Garantie de satisfaction à 100% Disponible immédiatement après paiement En ligne et en PDF Tu n'es attaché à rien
logo-home
Recherché précédemment par vous
Recherché précédemment par vous
logo
Practical 2: Advanced Data Analysis: full summary + explanations €5,49
Ajouter au panier
Accédez rapidement à
Aperçu
  2.  
  3. Universiteit Antwerpen (UA)
  4.  
  5. Biomedische Wetenschappen
  6.  
  7. Advanced Data Analysis (2052FBDBMW)

Resume

Practical 2: Advanced Data Analysis: full summary + explanations
 86 vues  9 fois vendu

A detailed description of each step of practical 2, including screenshots and explanations of the steps taken in R. This document includes everything that is seen in class, and all the exercises that are needed to be made for practical 2 of Advanced Data Analysis of the first master of Biomedical S...

[Montrer plus]

Aperçu 1 sur 21  pages

Infos sur le Document

  • 19 mars 2022
  • 21
  • 2021/2022
  • Resume

Sujets

École, étude et sujet

Tous les documents sur ce sujet (19)

Vendeur

avatar-seller
Bi0med

Avis reçus

Aperçu du contenu

Practical 2 : Statistical analysis is R
Before you start :
- Create a folder / directory on your PC where you put all files related to this practical
- Turn this folder into your working directory

setwd ( "C:/wherever your files are")



1. Demo : the independent sample t-test

Data in long format : ozoneLong.txt
Read in the dataset ozoneLong.txt. This small dataset contains measurements of ozone (O3) in
two gardens, labelled A and B.




White format: concentrations in the gardens in two separate columns: no paired data. Independent
observations.

In the long format, there is the same data but arranged differently: one column which tells you which
garden and one column which gives the value of the ozone.

Here we want to know if there is a difference in ozone concentrations between the 2 gardens. The
null hypothesis is there is no difference in ozone between the gardens.

- Parametric tests: e.g. T-test
o Only allowed if you have enough observations and the data has +- a normal
distribution
- If the conditions for parametric testing are not fulfilled, you do Mann-Withney U test

Use the formula interface: t.test(continuantVar~groupingVar,data=myData)

Comes back quite often: this is usually the first argument of some function about a statistical test.
Generally it is y~x with y being the dependent variable (in t.test= continuous variable, here ozone),
and x that defines the groups (which group an observation comes from). The third argument is the
data frame.

First explore the data :
- How are the data organized? Check the environment in RStudio, or the str() function.
What do the two variables mean?
- Generate a plot to visualize the ozone concentration in the two gardens

Plot(myData$garden,myData$ozone)
Gives automatically a boxplot.
Looks like the ozone concentrations are higher in garden B than in garden A.




1

Les avantages d'acheter des résumés chez Stuvia:

Qualité garantie par les avis des clients

Qualité garantie par les avis des clients

Les clients de Stuvia ont évalués plus de 700 000 résumés. C'est comme ça que vous savez que vous achetez les meilleurs documents.

L’achat facile et rapide

L’achat facile et rapide

Vous pouvez payer rapidement avec iDeal, carte de crédit ou Stuvia-crédit pour les résumés. Il n'y a pas d'adhésion nécessaire.

Focus sur l’essentiel

Focus sur l’essentiel

Vos camarades écrivent eux-mêmes les notes d’étude, c’est pourquoi les documents sont toujours fiables et à jour. Cela garantit que vous arrivez rapidement au coeur du matériel.

Foire aux questions

Qu'est-ce que j'obtiens en achetant ce document ?

Vous obtenez un PDF, disponible immédiatement après votre achat. Le document acheté est accessible à tout moment, n'importe où et indéfiniment via votre profil.

Garantie de remboursement : comment ça marche ?

Notre garantie de satisfaction garantit que vous trouverez toujours un document d'étude qui vous convient. Vous remplissez un formulaire et notre équipe du service client s'occupe du reste.

Auprès de qui est-ce que j'achète ce résumé ?

Stuvia est une place de marché. Alors, vous n'achetez donc pas ce document chez nous, mais auprès du vendeur Bi0med. Stuvia facilite les paiements au vendeur.

Est-ce que j'aurai un abonnement?

Non, vous n'achetez ce résumé que pour €5,49. Vous n'êtes lié à rien après votre achat.

Peut-on faire confiance à Stuvia ?

4.6 étoiles sur Google & Trustpilot (+1000 avis)

56326 résumés ont été vendus ces 30 derniers jours

Fondée en 2010, la référence pour acheter des résumés depuis déjà 14 ans

Commencez à vendre!
€5,49  9x  vendu
  • (0)
Ajouter au panier
Ajouté