
Samenvatting van H20 uit het boek Campbell and Reece: biology. Handig voor deeltoets 2 van het vak moleculaire biologie!
[Show more]
Connected book
Book Title:
Author(s):
- Edition:
- ISBN:
- Edition:
Seller
Follow
Sanne2301
Reviews received
Content preview
HOOFDSTUK 20: THE EVOLUTION OF GENOMESConcept 20.1
Whole genome shotgun approach
● Kleine stukjes DNA sequencen
● Overlap tussen verschillende stukken
● Lastig vanwege repeterende sequenties
● Makkelijker als je al een referentie
genoom hebt
Metagenomics
● DNA isoleren van een populatie van
organismen (meerdere organismen
tegelijk)
● Voorbeelden:
○ Alle darm bacteriën
○ Alle organismen in emmer
zeewater
● Sequencen van al het DNA tegelijk
● Bepalen welke organismen er
voorkomen in monster
1
, Concept 20.2
● Bio informatica
○ Online tools en databases
■ Software programma dat sequenties aligned of vergelijkt
■ Worldwide database van alle 3D eiwit structuren
■ Meestal gratis beschikbaar
■ Hoeveelheid data/sequenties gigantisch
■ Op zoek naar verbanden/verschillen in sequenties
● Bio-informatie
■ Beschikbaar en doorzoekbaar maken voor wetenschappers
● Genbank
○ Sequenties
○ Tools voor analyse
● Gen annotatie: op zoek in genoom sequentie naar genen
○ Grotendeels geautomatiseerd sporen naar:
■ Bekende start en stop sequenties voor translatie/transcriptie
■ Bekende sequenties leidend tot splicing
■ Vergelijken met EST-sequenties (Expressed Sequence Tags)
● EST sequenties zijn sequenties gevonden in mRNA
○ Functionele studies vervolgens nodig om uit te zoeken wat gen doet
■ Voorbeeld uitschakelen met Crispr Cas9
● Systeembiologie: bestuderen van dynamisch gedrag biologisch systeem
○ Door bestuderen van interacties tussen de onderdelen
○ Een kaart maken van alle interacties tussen genen in de cel
■ Meer interessant: interacties tussen eiwitten!
○ Proteomics: bestuderen van het proteoom (alle eiwitten in de cel)
■ Interactie plattegrond van eiwitten in gist
■ Clusters van eiwitten betrokken bij bepaalde celprocessen
○ Toepassingen
■ Cancer genome atlas project
● In kaart brengen van alle mutaties in bepaalde kankersoorten
● Overeenkomsten tussen kankertypen geven mogelijk ook aan dat
ze gevoelig zijn voor dezelfde therapie
2
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller Sanne2301. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $3.17. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
48298 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 15 years now