Garantie de satisfaction à 100% Disponible immédiatement après paiement En ligne et en PDF Tu n'es attaché à rien
logo-home
Recherché précédemment par vous
Recherché précédemment par vous
logo
Samenvatting Genetica - VUB €9,99
Ajouter au panier
Accédez rapidement à
Aperçu
  2.  
  3. Vrije Universiteit Brussel (VUB)
  4.  
  5. Biologie
  6.  
  7. Genetica (000354)

Resume

Samenvatting Genetica - VUB

3 revues
 13 fois vendu

Dit document omvat een samenvatting van de hoorcolleges van het vak Genetica, gegeven door prof. Luc Leyns op de VUB. Ik had met deze samenvatting 17/20.

Dernier document publié: 3 année de cela

Aperçu 6 sur 73  pages

Infos sur le Document

  • Non
  • /
  • 27 décembre 2021
  • 15 janvier 2022
  • 73
  • 2021/2022
  • Resume

Sujets

Livre connecté

book image

Titre de l’ouvrage:

Auteur(s):

  • Édition:
  • ISBN:
  • Édition:

Plus de résumés pour

Tout pour ce livre (156)

École, étude et sujet

Tous les documents sur ce sujet (3)

3  revues

review-writer-avatar

Par: estebanidrissboutahar • 3 mois de cela

review-writer-avatar

Par: timdirven • 2 mois de cela

review-writer-avatar

Par: louwyeamber • 1 année de cela

reply-writer-avatar

Par: lunawillems1 • 1 année de cela

Traduit par Google

Hi, could you explain this review more? Thanks!

reply-writer-avatar

Par: louwyeamber • 1 année de cela

Hi! Sorry, was an accident! I edited my review. :)

Vendeur

avatar-seller
lunawillems1

Avis reçus

Aperçu du contenu

INTRODUCTION TO THE CELL
H0: CELLS AND GENOMES
The Universal Features of Cells on Earth
a. Alle cellen stockeren hun erfelijk materiaal in DNA
- Structuur DNA → hoofdstuk 1
- DNA replicatie: steeds opnieuw synthetiseren
- DNA → RNA → proteïne: transcriptie + translatie
b. Alle cellen gebruiken proteïnes als katalysatoren (enzymen)
- Bv. een polysaccharideketen dmv een lysozym breken
c. Alle cellen vertalen RNA naar proteïnen op dezelfde manier
- Bv. het tRNA-molecule met een specifiek anticodon dat op mRNA zal binden → aminozuurketen maken
d. Eén gen codeert meestal voor één eiwit
e. Een levende cel kan met minder dan 500 genen bestaan


The diversity of genomes and the tree of life
Grootste biochemische diversiteit = binnen de prokaryoten
- Verschillende vormen cellen: spiraal, ovaal (bv. E. coli), mini, sferisch…
- Bacteria & Archaea
- Meestal 1000-6000 genen
- Algemene opbouw:




Tree of life en Evolutie
- 3 grote takken
 Bacteria
 Archaea
 Eukaryota
- Meer dan 200 genenfamilies
- Sommige genen evolueren heel snel, anderen zijn erg geconserveerd
- Nieuwe genen zijn gegenereerd uit al eerder bestaande genen
 Intragenetische mutatie
 Genduplicatie
o Zorgen voor families van verwante genen binnen een cel
 DNA segment shuffling
 Horizontale transfer (genetisch materiaal uitwisselen zonder dat er een familierelatie is)
- Termen
 Homoloog: genen die gelijk zijn omdat ze dezelfde voorouder hebben
 Ortholoog: twee genen in twee verschillende soorten dat dezelfde voorouder hebben (na soortvorming)
 Paraloog: twee genen dat het resultaat zijn van genduplicatie




1 Luna Willems – Biologie – VUB 2021 - 2022

,Genetic Information in Eukaryotes
- Kern heeft dubbel membraan!
- Evolutie vanuit symbiose
 Ancestrale eukaryotische cel nam 2 keer een bacterie op →
°symbiose
 werd…
o Mitochondria met dubbel membraan → eigen DNA!
o Of chloroplast met dubbel membraan → eigen DNA!
- Hybride genoom
 Stuk van vader en moeder
- Gigantisch genoom
 108 tot 1012 baseparen per haploid genoom
- Veel regulatorisch DNA
 Zorgt ervoor dat de expressie van specifieke genen in een organisme kunnen verhogen/verlagen
 Essentieel!
- Multicellulair
- Protisten: eukaryoten die als eencellige leven
- Expressie levels van genen van een organisme kunnen gemonitord worden
- Belangrijke modellen
 Gistcellen, Aradopsis, C. elegans, Drosophila, muis
- Genoom van vertebraten:
 Ontstaan door genduplicaties

BASIC GENETIC MECHANISMS
H1: DNA, CHROMOSOMES AND GENOMES
- Celdeling: DNA splitsen onder de vorm van chromosomen
- DNA stijgt lineair met het verdubbelen van cellen tijdens de embryonale ontwikkeling

Experiment: DNA is drager van genetische informatie
Kolom 1: muizen werden geïnfecteerd met dodelijke smooth pneumonia
(bacterie). Door een mutatie wordt de pneumonia ruw en niet dodelijk.
Deze worden terug getransformeerd naar smooth. Deze zijn terug
dodelijk.

Conclusie: stoffen die in de S zaten kunnen de R
veranderen(/transformeren) in S, dus deze verandering wordt overgeërfd

Kolom 2: S cellen werden gefractioneerd tot RNA, DNA, lipiden… Na een
transformatietest: enkel in DNA blijven het S cellen

Conclusie: DNA is de drager van genetische info

The structure and function of DNA
Dubbele helix DNA (Crick & Watson)
- Suikerfosfaatruggengraat + basenparen
 Nucleotide = stukje suikerfosfaat + een base
o Purines = A en G
o Pyrimidine = T, C en U
- Anti-parallelle complementaire strengen
 5’ → 3’ en 3’ → 5’
- Enzym leest altijd 5’ → 3’Waterstofbruggen tussen beiden strands
 2 tussen adenine en thymine
 3 tussen cytosine en guanine
- Template van parentaal DNA zorgt voor polymerisatie van nieuwe strand
- Major & minor groove → °helix (breedte = 2 nm)
 Om de 0,34 nanometer een turn
2 Luna Willems – Biologie – VUB 2021 - 2022

,In eukaryoten: DNA is omsloten door celkern
- DNA zit in celkern (groot organel met membranen)
 Behalve mitochondriaal en van chloroplasten
 Behalve tijdens celdeling

Samenvatting
- DNA (= lineaire sequentie van nulceotides) is de drager van genetisch materiaal
- Elke DNA-molecule = een dubbele helix van twee complementaire strands van nucleotiden, die samen wordt
gehouden door waterstofbruggen
- Duplicatie van genetisch materiaal gebeurt door 1 strand van parentaal DNA te gebruiken als template
- Genetische materiaal is tezamen “het genoom” en omvat de instructies om proteïnen te synthetiseren in een
organisme
- In eukaryoten: DNA zit (over het algemeen) in de celkern


Chromosomal DNA and its Packaging in the Chromatin Fiber
- DNA komt tezamen met eiwitten opgerold voor (≠ idee van Watson&Crick)

Eukaryotisch DNA is ingepakt in chromosomen
- Mens: 22 chromosomen + X en Y
- Bv twee verwante soorten kunnen ander aantal chromosomen hebben
- Chromosomen bevatten lange reeksen genen
 Elke regio codeert voor iets anders
 Ook regio’s zonder coderende activiteit
- Goed te zien in metafase
- Mogelijke afwijkingen: trisomie, translocatie, inversies…




Statistieken voor genoom mens
- 3,2 * 109 basenparen
- 25 000 genen
- 3,5% hoog geconserveerd
 Evolutionair: chromosomen vergelijken met andere dieren
- 15% van genoom = coderende regio’s
- 50% genoom is hoog repetitief
 Andere 50% unieke sequenties met bv regulatorische regio’s
- Intronen en exonen

Chromosomen: verschillende stadia
- Doorheen celcyclus: veschillende vormen waarin chromsomen voorkomen
 Meestal gecondenseerd als chromatinedraden
 Tijdens mitose goed zichtbaar in typische vorm (metafase)




Langs rand minder
gedeeltelijk gecondenseerd
met wat eiwitten
3 Luna Willems – Biologie – VUB 2021 - 2022

,Opbouw chromosoom
- Twee zusterchromatiden
- Centromeer: plaats waar microtubuli aan hechten
- Twee telomeren: langs uiteinden
- Meerdere origins of replication: plaats waar polymerase replicatie start

- Prokaryoten: circulair DNA → geen centromeren en telomeren


Packaging
1. DNA
2. Nucleosomen
- + 140 basenparen opgerold rond octameer van histonen (eiwit)
- 1 nucleosoom = 11 nanometer lang




3. Chromatindedraden
- Opgerolde nucleosomen
- + 30 nm lang
- = natuurlijke vorm waarin DNA voorkomt




4. Chromosoom


Histonen
- < H2A, H2B, H3, H4
- Elke histoon heeft een N-staart → belangrijk is bij functionaliteit van DNA bij transcriptie
- H3-H4 vormt een tetrameer
- H2A-H2B vormt een dimeer
- Roos errond = DNA
- Dynamisch
 Bv. AA, TT en TA dinulceotides zijn als minor groove langs binnenkant geprefereerd en
G-C als minor groove langs buitenkant geprefereerd
 Af en toe opent het een beetje
o Interactie met eiwitten mogelijk maken




- Chaperonen: extra eiwitten die kunnen (ont)binden van de histonen
 in samenwerking met chromatine remodeling complex (groen)
kan opbouw van histonen veranderd worden of helemaal
veranderen door iets anders

- Histone H1: zit niet in kern
 Trigger voor apoptose




4 Luna Willems – Biologie – VUB 2021 - 2022

,Samenvatting
- Een gen is een nucleotide sequentie in een DNA molecule dat een functionele unit is voor de productie van een
proteine, structureel RNA of een katalytische/regulatorische RNA molecule
- In eukaryoten: genen die proteïnen coderen bestaan gewoonlijk uit een reeks van intronen en exonen,
geassoscieerd met regulatorische regio’s van DNA
- Chromosoom < DNA-molecule met een grote hoeveelheid genen
- Mensengenoom: 3,2 *109 basenparen ; 22 chromosomen en X en Y
- Slechts een klein deel is coderend
- Chromosomaal DNA: centromeer, telomeren, origins of replication
- DNA is in eukaryoten strak gebonden rond histonen dat per acht een nucleosoom vormen
- Nucleosomen zijn verder opgerold tot chromatinevezels
- Structuur van chromatine moet dynamisch zijn zodat DNA kan interageren met omgeving
 Spontaan of door ATP (zoals remodeling complexes)
- De remodeling complexen werken samen met chaperonen zodat nucleosomen herpositioneerd, opnieuw
opgebouwd, of verwijderd kunnen worden

The Regulation of Chromatine Structure
Histonen bepalen densiteit van packaging
- Euchromatine: los → genuitdrukking mogelijk
- Heterochromatine: gecondenseerd → geen genuitdrukking

Epigenetica
= modificaties die niet erfelijk zijn, maar die wel doorgegeven kunnen worden tijdens de celdeling van geslachtscellen

- Bv. veranderingen in chromatine worden doorgegeven aan dochtercellen




Heterochromatine
- Hoog georganiseerd
- Gecondenseerd
- Resistent tegen genexpressie
- In embryonale ontwikkeling: eerst heterochromatine dat zich verspreidt in
euchromatine
- Drosophila
 White gen zorgt voor regulatie van rood pigment in ogen
 Er is een barrière naast het heterochromatine
 Door een chromosoom inversie kwam dit gen naast een
heterochromatine te liggen en verplaatste de barrière zich
 Het White gen wordt daardoor minder uitgedrukt
 Rode ogen met witte vlekken

Histonen staart: mogelijke covalente modificaties
- Methylatie
- Acetylatie
- Fosforylatie
- Ubiquinatie = reeks aminozuren




5 Luna Willems – Biologie – VUB 2021 - 2022

, - Enkele mogelijkheden
 Methylatie op K9 (locatie)→ °heterochromatine + genuitschakeling (gene silencing)
 Methylatie + acetylatie → genexpressie
 Fosforlyatie + acetylatie → genexpressie
 Methyatie op K27 → Hox genen uitschakelen + X-chromosoom uitschakelen



Extra variatie via site-specifieke invoeging van kleine sets histone varianten
- Naast de standaard histonen bestaan er nog varianten die in mindere mate voorkomen
- Varianten op H3
 Bv. CENP-A: functie op centromeer en assemblage kinetochores
- Varianten op H2A
 Bv. macroH2A: transcriptionele repressie en inactiveren van X-chromosoom
o Bij vrouwen is 1 vd 2 X-chr altijd inactief



Complex van reader en writer proteïnen
- Kunnen zorgen voor specifieke chromatine modificaties
- Code-reader complex: bv. histonen hebben een covalente modificatie
ondergaan
 Reader complex herkent het en bindt erop vast
 Andere componenten worden ook aangetrokken en binden mee
 Leidt tot: genexpressie, genuitschakeling…
- Reader-writercomplex
 Writer = enzym dat voor een bepaalde modificatie zorgt op een
nucleosoom
 Reader = bindt op die histone modificatie
 Meerdere repeats, adhv ATP
 °een golf van chromatine condensatie




Barrière DNA sequenties blokkeren Reader-Writer complexen
- Zorgt ervoor dat chromatine domeinen van elkaar afgescheiden worden
- Bv. dat ene kant gecondenseerd is door reader-writer en vanaf een barrière proteïne niet meer




Chromatine in centromeren
- Toont dat histone varianten speciale structuren kunnen vormen




6 Luna Willems – Biologie – VUB 2021 - 2022

Les avantages d'acheter des résumés chez Stuvia:

Qualité garantie par les avis des clients

Qualité garantie par les avis des clients

Les clients de Stuvia ont évalués plus de 700 000 résumés. C'est comme ça que vous savez que vous achetez les meilleurs documents.

L’achat facile et rapide

L’achat facile et rapide

Vous pouvez payer rapidement avec iDeal, carte de crédit ou Stuvia-crédit pour les résumés. Il n'y a pas d'adhésion nécessaire.

Focus sur l’essentiel

Focus sur l’essentiel

Vos camarades écrivent eux-mêmes les notes d’étude, c’est pourquoi les documents sont toujours fiables et à jour. Cela garantit que vous arrivez rapidement au coeur du matériel.

Foire aux questions

Qu'est-ce que j'obtiens en achetant ce document ?

Vous obtenez un PDF, disponible immédiatement après votre achat. Le document acheté est accessible à tout moment, n'importe où et indéfiniment via votre profil.

Garantie de remboursement : comment ça marche ?

Notre garantie de satisfaction garantit que vous trouverez toujours un document d'étude qui vous convient. Vous remplissez un formulaire et notre équipe du service client s'occupe du reste.

Auprès de qui est-ce que j'achète ce résumé ?

Stuvia est une place de marché. Alors, vous n'achetez donc pas ce document chez nous, mais auprès du vendeur lunawillems1. Stuvia facilite les paiements au vendeur.

Est-ce que j'aurai un abonnement?

Non, vous n'achetez ce résumé que pour €9,99. Vous n'êtes lié à rien après votre achat.

Peut-on faire confiance à Stuvia ?

4.6 étoiles sur Google & Trustpilot (+1000 avis)

68175 résumés ont été vendus ces 30 derniers jours

Fondée en 2010, la référence pour acheter des résumés depuis déjà 15 ans

Commencez à vendre!
€9,99  13x  vendu
  • (3)
Ajouter au panier
Ajouté