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samenvatting celmobi: Hoofdstuk 20: Genregulatie eukaryoten e.a.
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- Universiteit Gent (UGent)
samenvatting celmobi: Hoofdstuk 20: Genregulatie eukaryoten e.a.
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Hoofdstuk 20: Genregulatie eukaryotene.a.
• Controle van transcriptie-initiatie:
→ Transcriptiefactoren
▪ RNA-polymerase: algemene transcriptiefactoren1 nodig voor binding op promotor
▪ Promotor: verschillende modules2 waarop overeenkomstige eiwitten binden
▪ Enhancers3: (verschillende modules) verhogen basale
⤷ Soms weefselspecifiek of induceerbaar: expressie in bepaalde cellen of conditie
▪ Herkennen en binden met regulatorische sequenties
⤷ DNA-bindend domein + activatordomein (dat hebben repressors niet)
▪ Activeren transcriptie vanop afstand d.m.v. lusvorming v/h tussenliggend DNA
⤷ Activator-domein: rechtstreeks contact met polymerase/algemene factoren
▪ Vooral activatoreiwitten (prokaryoten vooral repressor): repressie heeft andere vorm
▪ Essentiële rol chromatine: compacte chromatine kan niet afgeschreven worden
→ Steroïdhormonen: klein, lipofiel → kunnen door celmembraan
▪ Binden op receptor (in cytoplasma) => complex naar kern
▪ Bindt op HRE4-sequenties van verschillende genen → activatie genen
→ Proteïnehormonen: groot → niet door celmembraan → membraanreceptoren op cel
▪ Signaalmoleculen (hormoon) binden op receptoren → fosforylatie-cascade
▪ Signaalmolecule → activatie transcriptiefactor → genen aangeschakeld
→ Regulatie tijdens ontwikkeling: tijdens embryonale ontwikkeling genen aan en uit
▪ Differentiatie door ongelijke verdeling eiwitten in bevruchte eicel
⤷ Polarisatie eicel
▪ Genen coderen voor DNA-bindende eiwitten→ cascade van genregulatie (irreversibel)
▪ Bepaald celtype (eenmaal groep genen is uitgeschakeld: geen weg terug)
▪ Homeotische(hox) genen: coderen transcriptiefactoren die segmentidentiteit bepalen
⤷ Mutaties zorgen voor lichaamsdelen op de verkeerde plaats
→ Veel dieren hebben die genen in geconserveerde 60 AZ-box: homeobox die de
overeenkomstige enhancer bindt
→ Bij planten zitten die genen in de MADS-box-familie
• DNA-herschikkingen: (geen splicing) bepaalt welke genen tot expressie zullen komen
→ Antilichamen: door B-cellen bij vertebraten
▪ Constant deel C: stabilisatie (bevat genen voor constante gebieden)
▪ Variabel deel V: kan verschillende antigenen binden (bevat dus genen die kunnen
dienen voor V v/h finale antilichaam
▪ B-cel: brengt C + specifieke V via variabele junctie J + diversity domein D tot expressie
→ Door DNA-herschikkingen: specifieke enzymen knippen willekeurig J en C uit
→ Promotor van V komt dichtst bij enhancer tussen J en C te liggen: geactiveerd
• Posttranscriptionele regulatie:
1
Binden op TATA-box
2
Die elk op zich niet noodzakelijk zijn
3
Regulatorische sequenties die in beide richtingen en vanop grote afstand transcriptie-initiatie beïnvloeden
d.m.v. eiwitfactoren die op die sequenties binden (silencers ook)
4
Hormone responsive elements
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