100% de satisfacción garantizada Inmediatamente disponible después del pago Tanto en línea como en PDF No estas atado a nada
logo-home
Buscado previamente por ti
Buscado previamente por ti
logo
Samenvatting H6, DNA naar eiwit 3,49 €
Añadir al carrito
Navegar rápidamente a
Vista previa
  2.  
  3. Universiteit Utrecht (UU)
  4.  
  5. Cellen en weefsels

Resumen

Samenvatting H6, DNA naar eiwit

3 reseñas
 1 veces vendidas
  • Grado
  • Cellen en weefsels
  • Institución
  • Universiteit Utrecht (UU)
  • Book
  • Molecular Biology of the Cell

Dit is een uitgebreide samenvatting van hoofdstuk 6 'How cells read the genome: from DNA to protein' uit Molecul biology of the cell (6e editie). Onderwerpen die aan bod komen, zijn:....

Última actualización de este documento: 5 año hace

Vista previa 3 fuera de 20  páginas

Información del documento

  • No
  • H6
  • 27 de septiembre de 2019
  • 1 de octubre de 2019
  • 20
  • 2019/2020
  • Resumen

Temas

  • dna

Libro relacionado

book image

Título del libro:

Autor(es):

  • Edición:
  • ISBN:
  • Edición:

Escuela, estudio y materia

  • Universiteit Utrecht (UU)
  • Biologie
  • Cellen en weefsels
Todos documentos para esta materia (82)

3  reseñas

review-writer-avatar

Por: LaureSchippers • 3 año hace

review-writer-avatar

Por: femmiesmit • 5 año hace

review-writer-avatar

Por: luuklangefeld • 5 año hace

Vendedor

avatar-seller
brittheijmans

Comentarios recibidos

Vista previa del contenido

H6, hoe cellen het genoom lezen: van DNA tot eiwit
Inleiding
Centrale dogma, als de cel een bepaald eiwit nodig heeft, wordt een gedeelte van het DNA
gekopieerd tot een RNA transcript (transcriptie). RNA wordt dan als template gebruikt om
eiwitsynthese aan te sturen (translatie). Je krijgt dus DNA → RNA → eiwit.
6.1 Van DNA naar RNA
Efficiëntie, van eenzelfde gen kunnen veel RNA kopieën gemaakt worden en
elk RNA molecuul kan de synthese van veel identieke eiwitten aansturen.
Cellen zijn dus in staat een grote hoeveelheid eiwitten te produceren van 1
gen als dat nodig is. Transcriptie en translatie van verschillende genen is niet
altijd even efficiënt, waardoor een cel van het ene eiwit heel veel kan
produceren en van het ander heel weinig.
RNA VS DNA, deze nucleïnezuren verschillen
chemisch gezien op 2 manieren van elkaar:
1. De nucleotiden van RNA zijn ribonucleotiden die het suiker ribose,
i.p.v. deoxyribose, bevatten.
2. RNA bevat de base uracil (U) in plaats van thymine (T).
Desondanks dat deze chemische verschillen meevallen, is er een groot
verschil in algemene structuur. Waar DNA altijd als een dubbele helix voorkomt in cellen, komt RNA
enkelstrengs voor. Hierdoor is het in staat zich in allerlei vormen te vouwen.
DNA transcriptie, begint met het openen en unwinding van een klein stuk DNA om de basen van elke
DNA streng bloot te stellen. 1 v/d 2 dient dan als template voor RNA synthese. Net als bij DNA
replicatie vindt de synthese plaats op basis van complementaire baseparing.
Transcriptie VS replicatie, bij transcriptie blijft de nieuw gevormd RNA streng niet middels
waterstofbruggen aan de DNA template gebonden. Net achter het stuk waar de nieuwe nucleotiden
toegevoegd worden, wordt de RNA streng verdrongen door DNA om de dubbele helix weer te
herstellen.
RNA polymerases, deze enzymen voeren transcriptie uit. Ze
katalyseren de vorming van fosfodiëster bindingen die de nucleotiden
aan elkaar verbinden (net als DNA polymerases doen). De groeiende
RNA streng wordt in de 5’-3’ richting aangemaakt. Doordat de
groeiende RNA streng snel loslaat van DNA kunnen meerdere RNA
polymerases elkaar opvolgen op 1 gen.
RNA VS DNA polymerase, desondanks dat deze 2 enzymen vrijwel
dezelfde reactie katalyseren, zijn er een paar belangrijke verschillen:
1. RNA polymerase katalyseert het polymeriseren van
ribonucleotiden i.p.v. deoxyribonucleotiden.
2. RNA polymerase heeft geen primer nodig om te beginnen. Er wordt gedacht dat dit mogelijk
is, doordat transcriptie niet zo precies hoeft te zijn als replicatie.
3. RNA polymerases zijn absolute processive wat wil zeggen dat het RNA polymerase dat een
RNA molecuul begint, het ook afmaakt zonder los te komen van de DNA template. DNA
polymerase maakt haar producten in segmenten die later aan elkaar gezet worden.
Proofreading RNA polymerase, desondanks dat RNA polymerases lang niet zo accuraat zijn als DNA
polymerases bezitten ze wel proofreading capaciteit. Als een incorrect ribonucleotide toegevoegd
wordt aan een groeiende RNA streng, kan het polymerase een stapje terugnemen en kan de active
site van het enzym een excisie reactie uitvoeren. Deze reactie is vergelijkbaar met het omgekeerde
van de polymerisatie reactie behalve dat een watermolecuul de pyrophosphate groep vervangt en
een nucleoside monofosfaat daarbij vrijkomt.

,Ontstaan polymerases, DNA en RNA polymerase lijken qua structuur totaal niet op elkaar en
template-depending nucleotide-polymerizing enzymes zijn waarschijnlijk 2 keer ontstaan in de vroege
evolutie van cellen. Een lineage heeft tot DNA polymerases en reverse transcriptases geleid, terwijl
een andere lineage tot de RNA polymerases heeft geleidt.
RNA moleculen, we kennen vele soorten RNA moleculen:
- mRNA, messenger RNA, wordt door ribosomen getransleerd tot eiwit. Dit RNA behoort
daarom als enige tot coderend RNA, terwijl de rest niet-coderend wordt beschouwd.
- snRNA, small nuclear RNA, begeleidt de splicing van pre-mRNA tot mRNA.
- rRNA, ribosomaal RNA, rRNA vormen de kern van ribosomen.
- snoRNA, small nucleolar RNA, helpt bij het verwerken en chemisch modificeren van rRNAs.
- tRNA, transfer RNA, staan centraal in eiwitsynthese als adaptors tussen mRNA en
aminozuren.
- miRNA, micro RNA, dient als belangrijke regulator voor eukaryote genexpressie (H7).
- siRNA, small interfering RNA, dient ook als belangrijke regulator voor eukaryote genexpressie
(H7).
- piRNA, piwi-interacting RNA, beschermt dierlijke kiemcellen tegen transposons (H7).
- lncRNA, long noncoding RNA, een diverse set aan RNAs waarvan de functie momenteel
ontdekt wordt (H7).
Niet-coderend RNA, net als eiwit dient niet-coderend RNA als enzym, structureel component of
regulerend component voor een variëteit aan processen in de cel. Zo draagt telomerase een RNA bij
zich als template.
Transcriptie unit, een segment DNA dat getranscribeerd wordt, noemen we een transcription unit.
Bij eukaryoten draagt 1 transcriptie unit meestal de informatie voor 1 gen. Bij bacteriën wordt een
set van naastgelegen genen vaak als unit getranscribeerd en het resulterende mRNA molecuul draagt
dan dus de informatie voor meerdere eiwitten.
Transcriptie initiatie, verschilt nogal tussen bacteriën en eukaryoten. Het is een hele belangrijke stap
in regulatie van genexpressie aangezien een cel hiermee bepaalt welke eiwitten wel of niet
geproduceerd worden en in welke mate.
Bacteriële transcriptie initiatie, bij bacteriën wordt RNA polymerase geholpen door een subunit
genaamd sigma (σ) factor. De sigma factor helpt RNA polymerase bij het lezen van de DNA template
en ‘vertelt’ hem wanneer die moet beginnen met transcriptie.
RNA polymerase holoenzym, RNA polymerase is
een multisubunit complex en wanneer de σ factor
hier als additionele subunit bijkomt, spreken we
van een RNA polymerase holoenzym. Normaal
bindt dit complex maar zwak aan DNA als RNA pol
en de σ factor samenkomen en valt het er op den
duur weer af. Als het holoenzym echter over een
promotor verplaatst, zal het polymerase strak aan
DNA binden doordat de σ factor speciale
contacten maakt met basen van de promotor (1).
Promotor, is een speciale sequentie aan
nucleotiden die het startpunt van RNA synthese
aangeeft.
RNA synthese bacteriën, het strak gebonden RNA
polymerase holoenzym opent de DNA dubbele
helix bij de promotor om een kort stuk aan
nucleotiden bloot te stellen op elke streng (2).
Deze regio aan ongepaard DNA wordt de
transcription bubble genoemd en wordt
gestabiliseerd doordat de σ factor aan de basen
van 1 v/d ongepaarde strengen bindt. De andere

, DNA strang dient vervolgens als template. De eerste ±10 nucleotiden van RNA worden middels een
‘scrunching’ mechanisme gesynthetiseerd. Hierbij blijft RNA polymerase aan de promotor gebonden
en trekt het enzym het upstream DNA in zijn active site (3). De korte RNAs die hierbij gevormd
worden, dissociëren vaak, waardoor de spanning op het DNA afneemt en RNA pol steeds opnieuw
moet beginnen. Dit proces van abortive initiation wordt uiteindelijk overkomen en de spanning die
door scrunching gegeneerd is, helpt RNA pol los te komen van de interacties met het promotor DNA
(4). Hierbij wordt de σ factor geloosd (5). Elongatie gaat vervolgens door tot het enzym een tweede
signaal tegenkomt: de terminator (6). Bij dit signaal laat RNA pol zowel het nieuw gemaakt RNA als
de DNA template los (7). Het vrije RNA polymerase komt dan weer samen met een σ factor om een
holoenzym te vormen dat een nieuw transcriptie proces kan beginnen (8).
Terminator, bij de meeste bacteriële genen bestaat een terminatie signaal uit een streng aan A-T
nucleotiden dat voorafgegaan wordt door een tweevoudig symmetrische DNA sequentie. Als deze
afgeschreven wordt tot RNA vormt die een hairpin structuur die helpt bij het dissociëren van het RNA
transcript van de active site.
Consensus sequentie promotor, er is een grote variatie aan promotoren bekend bij bacteriën, maar
als je ze vergelijkt zijn er wel een paar eigenschappen die vaak terugkomen. Op basis hiervan kan een
consensus sequentie gemaakt worden. Een consensus nucleotide sequentie bestaat uit de
nucleotiden die op hun plek het vaakst voorkomen. DNA sequenties van individuele bacteriële
promotors verschillen in manieren die hun sterkte bepalen (het aantal initiaties per tijdseenheid per
promotor). Promotors voor genen die coderen voor veelvoorkomende eiwitten zijn bijvoorbeeld veel
sterker dan de promotors van genen voor eiwitten die zelden voorkomen. De nucleotide sequenties
van de promotoren zijn hiervoor verantwoordelijk.
Terminator sequenties, aangezien veel sequenties in staat zijn hairpins te vormen, zijn terminator
sequentie nog meer heterogeen dan promotor sequenties.
Vaak hebben we meer informatie nodig dan enkel de sequentie om accuraat DNA signalen te
lokaliseren in het genoom. Bij eukaryoten is het nog uitdagender door de grote hoeveelheid DNA.
Promotor asymmetrie, promotor sequenties zijn
asymmetrisch om te zorgen dat RNA polymerase
maar in 1 oriëntatie aan het DNA kan binden.
Doordat polymerase enkel RNA kan synthetiseren in
de 5’-3’ richting bepaalt de promotor oriëntatie
welke streng als template gebruikt wordt.
RNA polymerase eukaryoten, waar bacteriën maar 1 RNA polymerase hebben, hebben eukaryoten
er 3. Structureel zijn de polymerases vergelijkbaar en ze delen ook een paar gemeenschappelijk
subunits, maar ze transcriberen verschillende categorieën van genen:




RNA pol II VS bacterieel RNA pol, er zijn een paar belangrijke verschillen tussen het functioneren van
het bacteriële en eukaryote enzym:
1. Bacterieel RNA polymerase heeft maar 1 transcriptie-initiatie factor (σ) nodig om transcriptie
te initiëren, terwijl eukaryoot RNA pol veel meer factoren nodig heeft die samen de general
transcription factors genoemd worden.
2. Eukaryote transcriptie initiatie moet plaatsvinden op DNA dat verpakt zit in nucleosomen en
hogere orde vormen van de chromatine structuur. Dit heb je niet bij bacteriën.

Los beneficios de comprar resúmenes en Stuvia estan en línea:

Garantiza la calidad de los comentarios

Garantiza la calidad de los comentarios

Compradores de Stuvia evaluaron más de 700.000 resúmenes. Así estas seguro que compras los mejores documentos!

Compra fácil y rápido

Compra fácil y rápido

Puedes pagar rápidamente y en una vez con iDeal, tarjeta de crédito o con tu crédito de Stuvia. Sin tener que hacerte miembro.

Enfócate en lo más importante

Enfócate en lo más importante

Tus compañeros escriben los resúmenes. Por eso tienes la seguridad que tienes un resumen actual y confiable. Así llegas a la conclusión rapidamente!

Preguntas frecuentes

What do I get when I buy this document?

You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.

100% de satisfacción garantizada: ¿Cómo funciona?

Nuestra garantía de satisfacción le asegura que siempre encontrará un documento de estudio a tu medida. Tu rellenas un formulario y nuestro equipo de atención al cliente se encarga del resto.

Who am I buying this summary from?

Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller brittheijmans. Stuvia facilitates payment to the seller.

Will I be stuck with a subscription?

No, you only buy this summary for 3,49 €. You're not tied to anything after your purchase.

Can Stuvia be trusted?

4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)

45,681 summaries were sold in the last 30 days

Founded in 2010, the go-to place to buy summaries for 15 years now

Empieza a vender

Vistos recientemente

Resumen ·

(2)

Samenvatting filosofie

Resumen ·

(0)

De dekolonisatie

Notas de lectura ·

(0)

Apuntes Mates II

Notas de lectura ·

(0)

APUNTES Y EXAMEN

Resumen ·

(1)

fysiologie zwangerschap

3,49 €  1x  vendido
  • (3)
Añadir al carrito
Añadido