dit is een samenvatting van het van Microbiologie hoofdstuk 7 Taxonomie van bacterien
deze samenvatting bevat 8 pagina's
er zijn ook oefenvragen met antwoorden beschikbaar voor dit vak
Wetenschap die zich bezig houdt met classificatie, nomenclatuur en
identificatie van levende organisen
Bij eukaryoten soorten gedefinieerd als groep verwante organisemen die
onderling kruisen
Bij bactieren geen frequente sexuele voortplanting (conjugatie) ivm
asexuele celdeling + is niet soortgebonden
o Elke soort volledig gekarateriseerd (fenotype en genotype) zelfs
fenotypen fragmentarisch beschreven + genotypisch onvoledig
o Extreme eenvoed in structuur taxonomisch te weinig variatie
Dus mbv : biochemische, fysiologische en ecologische kenmerken
Tegenwoordig: evolutieve verwantschappen fylogenetische verwantschap =
systematiek
7.1.2 Soortnaam
Binomiale nomenclatuur
o 1e woord : genus = taxonomische groep of onmiddellijk hogere orde of
geslacht
o 2e woord : species = specifieke soort binnen geslacht
o Vb: Escherichia coli : E.coli altijd Cursief!
o Latijnse- of griekse afgeleiden van beschrijvende kenmerken van
soorten
o Soortnamen zeggen iets over morfologische en
fysiclogische/economische kenmerken
Nieuwe bacterie onderzoek bij voldoende verschil apart species of zelfs
genus
Beschrijving van isolaat + voorgestelde naam gepubliceerd reincultuur
bezorgd aan erkende cultuurcollectie : ATCC : American Type Culture
Collection
Biotypen / varieteiten = afwijken in belangrijke eigenschappen
o Serotypen / serovars = alleen verschillende antigenen ( aangetoond
met antiserum)
Faagtypering = nog fijnere verschillen waarnemen = bepaald
bacteriofaagtype zeer specifieke stammen binnen een soort aantasten
7.2 Classificatiesystemen
7.2.1 Biologische classificatie
In eerste instantie ingedeeld in hierarchisch systeem (Linneaus)
Soorten / species : kleinste hierarchische eenheid Geslacht / genus stam (
-eae) Familie ( -aceae) orde (-ales)
Hogere taxa (Orde, Familie) onderscheiden naar morfologische eigenschappen
( vorm, gramkleuring , aanwezigheid van Flagellen)
Geslachten en soorten onderscheiden op basis van metabole eigenschappen (
fermentaties, enzymreacties,…)
1
, Morfologie en fusiologie : zwakke indicatoren om fylogenetische verwantschap
op te baseren ookal is het anders om ingeburgerd
7.2.2 Numerische classificatie
Vereenvoudigde versie concentionele bacteriele taxonomie
(Adanson) nadelen vermijden
Alle eigenschappen evenveel van belang
Op basis van gelijkaardige (fenotypische) eigenschappen:
Aantal gemeenschappelijke eigenschappen tov aantal
onderzochte eigenschappen
Voor elk paar organismen gelijkenisindex bepalen + uitzetten in
dendogram
Objectieve en stabiele basis voor constructie van taxonomische
groepen + toelaten objectieve vergelijking toekomstige isolaten
Systeem bruikbaar voor classificatie en identificatie maar NIET
als fylogenetisch instrument
7.2.3 Macromoleculaire methoden
Groei moleculaire biologie nieuwe inzichten vooral over genotypische
eigenschappen Grote impact op bacteriele taxonomie
7.2.4 DNA-onderzoek
Groot voordeel : cellen rechtstreeks op DNA niveau detecteren niet
afhankelijk van milieuinvloeden op gen expressie
Verschillende technieken
7.2.4.1 G + C gehalte bepaling
Stijging T: dsDNA ssDNA (hogere absorbantie bij
260nm!)
smelttemperatuur (Tm): T waarbij de helft van dsDNA
ssDNA
Mag zeker niet als enige criterium gebruikt worden om
verwantschap aan te tonen!
Varieert van 24-76 %
Bepaald voor groot aantal bacterien :
o Sterk gelijkende fenotypen Gelijkende DNA samenstelling
o Organismen kunnen identieke DNA samenstelling en verder niet
verwant zijn
Enkel gebruikt om NIET VERWANDSCHAP aan te duiden
7.2.4.2 Restrictie-fragment-lengte polymorfisme (RFLP)
Probleem expressie-afhankelijke parameters oplossing rechtstreeks op DNA
karakteriseren
Maken van restrictiepatroon mbv endonucleasen = restrictie-enzymen DNA
knippen
2
Les avantages d'acheter des résumés chez Stuvia:
Qualité garantie par les avis des clients
Les clients de Stuvia ont évalués plus de 700 000 résumés. C'est comme ça que vous savez que vous achetez les meilleurs documents.
L’achat facile et rapide
Vous pouvez payer rapidement avec iDeal, carte de crédit ou Stuvia-crédit pour les résumés. Il n'y a pas d'adhésion nécessaire.
Focus sur l’essentiel
Vos camarades écrivent eux-mêmes les notes d’étude, c’est pourquoi les documents sont toujours fiables et à jour. Cela garantit que vous arrivez rapidement au coeur du matériel.
Foire aux questions
Qu'est-ce que j'obtiens en achetant ce document ?
Vous obtenez un PDF, disponible immédiatement après votre achat. Le document acheté est accessible à tout moment, n'importe où et indéfiniment via votre profil.
Garantie de remboursement : comment ça marche ?
Notre garantie de satisfaction garantit que vous trouverez toujours un document d'étude qui vous convient. Vous remplissez un formulaire et notre équipe du service client s'occupe du reste.
Auprès de qui est-ce que j'achète ce résumé ?
Stuvia est une place de marché. Alors, vous n'achetez donc pas ce document chez nous, mais auprès du vendeur saarvercammen. Stuvia facilite les paiements au vendeur.
Est-ce que j'aurai un abonnement?
Non, vous n'achetez ce résumé que pour €2,99. Vous n'êtes lié à rien après votre achat.
