Resume
Samenvatting Cel II biochemie
- Cours
- Cel II (D012572A)
- Établissement
- Universiteit Gent (UGent)
focus op slides en syllabus
[Montrer plus]
4 revues
Par: alexiacloquet • 1 mois de cela
Par: teirlynckamelie • 1 année de cela
Par: phelineblondeel • 10 mois de cela
Par: amlielibrecht • 1 année de cela
Aperçu du contenu
BiochemieInhoud
1. De zwakke krachten en hun rol in de biochemie........................................................2
Waterstofbrugvorming................................................................................................2
De van-der-waals-interactie........................................................................................3
Het hydrofobe effect...................................................................................................3
De ionaire binding.......................................................................................................3
Vele kleintjes maken 1 groot.......................................................................................4
2. Lipiden en cellulaire membranen...............................................................................4
De fosfolipiden............................................................................................................5
De glycolipiden............................................................................................................6
Ziekte van Tay-Sachs...............................................................................................7
Cholesterol..................................................................................................................7
Fosfolipiden vormen dubbellagen...............................................................................8
Het gebruik van artificiële membranen....................................................................8
Biomembranen, de grenzen van cellen en celorganellen...........................................8
De samenstelling van biologische membranen........................................................8
Membraaneiwitten en carbohydraten......................................................................9
Rol van glycaanresten op glycoproteïnen gedurende eiwitsecretie en -adressering
...............................................................................................................................11
Membranen als vloeibare systemen..........................................................................11
3. Structuur en functie van eiwitten.............................................................................12
De architectuur van eiwitten.....................................................................................12
aminozuren, 20 verschillende bouwstenen van eiwitten.......................................12
De primaire structuur.............................................................................................14
De secundaire structuur.........................................................................................14
Supersecundaire structuren en modules...............................................................17
De tertiaire structuur.............................................................................................18
Opvouwing van eiwitten.........................................................................................21
De quaternaire structuur........................................................................................23
Functie van eiwitten: ligandbinding..........................................................................27
Myoglobine en hemoglobine hebben en prosthetische groep die zuurstofgas bindt
...............................................................................................................................27
De structuur van hemoglobine...............................................................................27
Coöperativiteit van O2-binding...............................................................................28
Het Bohr-effect.......................................................................................................28
1
, Wijziging van de O2-bindingseigenschappen door 2,3-bisfosfoglyceraat (effector)
...............................................................................................................................30
Functie van eiwitten: enzymen als biokatalysatoren................................................30
Chemische reacties en energie, enzymen verlagen de vrije energie van de
transitietoestand....................................................................................................30
Enzymen worden geclassificeerd volgens de reacties die ze uitvoeren.................31
In de driedimensionale structuur van enzymen zijn bepaalde aminozuren
verantwoordelijk voor substraatherkenning, andere voor het uitvoeren van de
katalyse..................................................................................................................32
Reactiemechanismen, de rol van katalytische aminozuren...................................32
Specificiteit is onafhankelijk van het reactiemechanisme......................................33
Enzymkinetieken....................................................................................................33
Enzyminhibitie........................................................................................................35
Regulatie van enzymen..........................................................................................36
4. Biochemistry at work................................................................................................38
Werking penicillines..................................................................................................38
Opbouw en synthese van de bacteriële celwand...................................................39
Penicillines zijn substraatanalogen en inactiveren de transpeptidasen via een
mechanisme van irreversibele inhibitie.................................................................39
1.De zwakke krachten en hun rol in de biochemie
Biochemische processen komen tot stand door transiënte of permanente interacties.
Deze bindingen worden veroorzaakt doordat er verschillende zwakke, niet-
covalente associaties optreden.
Waterstofbrugvorming
levende organismen: 70-80% water
water is een oplosmiddel
grote elektronegativiteit vh zuurstofatoom zuigt de gemeenschappelijke
elektronenparen van covalente bindingen met de waterstofatomen naar zich toe
polaire structuur
dipoolmoment: partieel negatieve en positieve ladingen
geen elektronen gedeeld
5 kcal/mol (lager dan bindingsenergie covalente binding)
waterstofbruggen wisselen continu uit dynamisch netwerk hoog kookpunt
afstand covalente interactie O-H: 1,2A <-> waterstofbruggen 2,7A
kan ook met andere atomen met een elektronegatief karakter (O, N, F) of tussen
deze groepen onderling (alcohol, amide, amino, carbonyl)
2
, hydrofiele moleculen
waterstofbrugdonor/ waterstofbrugacceptor
lineaire waterstofbruggen zijn het sterkst
afstand 2,6-3,1A
De van-der-waals-interactie
in niet-polaire moleculen en (transiënte) dipool induceren als 2 moleculen
samenkomen kracht is sterk afhankelijk van de afstand tussen de 2 atomen
te dicht: afstoting
optimale afstand: van-der-Waals-radius (2x afstand covalente binding)
1 kcal/mol
H 1,2A
C 2,0A
N 1,5A
O 1,4A
S 1,85
A
Het hydrofobe effect
verbindingen moeilijk oplosbaar in water: hydrofoob
1 hydrofobe molecule in water energetisch ongunstig
meerdere hydrofobe moleculen: associatie ontstaat uit de slechte solvatatie van
deze moleculen in water (vb. 2 benzeen moleculen)
drijvende kracht bij eiwitopvouwing
De ionaire binding
elektronegatief karakter groot elektronenpaar van de
waterstofbrugdonormolecule kan overgaan naar het meest elektronegatieve atoom
anion ontstaat
aantrekkingskracht door tegenovergestelde ladingen
q1 q2
F= 2
(D= diëlektriciteitsconstante)
r D
onafhankelijk van een richting
aantrekkingskracht wordt beïnvloed door omgevingsfactoren
diëlektriciteitsconstante (D)
3
, o in water 80, in vacuüm 1
8 kcal/mol in water
watermantel doordat partiële negatieve ladingen zich naar de positieve ladingen
oriënteren goed oplossen
energie komt vrij: hydratatie-energie
wanneer ionen door een membraan migreren of associëren met eiwitten moeten
ze geheel of partieel hun watermantel verliezen
Vele kleintjes maken 1 groot
De stabilisatie van een structuur is de som vd individuele bijdragen van al de
zwakke interacties die in de structuur optreden.
krachten werken niet onafhankelijk van elkaar
Wanneer 2 moleculen met elkaar willen interageren moeten de vormen van hun
oppervlakken complementair zijn en de groepen in dit oppervlak moeten
energetisch gunstige interacties aan kunnen gaan (bv. oppervlak complementair
maar afstoting door 2 gelijke ladingen)
2.Lipiden en cellulaire membranen
Organismen bevatten 4 klassen van organische macromoleculen:
1) eiwitten
2) polynucleotiden
3) suikers
4) vetten of lipiden
a. hydrofoob karakter
b. brandstof/signaalmolecule/ onderdeel biologische membranen
c. 3 voornaamste groepen: fosfolipiden, glycolipiden en cholesterol
Van medisch belang?
Multiple Sclerose: verlies van plasmalogen de-myelinatie (oogproblemen)
hartaandoeningen: antilichamen tegen fosfolipiden
4
Les avantages d'acheter des résumés chez Stuvia:
Qualité garantie par les avis des clients
Les clients de Stuvia ont évalués plus de 700 000 résumés. C'est comme ça que vous savez que vous achetez les meilleurs documents.
L’achat facile et rapide
Vous pouvez payer rapidement avec iDeal, carte de crédit ou Stuvia-crédit pour les résumés. Il n'y a pas d'adhésion nécessaire.
Focus sur l’essentiel
Vos camarades écrivent eux-mêmes les notes d’étude, c’est pourquoi les documents sont toujours fiables et à jour. Cela garantit que vous arrivez rapidement au coeur du matériel.
Foire aux questions
Qu'est-ce que j'obtiens en achetant ce document ?
Vous obtenez un PDF, disponible immédiatement après votre achat. Le document acheté est accessible à tout moment, n'importe où et indéfiniment via votre profil.
Garantie de remboursement : comment ça marche ?
Notre garantie de satisfaction garantit que vous trouverez toujours un document d'étude qui vous convient. Vous remplissez un formulaire et notre équipe du service client s'occupe du reste.
Auprès de qui est-ce que j'achète ce résumé ?
Stuvia est une place de marché. Alors, vous n'achetez donc pas ce document chez nous, mais auprès du vendeur topsamenvattingenbe. Stuvia facilite les paiements au vendeur.
Est-ce que j'aurai un abonnement?
Non, vous n'achetez ce résumé que pour €6,99. Vous n'êtes lié à rien après votre achat.
Peut-on faire confiance à Stuvia ?
4.6 étoiles sur Google & Trustpilot (+1000 avis)
50843 résumés ont été vendus ces 30 derniers jours
Fondée en 2010, la référence pour acheter des résumés depuis déjà 14 ans