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samenvatting celmobi: Hoofdstuk 18: Translatie
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- Universiteit Gent (UGent)
samenvatting celmobi: Hoofdstuk 18: Translatie
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Hoofdstuk 18: Translatie• Eiwitten: katalyse, reguleren genexpressie, opbouw celmembranen,… veel functies
→ Polymeren van aminozuren:
▪ H-atoom
▪ Carboxylgroep: COO-
▪ Aminogroep: NH3+
▪ R-groep, verschilt n.g.v. AZ
→ 20 verschillende AZ (complex en minder complex, polair apolair, neutraal, ⊕, ⊝)
→ Gebonden met peptidebinding: condensatie tussen COO- en NH3+ (H2O vorming)
→ 2 uiteinden verschillend: NH2 - of N-terminus en COOH- - of C-terminus
→ 4 structuurniveaus:
▪ Primair: AZ-sequentie
▪ Secundair: H-bruggen tussen COOH- en NH2-groepen => α- en β-sheet
▪ Tertiair: 3D-vorm van 1 polypeptide → vb. disulfidebrug voor verdere opvouwing
▪ Quaternair: Interacties tussen polypeptiden → multieenheidstructuur
→ Volgorde AZ door nucleotidensequentie in mRNA
• Triplet van nucleotiden codeert voor 1 specifiek AZ
→ Ondubbelzinnig
→ Degeneratie: meerdere codons voor 1 AZ
→ Start- en stopcodons: AUG voor methionine (start), soms GUG, UAA, UAG, UGA (stop)
→ Niet overlappend, geen interne punctuatie, per 3 afgelezen van start tot stop
→ Universeel: nagenoeg maar niet helemaal:
▪ Menselijke mitochondriën: UAG (normaal stop) voor tryptofaan, AGG nu stop
▪ Protozoa bezitten andere terminatiecodons
▪ Bepaalde menselijke genen: UAG codeert ongewoon AZ (selenocysteïne)
• Universaliteit => DNA en RNA van 1 organisme naar een ander kan zonder verandering info
⤷ Soms verschillen in codongebruik => best toch genen aanpassen
• Ribosomen sturen eiwitbiosynthese, mRNA draagt info, andere specifieke eiwitfactoren,
tRNA en tRNA-koppelingsenzymen voor eiwitsynthese
• tRNA: brengen AZ aan
→ Heeft voor elk codon een complementair anticodon => basenparing
→ Iso-accepting tRNAs: kunnen met zelfde AZ binden maar geproduceerd door ander gen
→ 1 tRNA kan verschillende codons herkennen door wobble: specifieke uitzonderingen
toegelaten op wobble-positie
→ Sommige verschillende tRNAs herkennen zelfde codon via zelfde anticodon (vb. bij AUG)
→ Aminoacylatie: covalente binding met specifiek AZ door aminoacyl-tRNA-synthetasen1
• Translatie in prokaryoten
→ Initiatie:
▪ Vasthechting 30S-ribosoom sub-eenheid op mRNA op ribosoombindingssite2 (RBS)
▪ Tijdelijke baseparing tussen 30S-ribosoomsubeenheid en mRNA (complementair)
▪ Migratie van 30S-subeenheid naar startcodon → begin translatie3
1
Activeren elke 1 bepaald AZ via koppeling aan ATP en maken covalente binding tussen COO -en 2’ of 3’OH op
eerste nucleotide van de acceptorarm v/h overeenkomstige tRNA
2
-10 van startcodon, Shine Dalgarno sequentie: 5’ AGGAGGU 3’
3
Na vorming van initiatiecomplex
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