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Samenvatting Biochemie H
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Samenvatting van hoofdstuk 2 uit Biochemistry, inclusief aantekeningen van de colleges.
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Protein composition and structureBiochemistry – hoofdstuk 2
2.1
Eiwit: 20 bouwstenen (aminozuren), de structuur (en daardoor de functie) is
direct afhankelijk van de volgorde.
DNA: 4 bouwstenen (nucleotiden), de volgorde bevat informatie, maar de
structuur is onafhankelijk van de volgorde.
RNA: structuur wel afhankelijk van de volgorde.
Eiwitten vervullen uiteenlopende functies (DNA heeft
maar één functie)
Stevigheid
Chemische reacties versnellen
Opslag en transport
Beweging
Respons op stimuli
Groei en differentiatie
Immuunbescherming
Aminozuur bij pH 7 heeft ladingen!
Centraal koolstofatoom heet Cα
Aminozuren zijn chiraal Cα is asymmetrisch, dus er bestaan
spiegelbeeldisomeren. In het leven komt alleen de L isomeer voor, nooit D.
Alle functionele groepen die een proton kunnen opnemen of afstaan worden
gekarakteriseerd door een specifieke pKa waarde. Dit is de evenwichtsconstante
voor een zuur/base reactie. (Henderson Hasselbach equation).
Vuistregel pKa en pH
Als de pH van een oplossing veel hoger is dan de pKa van de functionele
groep (meer dan 2 units), dan overheerst de gedeprotoneerde vorm
(zonder H+).
Als de pH van een oplossing veel lager is dan de pKa van de functionele
groep (meer dan 2 units), dan overheerst de geprotoneerde vorm (additie
H+).
Een goed buffermolecuul heeft een pKa die ongeveer gelijk is aan de pH die je wilt
hebben
pKa +/- 0.5 unit.
Bij een heel lage pH kunnen organismen overleven, bij een heel hoge pH niet,
omdat het DNA uit elkaar valt bij een te hoge pH. Dit komt doordat de pK a van
guanine 9.7 is.
Eiwitten zijn opgebouwd uit 20 verschillende aminozuren.
Zijketens verschillen in:
Grootte
Lading
Waterstofbrugvormende eigenschappen
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