Otro
Laboschrift module II ADE
- Grado
- Institución
Laboschrift module II A (stap 4 en 5), D en E.
[Mostrar más]Vista previa 2 fuera de 15 páginas
Vista previa 2 fuera de 15 páginas
Añadir al carrito
Añadir al carrito
Vendedor
Seguir
caramestdag
Comentarios recibidos
Vista previa del contenido
Name and Surname: Mestdag CaraGroup: 1Cc
II. Methods and techniques in molecular biology
II.A. Genotyping of wild type and obese mice
II.A. Step 4: DNA purification
Datum: 27/02/23
Veiligheidsinformatie
Voor deze proef moet geen veiligheidsinformatie opgezocht worden, aangezien het experiment door
een assistent uitgevoerd wordt.
Procedure
Voor deze proef moet geen verwijzing naar de procedure gemaakt worden, aangezien het
experiment door een assistent uitgevoerd wordt.
Berekeningen en waarnemingen
Voor deze proef moeten geen berekeningen en waarnemingen gemaakt worden, aangezien het
experiment door een assistent uitgevoerd wordt.
Taken en vragen
1. Why is it important to evaluate the pH before applying your PCR mixture containing DNA
combined with binding buffer to a purification column?
DNA moet negatief geladen zijn om te kunnen binden met de silica-matrix. Daarvoor is een
zure pH nodig. Indien de pH te basisch zou zijn zal DNA niet de juiste lading hebben en kan de
binding met de silica-matrix niet plaatsvinden. Stel dat de binding niet heeft plaatsgevonden
dan zal het DNA wegwassen. Er kan dan geen DNA-opzuivering gebeuren.
2. What is the effect of the chaotropic reagent in the binding buffer?
Het chaotroop zout bevat natriumionen, die een zoutbrug gaan vormen tussen het
silicamembraan en het DNA. Bijkomend zorgt het zout er ook voor dat de waterlaag rondom
het DNA en het silicamembraan wegtrekt.
3. How do we elute DNA from the purification column?
Door te elueren met een buffer met lage zoutconcentratie en een hoge pH. De dalende
zoutconcentratie zorgt ervoor dat DNA niet meer kan binden aan de natriumionen. De
stijgende pH heeft een effect op de geladen groepen en zorgt ervoor dat de bindingen met
DNA zwakker worden.
1
, Name and Surname: Mestdag Cara
Group: 1Cc
II. Methods and techniques in molecular biology
II.A. Genotyping of wild type and obese mice
II.A. Step 5: DNA sequencing
Datum: 27/02/23
Veiligheidsinformatie
Voor deze proef moet geen veiligheidsinformatie opgezocht worden, aangezien het experiment door
een assistent uitgevoerd wordt.
Procedure
Voor deze proef moet geen verwijzing naar de procedure gemaakt worden, aangezien het
experiment door een assistent uitgevoerd wordt.
Berekeningen en waarnemingen
Voor deze proef moeten geen berekeningen en waarnemingen gemaakt worden, aangezien het
experiment door een assistent uitgevoerd wordt.
Taken en vragen
1. Examine the results of the sequencing using the basic local alignment search tool (BLAST)
(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi). Which sample corresponds to DNA from wt and
which with DNA from ob/ob mice? Argument. Provide a screenshot of the output.
We hebben BLAST1 gebruikt om de nucleotidesequenties van de samples te vergelijken met
de biologische sequenties van de muis. Tabel 1: Screenshot of analysis geeft de resultaten van
de test weer op de volgende bladzijde. De bovenstaande sequentie geeft de sequentie van de
samples weer. De onderste sequentie geeft de biologische sequentie van een wilde muis weer.
Aangeduid in het blauw op Figuur 1: BLAST resultaten sample 1 en Figuur 1: BLAST resultaten
sample 2 is de plaats waar de puntmutatie plaatsvindt bij ob/ob muis. Bij sample 1 zien we op
deze plek een cytosine (C), dit komt overeen met de sequentie van een wilde muis. Bij sample
2 zien we echter op diezelfde plek een thymine (T).
We kunnen dus besluiten dat sample 1 het DNA van een wt muis weergeeft en sample 2 dat
van een ob/ob muis.
1
Blast: Basic local alignment search tool. https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi (accessed Mar 2, 2023).
2
Los beneficios de comprar resúmenes en Stuvia estan en línea:
Garantiza la calidad de los comentarios
Compradores de Stuvia evaluaron más de 700.000 resúmenes. Así estas seguro que compras los mejores documentos!
Compra fácil y rápido
Puedes pagar rápidamente y en una vez con iDeal, tarjeta de crédito o con tu crédito de Stuvia. Sin tener que hacerte miembro.
Enfócate en lo más importante
Tus compañeros escriben los resúmenes. Por eso tienes la seguridad que tienes un resumen actual y confiable. Así llegas a la conclusión rapidamente!
Preguntas frecuentes
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
100% de satisfacción garantizada: ¿Cómo funciona?
Nuestra garantía de satisfacción le asegura que siempre encontrará un documento de estudio a tu medida. Tu rellenas un formulario y nuestro equipo de atención al cliente se encarga del resto.
Who am I buying this summary from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller caramestdag. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy this summary for 4,49 €. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
45,681 summaries were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy summaries for 14 years now