Samenvatting op basis van mijn notities, de slides en het boek. Achteraan zijn er een aantal oefenvragen terug te vinden die al dan niet op Sofia staan. Voor de richtingen Biomedische Wetenschappen en Tandheelkunde, deze behandelen dezelfde leerstof. :))
- Bepaalt functie, bv. Porine heeft gaten, vormt poriën van membraan
- Kan verstoord worden bij mutaties ⇒ basis voor ziekten
- Peptide= kort polymeer van aminozuren
● Binding carboxylgroep + aminogroep (gebonden aan H2O) =
polypetpideruggengraad
○ Hebben allerlei uitsteeksels door zijketens ⇒ bepalen eigenschappen eiwit
● Van vele eiwitten weet men functie nog niet
○ Voorspelling proberen te maken door primaire structuur te vergelijken met de
sequentie van alle andere eiwitten in de proteïnedatabase
■ Men kan hier hypothetisch een functie op plakken ⇒ moet
experimenteel nagegaan worden
● Structuren evolueren mee met organisme
○ Levensnoodzakelijke structuren muteren niet
○ Mutatie kan voordelig en nadelig zijn
○ Wordt nagegaan met cytochroom c
■ Men kan hiermee zien welke kleine variaties er zijn opgetreden ⇒
nieuwe stambomen opstellen op een manier die vroeger niet mogelijk
was
1
,Secundaire structuur
● Lokale conformatie van een deel vh eiwit
● Peptidebinding = vlakke structuur
○ Elektronen worden verdeeld over C-O en C-N
■ Ontstaan van partieel planaire binding
■ Vorm binding bevindt zich tussen 2 vormen door resonantie tussen 2
structuren de even stabiel zijn, partieel dubbelbindingskarakter
■ Geen rotatie mogelijk om C-N (op afbeelding aangeduid met *)
● Torsiehoeken
○ Bindingshoeken van Calpha , aangeduid in roze op structuur
○ Hier is wel rotatie mogelijk
○ Meest uitgerokken conformaties is phi = 180° en psi = 180°, zijn
oorspronkelijke hoeken
○ Niet alle verschillende combinaties van torsiehoeken zijn mogelijk:
■ Van der Waals-krachten
■ R-groepen
2
, ● ‘Welke torsiehoekencombinatie is mogelijk met R-groepen in gedachte?’
○ Prof. Ramachandran maakte diagram
■ Afstanden tussen alle atomen van een tripeptide te berekenen bij elke
waarde van phi en psi
■ Alles wat blauw is kan
● Donkerblauw ⇒ geen sterische hinder
● Middenblauw ⇒ uiterste limiet wat er toegelaten is
● Lichtblauw ⇒ enkel toegelaten wanneer flexibiliteit is in
bindingshoeken
■ Alles wat grijs is kan niet ⇒ hier overlappen de VdW-radii
Dit laat toe om structuren die gevonden zijn met de computer te toetsen
- Men kan zo juiste structuren vinden + ruimtelijk te zien krijgen
Alfa-helix
● Eenvoudigste structuur die polypeptideketen kan aannemen
○ Polypeptideruggengraat helicoïdaal naar rechts gewonden rondom
denkbeeldige as
○ R-groepen AZ steken naar buiten
○ Psi van -45° tot -50°
○ Phi van -60°
● Optimaal gebruik van interne H-bruggen
○ Stabilisatie door H-brug tussen positieve N van een peptidebinding en een
negatieve O van een ander peptidebinding 4 AZ verder richting de N-terminus
⇒ dit doen alle peptidebindingen, behalve de uiteinden
3
Les avantages d'acheter des résumés chez Stuvia:
Qualité garantie par les avis des clients
Les clients de Stuvia ont évalués plus de 700 000 résumés. C'est comme ça que vous savez que vous achetez les meilleurs documents.
L’achat facile et rapide
Vous pouvez payer rapidement avec iDeal, carte de crédit ou Stuvia-crédit pour les résumés. Il n'y a pas d'adhésion nécessaire.
Focus sur l’essentiel
Vos camarades écrivent eux-mêmes les notes d’étude, c’est pourquoi les documents sont toujours fiables et à jour. Cela garantit que vous arrivez rapidement au coeur du matériel.
Foire aux questions
Qu'est-ce que j'obtiens en achetant ce document ?
Vous obtenez un PDF, disponible immédiatement après votre achat. Le document acheté est accessible à tout moment, n'importe où et indéfiniment via votre profil.
Garantie de remboursement : comment ça marche ?
Notre garantie de satisfaction garantit que vous trouverez toujours un document d'étude qui vous convient. Vous remplissez un formulaire et notre équipe du service client s'occupe du reste.
Auprès de qui est-ce que j'achète ce résumé ?
Stuvia est une place de marché. Alors, vous n'achetez donc pas ce document chez nous, mais auprès du vendeur EmilieBMW. Stuvia facilite les paiements au vendeur.
Est-ce que j'aurai un abonnement?
Non, vous n'achetez ce résumé que pour €4,00. Vous n'êtes lié à rien après votre achat.
