De samenvatting omvat alle 8 de powerpoints die in het academiejaar gegeven zijn. Het betreft de 4 ppt's van deel 1 "Microbiële groei en identificatie" en de 4 ppt's van deel 2 "Industriële processen en producten". Alle extra info die tijdens de hoorcolleges werd meegedeeld is ook verwerkt in de...
Industriële microbiologie
DEEL 1: MICROBIËLE GROEI EN IDENTIFICATIE
INLEIDING
Ontwikkeling microbiële processen voor industrie:
• Prokaryoot = geen celkern → bacteriën, archaea
• Eukaryoot = wel celkern → gisten, algen, fungi,
protozoa (pantoffeldiertjes)
• Virussen = apart domein!
• Penicilline = schimmel dat groei bacteriën
tegengaat
• Genetic engineering = recombinatie DNA zodat er
eiwit kan worden aangemaakt
• Downstream processing = alles wat gebeurt na
vormen product
• Upstream processing = alles wat gebeurt voor
vormen product
• Farmaceutische producten = “low volume, high value”
• Van elk 1 voorbeeld kennen:
o Gram nega prokaryoot = Pseudomonas
o Gram posi prokaryoot = Bacillus
o Filamenteuze funghi = Aspergillus
o Gist funghi = Candida
1
, Prokaryoten en eukaryoten cellen: verschillen en overeenkomsten:
I De celwand
• Grampositief = dikke laag peptidoglycaan (verstevigd) → neemt
ultraviolet op (paars)
Peptidoglycaan = afwisselend disaccharide van NAG + NAM gebonden
via polypeptides
Bevat tetrapeptidezijketens
Teichoic acid = overspant peptidoglycaan en hecht aan plasmamembraan (alcohol +
fosfaatgroep)
Voornamelijk exotoxine = product van levende, grampositieve bac’s
• Gramnegatief = één of enkele dunne lagen peptidoglycaan (roos)
Peptidoglycaan verbonden met lipoproteïne
Porines = kanalen voor nutriënten
Periplasmaruimte = tussen peptidoglycaan en plasmamembreaan
Geen teichoic acid
Lipid A = endo toxine = kan ziekte veroorzaken
Voornamelijk endotoxines = product van gramnegatieve bac’s → komt pas vrij na lysis (strak
worden van celwand) v/d bac’s
Celwand visualisatie
II Glycocalyx
• Aan buitenkant celmembraan eukaryoot en aan buitenkant celwand prokaryoot
• Suikerjas
• Capsule = georganiseerd + aanhechting
• Slijmlaag = niet-georganiseerd + geen aanhecting
• Beschermt tegen fagocytose door gastheer
Glycocalyx visualisatie
• Aanwezigheid → negatieve kleuring
• M.o. kleuren voor donkere achtergrond
• Kleuren met saffranine → bacterie neemt kleur op, maar capsule niet
• Resultaat = gekleurde bacterie met kleurloze capsule
2
, Flagella
• Lange filamenteuse aanhangsels
• Functie = beweeglijkheid
• Bij prokaryoot = apart, uit eiwitten opgebouwd organel → propellerbeweging
• Bij eukaryoot = uitstulping celmembraan → zweepbeweging
• Fimbriae (#1-100)= haarachtig aanhangsel, kleiner dan flagella → functie is aanhechting
• Pili (#1-2) = langer dan fimbriae → functie is aanhechting tussen bac’s voor DNA transfer
Flagella visualisatie
• Kleuren met carbolfuchsin
• Diameter wordt dikker
III Chromosomen en vergelijking genexpressie
• E.coli chromosoom = 1 circulair chromosoom
• Genoom = genetische info in cel (bij E.coli is volledig
genoom gekend)
• Chromosoom = hierin is genoom georganiseerd → bevat
opgewonden DNA
• Gen = stukje DNA dat voor functioneel eiwit codeert
• Genetische map = voorstelling chromosoom → pijltjes
geven aan waar genen zitten en tijd geeft weer hoeveel
tijd (per min) nodig is om gen door te geven naar andere
bacterie tijdens conjugatie via pili
DNA replicatie
• 1 ouder DNA omgezet in 2 identieke dochtermoleculen
• Nucleotide = fosfaat + suiker (deoxyribose) + base
• Nucleotide via fosfordiësterbindingen met elkaar verbonden
• 2 DNA strengen via H-bruggen gebonden (A=T, C=G) → vormen complementaire strengen
die anti-parallel staan → buigen tot dubbele helix
• Sequentie = volgorde nucleotiden → oneindig veel mogelijkheden
• Replicatievork = plaats waar replicatie plaats vindt
• Stappen DNA replicatie (kost energie!):
o 2 strengen scheiden → H-bruggen verbroken door replicatie
enzymen (=helicase)
o Nieuwe nucleotiden in cytoplasma binden aan
complementaire nucleotiden → nieuwe baseparen gevormd
o DNA polymerase zorgt voor fosfodiësterbinding tussen suiker-
fosfaat v 2 nucleotiden = dochterstreng
o Parentale streng verder ontwonden en volgende nucleotiden
aangehecht
• Leading strand = continu = streng in 5’-3’ richting gemaakt in 1 stuk
3
, • Lagging strand = discontinu = streng in kleine stukjes gemaakt
• Probleem → DNA polymerase kan enkel hechten aan 3’ einde
• Oplossing → RNA polymerase maakt RNA primer → kan aan 3’ einde nucleotiden hechten
• Resultaat → stukjes DNA, 1000 nucleotiden = Okazaki-fragment
• Okazaki = relatief kort DNA-fragment op lagging strand van dubbele helix tijdens replicatie
• Welke enzymen spelen rol bij DNA synthese? = DNA-ligase, RNA-polymerase, DNA-
polymerase
• Bacterieel DNA = 2 replicatievorken
Transcriptie
• Info van DNA → RNA
• Stappen DNA transcriptie:
o RNA polymerase bindt aan promotor (=startpunt) → DNA ontrolt
o RNA gesynthetiseerd
o Plaats van synthese beweegt langs DNA
o Terminator (=eindpunt) wordt bereikt
o RNA, RNA-polymerase komen vrij → DNA helix terug gevormd
• Genetische code:
o 3 nucleotiden = codon (bv: GCU = alanine)
o Voor 1 aminozuur meerdere codons
o Sense codons = 63, nonsense codons = 3
o AUG = start = methionine
o Bij prokaryote is start vaak formylmethionine
Translatie
• RNA + ribosomen/RNA → aminozuur sequent → eiwit
• Componenten = mRNA, tRNA, 2 ribosomale subeenheden en AZ
• Stappen DNA translatie:
o Codons in volgorde gelezen volgens mRNA
o Juiste AZ aangehecht in ribosomen
o tRNA = transport AZ, herkent specifieke codon via anticodon (=tegenovergestelde
sequentie van codon)
o peptide binding tussen AZ en 1ste tRNA
o ribosoom schuift van 5’ naar 3’ over mRNA
o stopt bij stopcodon
• simultane transcriptie + translatie:
o bacteriën: transcriptie + translatie in cytoplasma
o eukaryoten: transcriptie in nucleos en translatie in cytoplasma
o bij bac’s gaat beide in cytoplasma door want ze hebben geen kermembraan
• RNA-processing:
o Exonen = regios in DNA die tot expressie komen
o Intronen = regios in DNA die niet tot expressie komen
o In kern → intronen verwijderd en mature RNA verkregen
o RNA processing enkel bij eukaryoot
4
Les avantages d'acheter des résumés chez Stuvia:
Qualité garantie par les avis des clients
Les clients de Stuvia ont évalués plus de 700 000 résumés. C'est comme ça que vous savez que vous achetez les meilleurs documents.
L’achat facile et rapide
Vous pouvez payer rapidement avec iDeal, carte de crédit ou Stuvia-crédit pour les résumés. Il n'y a pas d'adhésion nécessaire.
Focus sur l’essentiel
Vos camarades écrivent eux-mêmes les notes d’étude, c’est pourquoi les documents sont toujours fiables et à jour. Cela garantit que vous arrivez rapidement au coeur du matériel.
Foire aux questions
Qu'est-ce que j'obtiens en achetant ce document ?
Vous obtenez un PDF, disponible immédiatement après votre achat. Le document acheté est accessible à tout moment, n'importe où et indéfiniment via votre profil.
Garantie de remboursement : comment ça marche ?
Notre garantie de satisfaction garantit que vous trouverez toujours un document d'étude qui vous convient. Vous remplissez un formulaire et notre équipe du service client s'occupe du reste.
Auprès de qui est-ce que j'achète ce résumé ?
Stuvia est une place de marché. Alors, vous n'achetez donc pas ce document chez nous, mais auprès du vendeur amberrodrigo1. Stuvia facilite les paiements au vendeur.
Est-ce que j'aurai un abonnement?
Non, vous n'achetez ce résumé que pour €4,99. Vous n'êtes lié à rien après votre achat.
