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Samenvatting Zelfstudie 3 moleculen E&E
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Stof uit Tymoczko en Alberts van zelfstudie 3. Leerstof bij Moleculen BMW Utrecht, eiwitten&enzymen
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Zelfstudie 3A7.1
Allosterische enzymen ontvangen signalen uit omgeving en passen dan hun
reactiesnelheid aan
Kinetics= leer naar snelheid van chemische reacties→ enzym kinetics
Snelheid van reactie (V= velociteit)= hoeveelheid reactant A in tijd t is gelijk en
verdwijnen van product P
1. V= -d[A]/dt = d[P]/dt
d= afname van substraat/ product concentratie
Snelheid van de reactie is direct gerelateerd aan concentratie A bij constante k:
snelheidsconstante
2. V= k[A]
Reactie waarbij snelheid recht evenredig is met de concentratie van reactant=
eerste orde reactie (s-1)
2 reactanten: tweede orde reactie (M-1 s-1) ( 2A→ P of A+B→ P) bijbehorende
snelheidsvergelijkingen:
3. V= k[A]2
4. V= k[A][B]
Pseudo eerste orde reactie= tweede orde reactie dat lijkt op eerste orde
7.2
Beginsnelheid van katalyse: aantal mol product per seconde kort na begin van
reactie, hangt af van substraatconcentratie [S] als enzymconcentratie constant is
5. E+S ES /(6.) E+P
Specifiek ES complex is een nodige tussenvorm in katalyse
7. V0= Vmax [S]/[S]+ KM
Waar:
8. KM= k-1+k2/k1
KM= Michaels constante (snelheidsconstante), uniek voor elk enzym
9. Vmax= k2[E]T
Vmax= maximale snelheid, kan alleen bereikt worden als alle enzym aan
substraat is gebonden
Weinig substraat, veel minder dan KM→ snelheid recht evenredig met
substraatconcentratie→ V0= (Vmax/KM)[S]
[S] veel hoger dan KM→ V0= Vmax→ snelheid maximaal, onafhankelijk van
substraat concentratie
Vmax→ alle enzym aan substraat gebonden= zero orde kinetics= verzadigd
KM is gelijk aan substraat concentratie waarbij reactiesnelheid de helft van
maximale waarde is→ [S]= KM bij V0= Vmax/2
Voor het bestaan van computers: bepaling van KM en Vmax waarden met
Michaels-Menten vergelijking→ rechte lijn
Lineweaver-Burk vergelijking: 1/V0= (KM/Vmax)*(1/S) + 1/Vmax
KM van enzymen ligt meestal tussen 10^-1 en 10^-7 M
Hangt af van substraat en omgeving (pH, temperatuur, etc.)
KM is gelijk aan [S] waarbij de helft van de actieve plekken gevuld zijn
Vmax= omzetgetal→ aantal substraatmoleculen dat een enzym kan omzetten tot
product per tijdseenheid wanneer enzym volledig verzadigd is met substraat
Omzetgetal is gelijk aan snelheidsconstante k2 (kcat)
Als totale concentratie actieve plekken [E]T bekend is:
Vmax= k2[E]T en dus k2= Vmax/ [E]T
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