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Samenvatting microbiologie

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Samenvatting microbiologie, powerpoints en eigen notities.

Aperçu 8 sur 55  pages

  • 29 août 2022
  • 55
  • 2021/2022
  • Resume
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hannelorekriek
2



Inhoudstafel
Hoofdstuk 1: Inleiding......................................................................................................................................................5
1.1 Werkgebied van de microbiologie.........................................................................................................................5
1.2 Geschiedenis van de microbiologie.......................................................................................................................7
1.2.1 De Oudheid.....................................................................................................................................................7
1.2.2 De “Generatio Spontanea” en de ontdekking van micro-organismen...........................................................7
1.2.3 De microbiologie als wetenschap...................................................................................................................8
1.2.4 De medische microbiologie.............................................................................................................................8
1.2.5 Indeling van de levende wereld volgens (micro)biologen..............................................................................9
Hoofdstuk 2: Celbouw van het organisme.....................................................................................................................10
2.1 Prokaryotische versus eukaryotische micro-organismen....................................................................................10
2.2 De kern.................................................................................................................................................................10
2.2.1 Chemische structuur van DNA......................................................................................................................11
2.2.2 Ruimtelijke structuur van DNA.....................................................................................................................11
2.3 Cytoplasma...........................................................................................................................................................11
2.4 Subcellulaire deeltjes en structuren....................................................................................................................11
2.4.1 Mitochondriën..............................................................................................................................................11
2.4.2 Chloroplasten, chromatoforen en chromoplasten.......................................................................................11
2.4.3 Endoplasmatisch reticulum...........................................................................................................................11
2.4.4 Ribosomen....................................................................................................................................................12
2.4.5 Golgi-apparaat..............................................................................................................................................13
2.4.6 Lysosomen....................................................................................................................................................13
2.4.7 Vacuolen.......................................................................................................................................................13
2.4.8 Korrels...........................................................................................................................................................13
2.5 Cytoplasmatisch membraan................................................................................................................................13
2.6 Celwand................................................................................................................................................................14
2.7 Slijmlaag en kapsel...............................................................................................................................................15
2.7.1 Slijmlaag........................................................................................................................................................15
2.7.2 Kapsel............................................................................................................................................................15
2.8 Flagellen & ciliën en pili & fimbriae.....................................................................................................................15
2.9 Endosporen..........................................................................................................................................................16
Hoofdstuk 3: Morfologie................................................................................................................................................17
3.1 Microscopische hulpmiddelen (enkel slides).......................................................................................................17
3.1.1 Lichtmicroscopie...........................................................................................................................................17

, 2


3.1.2 Confocale scanning laser microscopie..........................................................................................................18
3.1.3 Elektronenmicroscopie.................................................................................................................................18
3.1.4 Ter overzicht.................................................................................................................................................19
3.2 Schimmels en aanverwante soorten...................................................................................................................19
3.2.1 Schimmels.....................................................................................................................................................19
3.2.2 Slijmzwammen of myxomyceten..................................................................................................................20
3.2.3 Lichenes of korstmossen...............................................................................................................................21
3.3 Gisten...................................................................................................................................................................21
3.4 Bacteriën..............................................................................................................................................................21
3.5 Overgangsgroepen...............................................................................................................................................23
3.5.1 Archaea.........................................................................................................................................................23
3.5.2 Rickettsiae (obligaat parasitaire bacteriën)..................................................................................................23
3.5.3 Actinomyceten (straalschimmels)................................................................................................................23
3.5.4 Mycoplasma..................................................................................................................................................23
3.5.5 Mycobacteria................................................................................................................................................23
3.5.6 Myxobacteria (glijdende bacteriën)..............................................................................................................24
3.5.7 Cyanobacteria...............................................................................................................................................24
3.6 Protozoa...............................................................................................................................................................24
3.7 Algen....................................................................................................................................................................25
3.8 Virussen, viroïden, prionen..................................................................................................................................25
3.8.1 Virussen.........................................................................................................................................................25
3.8.2 Viroïden.........................................................................................................................................................25
3.8.3 Prionen..........................................................................................................................................................26
Hoofdstuk 4: Microbiële groei.......................................................................................................................................26
4.1 Inleiding................................................................................................................................................................26
4.2 Mitose, meiose en conjugatie..............................................................................................................................26
4.3 Geslachtelijke en ongeslachtelijke voortplanting................................................................................................26
4.4 Groei van bacteriën..............................................................................................................................................27
4.4.1 Individuele bacteriegroei..............................................................................................................................27
4.4.2 Groei van de bacteriële populatie................................................................................................................27
4.4.3 Uitwisseling van genetisch materiaal tussen bacteriën................................................................................28
4.5 Groei van fungi (gisten en schimmels).................................................................................................................29
4.5.1 Ongeslachtelijke voortplanting van de fungi................................................................................................30
4.5.2 Geslachtelijke voorplanting van de fungi......................................................................................................30
4.5.3 Levenscycli van de fungi................................................................................................................................30

, 2


4.6 Groei van virussen................................................................................................................................................30
4.6.1 Aanhechtingsfase (virusintrede of virusadsorptie).......................................................................................31
4.6.2 Injectie van het faag-DNA.............................................................................................................................31
4.6.3 Intracellulaire vermenigvuldiging en lysis.....................................................................................................31
4.7 Invloedsfactoren op de groei van micro-organismen..........................................................................................31
4.7.1 Voedingsstoffen/samenstelling van het groeimedium.................................................................................31
4.7.2 Temperatuur.................................................................................................................................................32
4.7.3 Zuurtegraad of pH.........................................................................................................................................34
4.7.4 Zuurstof.........................................................................................................................................................34
4.7.5 De wateractiviteit (aw)...................................................................................................................................35
4.7.6 Antimicrobiële stoffen..................................................................................................................................35
4.8 Kweken van micro-organismen...........................................................................................................................36
Hoofdstuk 5: Het microbieel metabolisme....................................................................................................................36
5.1 Enzymen...............................................................................................................................................................36
5.1.1 Rol in het microbieel metabolisme...............................................................................................................36
5.1.2 Enzymstructuur.............................................................................................................................................36
5.1.3 Ezymwerking.................................................................................................................................................36
5.1.4 Enzymkinetiek...............................................................................................................................................37
5.1.5 Enzymremming.............................................................................................................................................37
5.2 De stofwisseling van micro-organismen..............................................................................................................38
5.2.1 Indeling van de micro-organismen naar stofwisseling.................................................................................38
5.2.2 Waar hebben micro-organismen energie voor nodig?.................................................................................38
5.2.3 Oxidatie- en reductiereacties als basis voor het metabolisme.....................................................................39
5.2.4 Energieleverende reacties............................................................................................................................39
5.2.5 Biosynthetische of energieconsumerende reacties.....................................................................................41
Hoofdstuk 6: Microbiële ecologie..................................................................................................................................41
6.1 Mineralisatie van de C-, N- en S-cyclus................................................................................................................41
6.1.1 Mineralisatie van organische verbindingen..................................................................................................42
6.1.2 Stikstofcyclus.................................................................................................................................................43
6.2 Bodemmicrobiologie............................................................................................................................................44
6.2.1 Microbiële diversiteit in de bodem...............................................................................................................44
6.2.2 Beïnvloeding van het bodemleven...............................................................................................................44
6.3 Symbiose..............................................................................................................................................................45
6.3.1 Samenleving van bacteriën met hogere planten..........................................................................................45
6.3.2 Zwamwortelsymbiose (Mycorrhiza’s)...........................................................................................................46

, 2


6.3.3 Planteneters en hun pensflora.....................................................................................................................47
Hoofdstuk 7: Taxonomie, nomenclatuur en identificatie..............................................................................................47
7.1 Taxonomie en identificatie..................................................................................................................................47
7.2 Nomenclatuur......................................................................................................................................................48
7.3 Taxonomie van de schimmels..............................................................................................................................49
7.4 Taxonomie van de gisten.....................................................................................................................................50
7.5 Taxonomie van de bacteriën................................................................................................................................50
7.6 Taxonomie van de virussen..................................................................................................................................50
Hoofdstuk 8: Industriële microbiologie.........................................................................................................................51
8.1 Inleiding................................................................................................................................................................51
8.2 Het fermentatieproces.........................................................................................................................................51
8.3 Micro-organismen als product.............................................................................................................................52
8.3.1 Micro-organismen als voedselbron..............................................................................................................52
8.3.2 Productie van vaccins....................................................................................................................................53
8.4 Metabolieten als product....................................................................................................................................53
8.4.1 Antibiotica.....................................................................................................................................................54
8.4.2 Enzymen........................................................................................................................................................55

, 2




Hoofdstuk 1: Inleiding




1.1 Werkgebied van de microbiologie
Definities:
Microbiologie: de wetenschap die zich bezighoudt met de bestudering van de bouw en de levensverrichtingen van
micro-organismen.
Micro-organismen:
1. Organismen die uitsluitend met behulp van een (elektronen)microscoop te zien zijn.
2. Organismen die in hun levenscyclus tenminste 1 periode doormaken, waarin een enkele cel zich als
individu vermenigvuldigt.
3. Microscopische organismen die bestaan uit een enkele cel of celcluster samen met de virussen die
microscopisch zijn, maar niet cellulair.
Macro-organismen Micro-organismen
 Cellen kunnen niet op zichzelf leven  Onafhankelijk van andere cellen
 Meercellige structuren


Specialisaties van microbiologen:
 Specifieke groepen:
o Viroloog
o Bacterioloog
o Fycoloog of algoloog
o Mycoloog
o Protozoloog
 Karakteristieken en activiteiten van micro-organismen:
o Microbiële morfologie
o Microbiële cytologie
o Microbiële ecologie
o Microbiële genetica en moleculaire biologie
o Microbiële taxonomie

, 2


 Specifieke domeinen:
o Medische microbiologie
o Levensmiddelenmicrobiologie
o Industriële microbiologie
o Agromicrobiologie

Schadelijke MO Onschadelijke MO Nuttige MO
 Ziekten  Commensalen  Productie en bewaring van
 Bestrijding van pathogene  Commensalisme = voedsel
MO = fytopathologie symbiose met 1 organisme  Verwerking van afval
 Ontbindingsprocessen +, 1 organisme /  Biotechnologische
 Bederfprocessen toepassingen
 Verteringsprocessen bij
mens en dier
 Toepassingen in de
geneeskunde


Voorbeelden van nuttige micro-organismen:
 Productie en bewaring van voedsel:
o Bier-, brood- en wijnbereidingen
o Kazen, yoghurt en melkproducten
o Conserveringsmethodes van basisvoedsel voor mens en dier
 Verwerking van afval:
o Huishoudelijk afval
o Industrieel afval
o Giftige stoffen → meststoffen en vruchtbare grond
o Afvalproducten van petroleumraffinage verteren
 Biotechnologische toepassingen:
o Productie van enzymen, geneesmiddelen, vaccins, …
o Productie van grondstoffen voor de chemische industrie
o Genetische manipulatie
 Verteringsprocessen bij mens en dier:
o Darmflora
o Huidflora
 Toepassingen in de geneeskunde:
o Penicilline
o Bestrijding van bacteriële infectieziekten
o Entstoffen en immunoglobulines of antistoffen

, 2



1.2 Geschiedenis van de microbiologie
1.2.1 De Oudheid
 In de Oudheid
o Besmettelijke en de niet-besmettelijke ziekten
 In het Oude Testament
o Strikte hygiëne
o Verspreiding door afzondering voorkomen
o Vlees niet lang bewaren
 Hippocrates
o Overbrenging van besmetting door “uitwaseming” die van een zieke uitgingen

1.2.2 De “Generatio Spontanea” en de ontdekking van micro-organismen
 Robert Hooke
o Eerste persoon om micro-organismen waar te nemen
o Eerste microscoop
o Schimmel Mucor
 Antonie van Leeuwenhoek
o Nam bacteriën waar
o Microscoop met enkelvoudige lens
o Uitvinder microscoop en grondlegger microbiologie
 Aristoteles
o Generatio Spontanea of abiogenesis ↔ biogenesis
o Levend materiaal gaat dood, maar de levenskrachten zouden niet verdwijnen
Experiment aanhangers Generatio Spontanea:
 Needham
o Kolf met vloeistof en gunstige condities voor ontstaan van micro-organismen
o Vloeistof opgekookt
o Afgesloten met kurk
o Troebeling → aanwezigheid micro-organismen
Tegenexperimenten Generatio Spontanea:
 Francesco Redi
o Maden van rottend vlees afkomstig van eieren van vliegen
 Spallanzani
o Experiment Needham met langere duur van verhitting en hermetisch afgesloten kolf
o Geen troebeling → afwezigheid micro-organismen
 Appert en Gay Lussac
o Weinig O2 in kolf
 Schwann
o Liet lucht toe in kolf
o Verhitte de lucht
o Geen troebeling → afwezigheid micro-organismen

, 2


1.2.3 De microbiologie als wetenschap
 Louis Pasteur
o Bewijs verwerping Generatio Spontanea
o Eerste studies over fermentatie
o Micro-organismen aanwezig in lucht → proef met
zwanenhalskolf
o Bewijs biogenesis: levensvormen produceren andere

levensvormen
o Grondlegger van de biochemie en de
moderne bacteriologie
o Bedacht pasteurisatie voor bewaring van
levensmiddelen
o Zag relatie tussen infectieziekten en bacteriën
o Pionierswerk immuniteit: grondlegger
vaccin hondsdolheid

1.2.4 De medische microbiologie
1.2.4.1 Opsporen van ziekteverwekkers
 Fracastoro: kleine deeltjes brengen besmetting met
ziekteverwekkers over
 Semmelweis: kraamkoorts veroorzaakt door bacteriën als
gevolg van slechte hygiëne
 Lister: legde hygiënische maatregelen op → besmetting van
chirurgische wonden vermijden
 Robert Koch: grondlegger van de bacteriologie en de medische bacteriologie
o Miltvuurverwekker B. anthracis
o Tuberculoseverwekker M. turberculosis
o Koch’s postulaten → kritische regels voor onderzoek naar relaties tussen ziekten en micro-
organismen = definitieve bewijs dat micro-organismen ziekten kunnen veroorzaken
Koch’s onderzoek naar de relaties tussen ziekten en micro-organismen:
1. Het verdachte pathogeen moet geïsoleerd kunnen worden uit het ziek individu. De verdachte
bacteriesoort moet in alle zieke individuen terugkomen.
2. Uit bacteriemengsels de afzonderlijke cellen van elkaar scheiden. Reincultuur = kweek van 1 type cellen.
3. Het geïsoleerde pathogeen moet in een gezond individu de ziekteverschijnselen kunnen oproepen.
4. De verdachte bacteriesoort moet opnieuw teruggevonden worden uit de besmette individuen die ziek
werden.

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