Samenvatting op basis van mijn notities, de slides en het boek. Achteraan zijn er een aantal oefenvragen terug te vinden die al dan niet op Sofia staan. Voor de richtingen Biomedische Wetenschappen en Tandheelkunde, deze behandelen dezelfde leerstof. :))
● Carboxylgroep ( -COOH) op c1, hieruit verder nummeren
● Alpha-koolstof waar -coo en aminogroep op staan
Niet polaire, alifatische R-groepen
= structuren die geen aromatische ring bevatten
- Inert
- Niet polair ⇒ hydrofoob = drijvende kracht waar een eiwit opvouwt
- Geen functionele groepen
● Glycine (Gly), (G)
○ Kleinste aminozuur, heeft geen zijketen, enkel H ⇒ grote conformationele
flexibiliteit in eiwitketen
○ Niet-asymmetrisch (enige az)
● Alanine (Ala), (A)
○ Zijketen: CH3
○ In Vitro Mutagenese ⇒ ‘Waar liggen de plekken in het eiwit de
kenmerken/cruciale dingen bepalen?’ = moeilijk te bepalen
■ Men steekt deze kenmerken + DNA in plasmide ⇒ hiervan kan men
codons van veranderen = bepaalde aminozuren veranderen door een
ander
■ ‘Waarom geen glycine gebruiken?’ Omdat deze structuur van eiwit
kan veranderen door flexibiliteit dus daarom op 1 na kleinste
aminozuur gebruiken
● Valine (Val), (V)
○ Restgroep: C3H7
● Leucine (Leu), (L)
○ Restgroep: C4H9
● Methionine (Met), (M)
○ Restgroep: C3H7S
, ● Isoleucine (Ile), (I)
○ Restgroep: C2H5
Ala, Val, Leu, Met en Ile:
- Dragen geen functionele groepen
- Zijketens hebben neiging te clusteren ⇒ stabilisatie eiwit tegen hydrofobe interacties
- Verschillende vormen dragen bij tot vorm eiwit door ruimte-inname
Polaire, niet-geladen R-groepen
= Polair door toevoeging van halogenen in R-groep
● Serine (Ser) (S)
○ Restgroep: CH2OH
○ Vorming van H-bruggen adhv -OH ⇒ structuur en interacties eiwitten
○ Kan gefosforyleerd worden ⇒ functie eiwit, signaaltransductie
○ Polair door -OH
● Cysteïne (Cys) (C)
○ Restgroep: CH2SH
○ SH-groep (sulfhydryl) zorgt voor polariteit
○ Pka ≈ 8, ionisatie op licht alkalische pH
○ In oxidatie 2 cys wordt door disulfidebrug verbonden tot cystine ⇒ dit kan
ook binnen eiwit wat zorgt voor stabiele 3D-structuur
○ Belangrijk binnen katalytisch centra enzymen: de ionisatie van SH zorgt voor
een sterk nucleofiele zwavelgroep = zeer reactief
● Proline (Pro) (P)
○ Restgroep: vormt ringstructuur, C3H6
○ Door ring geen vrije rotatie mogelijk tussen N en C
○ Vormen van bochten in peptideketens ⇒ meer complexiteit
○ Trans-structuur is stabieler, maar cis-structuur verschilt ook niet heel hard ⇒
bij cis ontstaat knik
○ Gematigd polair
● Asparagine (Asn) (N)
○ Restgroep: heeft carbonzuuramidegroep, CH2CONH2
○ Amide van asparaginezuur
○ Via zijketen H doneren/accepteren bij vorming H-bruggen
, ● Glutamine (Gln) (Q)
○ Restgroep: heeft carbonzuuramidegroep, C2H4CONH2
○ Amide van glutaminezuur
○ “
● Histidine (His) (H)
○ Restgroep: vormt ringstructuur =Imidazol ⇒ Pka ≈ 7
○ Bij fysiologische Ph is 50/50 ongeladen/geladen
○ ‘Zwitsers zakmes’ want zowel zeer nucleofiel als elektrofiel
○ Ook populair in katalytische centra door nucleofiele N
Les avantages d'acheter des résumés chez Stuvia:
Qualité garantie par les avis des clients
Les clients de Stuvia ont évalués plus de 700 000 résumés. C'est comme ça que vous savez que vous achetez les meilleurs documents.
L’achat facile et rapide
Vous pouvez payer rapidement avec iDeal, carte de crédit ou Stuvia-crédit pour les résumés. Il n'y a pas d'adhésion nécessaire.
Focus sur l’essentiel
Vos camarades écrivent eux-mêmes les notes d’étude, c’est pourquoi les documents sont toujours fiables et à jour. Cela garantit que vous arrivez rapidement au coeur du matériel.
Foire aux questions
Qu'est-ce que j'obtiens en achetant ce document ?
Vous obtenez un PDF, disponible immédiatement après votre achat. Le document acheté est accessible à tout moment, n'importe où et indéfiniment via votre profil.
Garantie de remboursement : comment ça marche ?
Notre garantie de satisfaction garantit que vous trouverez toujours un document d'étude qui vous convient. Vous remplissez un formulaire et notre équipe du service client s'occupe du reste.
Auprès de qui est-ce que j'achète ce résumé ?
Stuvia est une place de marché. Alors, vous n'achetez donc pas ce document chez nous, mais auprès du vendeur EmilieBMW. Stuvia facilite les paiements au vendeur.
Est-ce que j'aurai un abonnement?
Non, vous n'achetez ce résumé que pour €4,00. Vous n'êtes lié à rien après votre achat.
