Biochemie: biomoleculen
‘3 dimensionale wetenschap’
• Vb. R-thalomide en S-thalomide: stereoisomeren die dezelfde chemische eig. hebben
maar in cel andere eig. vertonen
• S: softenon (zwangerschap: kinderen met aandoeningen)
• R of S bindt op bepaalde passende stof en reageren zo anders: 3D en functie hangt
nauw samen
Aminozuren (amine+ zuur groep) : algemene structuur en optische eigenschappen
• aanduiding:
o Grieks: start vanaf centrale C (amino en
carboxylgroep)
o Cijfers: start vanaf C met carboxylgroep
• Enkel L- aminoz. In ons lichaam; bacteriën hebben
ook D vorm die ze gebruiken voor peptide (korte stukjes AZ)
Indeling AZ volgens eig. van zijketen (R-groep)
,Glycine
• niet asymm.: centrale C heeft geen 4 verschillende groepen rond zich
• Grotere conformationele flexibiliteit: eiwt met configuratie waarbij
bepaalde delen flexibeler zijn dan andere; rotatie om as mogelijk door
weinig sterische hinder (H)
Nonpolaire AZ met alifatische zijketens
• Inert (alifatisch)
• Nonpolair en hydrofoob
• Geen functionele groepen
• Zijketens klusteren samen: belangrijk voor vorming eiwitten (lineair naar 3D)
Extra asymm. centrum
Alanine:
• In vitro mutagenesis: codon van AZ wordt
verandert door code van alanine omdat dit het
equivalent is van AZ waarbij een keten is afgeknipt
(afknippen van AZ is in praktijk onmogelijk)
• niet mogelijk bij glycine: je induceert conf. Flex.
Waardoor het effect groter wordt (je wilt klein effect op
een bepaalde plaats)
AZ met aromatische R-groepen
• zeer hydrofoob, apolair, weinig reactief
• OH: intermediair polair, deelname aan H-bruggen
• Functionele groep in enzymen
• Fosforylatieplaats: na aanmaak gaan eiwitten veel
modificaties ondergaan
• Intermediair polair (door N)
• Zeldzaam tov andere AZ
,Concentratie van eiwitten bepalen
• licht door monochromator waaruit licht met 1
bepaalde golflengte komt; gaat door buis met
gekende concentratie; licht met kleinere
intensiteit wordt gemeten; absorbantie meten
voor bepaling concentratie
AZ met polaire ongeladen R-groepen:
• SH: sulfidehydriel groep dus polair (pka=8)
• Vormt cystine door oxidatie: 2 aan elkaar gebonden cysteine door een
disulfidebrug (disulfidebruggen worden ook gebruikt bij het vouwen van
eiwitten in 3D)
• Belangrijke groep in het katalytisch centrum van enzym (= eiwit met eiwit
opp. + katalytisch centrum)
• OH: polair, kunnen worden gefosforyleerd, H-bruggen
• Amiden
• Polair
• H-brugvorming
• cyclisch, gematigd polair
• Rigide (door ring): kan niet roteren
• Geen H op N: geen H-bruggen
‘knikvorming’ ter hoogte van prolines in peptideketen
• transconfiguratie is hier het gunstigst: door bocht
bij cis is het waarschijnlijk dat zijketen botsen (sterische
hinder!)
• Cis kan hier wel: zijketen ongeveer even ver uit elkaar
als bij trans
, AZ met positief geladen R-groepen
Primair amine guanidinogroep
Beide pka=10
Histidine
• veelzijdige zijgroep: veel enzymen maken hier gebruik van om reactie te
bespoedigen
• Pka=7: dus 50/50 geladen en ongeladen
• Imidazol
• zeer nucleofiel: acceptor H brug
• Zeer elektrofiel: donor H brug
AZ met negatief geladen R-groepen
• Volledig geinoniseerd op pH=7: D= 3.65 en
E=4.25
• Zeer polair en kunnen metalen en kationen
cheleren
Les avantages d'acheter des résumés chez Stuvia:
Qualité garantie par les avis des clients
Les clients de Stuvia ont évalués plus de 700 000 résumés. C'est comme ça que vous savez que vous achetez les meilleurs documents.
L’achat facile et rapide
Vous pouvez payer rapidement avec iDeal, carte de crédit ou Stuvia-crédit pour les résumés. Il n'y a pas d'adhésion nécessaire.
Focus sur l’essentiel
Vos camarades écrivent eux-mêmes les notes d’étude, c’est pourquoi les documents sont toujours fiables et à jour. Cela garantit que vous arrivez rapidement au coeur du matériel.
Foire aux questions
Qu'est-ce que j'obtiens en achetant ce document ?
Vous obtenez un PDF, disponible immédiatement après votre achat. Le document acheté est accessible à tout moment, n'importe où et indéfiniment via votre profil.
Garantie de remboursement : comment ça marche ?
Notre garantie de satisfaction garantit que vous trouverez toujours un document d'étude qui vous convient. Vous remplissez un formulaire et notre équipe du service client s'occupe du reste.
Auprès de qui est-ce que j'achète ce résumé ?
Stuvia est une place de marché. Alors, vous n'achetez donc pas ce document chez nous, mais auprès du vendeur jaravandiepenbeek. Stuvia facilite les paiements au vendeur.
Est-ce que j'aurai un abonnement?
Non, vous n'achetez ce résumé que pour €10,99. Vous n'êtes lié à rien après votre achat.