Dit zijn uitgebreide aantekeningen met plaatjes die zorgen voor verduidelijking van de onderwerpen. Universiteit utrecht, jaar 1 biologie, vak: PMO.
Deze aantekeningen van de kennisclips bevatten de volgende onderwerpen: RNA polymerase, σ factoren in E. coli, regulatie eiwitten, negatieve en po...
Kennisclips Regulatie
• Er vindt regulatie plaats op transcriptie, translatie en eiwit niveau → dit geldt voor alle
organismen
Prokaryoot vs eukaryoot
• Prokaryoten hebben een operon structuur (meerdere genen die afgeschreven worden vanaf een
enkele promotor → polycistronisch) en kunnen ook monocistronisch zijn
• Bij eukaryoten wordt er grotendeels maar 1 gen afgeschreven per promotor (monocistronisch)
• In prokaryoten is translatie en transcriptie gekoppeld
• Eukaryoten kunnen mRNA processen; introns, splicing, capping, transport vanuit de kern
RNA polymerase
• Bacteria heeft 1 soort van 5 subunits
• Archaea heeft 1 soort van 11-13 subunits
• Eukaryoten hebben 3 soorten van 12 of meer subunits
• Archaea en eukarya herkennen de TATA box en hebben een transcriptie factor nodig
RNA polymerase; bacteria
• Holoenzyme (gehele enzym) bestaat uit 4 subunits: β β’, α, ω, σ
• Geen algemene transcriptie factoren nodig
• σ factor is betrokken bij de promotor herkenning
(daarna kan de rest binden)
• Core enzyme: β β’, α, ω is betrokken bij de elongatie
→ Terwijl het RNA nog wordt afgeschreven wordt het
al afgelezen door ribosomen
• De σ factor herkent 2 sequenties waarvan één 35
nucleotiden (Consensus → TTGACA) en de ander
10 nucleotiden (Pribnow box → TATAAT) van de
transcriptie start
• Na het herkennen bindt het holoenzyme aan de
promotor waardoor de transcriptie kan beginnen
• De σ factor laat los en het core enzym gaat verder
met de transcriptie en maakt mRNA tot het bij de
transcriptiestop komt
Alternatieve σ factoren in E. coli
• σ 70: algemene σ factor waar de meeste promotors door herkend worden; transcriptie van
huishoud genen
• Er worden ook andere alternatieve σ factoren gemaakt onder bepaalde condities, die dan
ingeschakeld worden → deze concurreren met σ 70 waarbij ze binden aan de rest van RNA
polymerase en een andere set van promotors aanzetten die betrokken zijn bij de situatie
• Herkennen van andere sequenties
, DNA-bindende regulatie eiwitten
• Door te binden aan promotors in het DNA, de transcriptie blokkeren of laten verlopen
• Herkennen een speciale sequentie en vormen meestal dimeren → de sequentie is hierdoor vaak
een inverted repeat
• DNA sequenties zijn vaak inverted repeats
• In bacteriën is er vaak een helix-turn-helix motief (e.g. in het LacI repressor); bestaat uit een
helix die de sequentie in het DNA herkent, er aan bindt en de gen expressie reguleren, en een
helix die het motief stabiliseert
Positieve en negatieve regulatie
• Positieve regulatie:
- Is een activator die transcriptie mogelijk maakt → zonder activator geen transcriptie
- De activator reageert op een signaal (de effector) die de activator reguleert
- Activator bindt aan acitvator-binding site en transcriptie kan plaatsvinden
• Negatieve regulatie
- Is een repressor die de transcriptie blokkeert → als de repressor uitgeschakeld is, is er
transcriptie
- De repressor bindt aan een bepaalde sequentie → de operator
- Effector reguleert de repressor
- Repressie en inductie
Rood = Activator-binding site Geel = Operator
• Het LacI gen zorgt voor de transcriptie van de repressor
Les avantages d'acheter des résumés chez Stuvia:
Qualité garantie par les avis des clients
Les clients de Stuvia ont évalués plus de 700 000 résumés. C'est comme ça que vous savez que vous achetez les meilleurs documents.
L’achat facile et rapide
Vous pouvez payer rapidement avec iDeal, carte de crédit ou Stuvia-crédit pour les résumés. Il n'y a pas d'adhésion nécessaire.
Focus sur l’essentiel
Vos camarades écrivent eux-mêmes les notes d’étude, c’est pourquoi les documents sont toujours fiables et à jour. Cela garantit que vous arrivez rapidement au coeur du matériel.
Foire aux questions
Qu'est-ce que j'obtiens en achetant ce document ?
Vous obtenez un PDF, disponible immédiatement après votre achat. Le document acheté est accessible à tout moment, n'importe où et indéfiniment via votre profil.
Garantie de remboursement : comment ça marche ?
Notre garantie de satisfaction garantit que vous trouverez toujours un document d'étude qui vous convient. Vous remplissez un formulaire et notre équipe du service client s'occupe du reste.
Auprès de qui est-ce que j'achète ce résumé ?
Stuvia est une place de marché. Alors, vous n'achetez donc pas ce document chez nous, mais auprès du vendeur guillaine2000. Stuvia facilite les paiements au vendeur.
Est-ce que j'aurai un abonnement?
Non, vous n'achetez ce résumé que pour €2,99. Vous n'êtes lié à rien après votre achat.
