Dit document omvat alle hoorcolleges, kennisclips en de xerte module van Planten en micro-organismen voor deeltoets 2. Dit is handig om te gebruiken tijdens het kijken van het hoorcollege of de kennisclip, of tijdens het studeren voor het laatste tentamen. Alle hoorcolleges, kennisclips en de xerte...
Planten en micro-organismen (B-B1PLMI20) - hoorcollege en kennisclip - deeltoets 2
hoorcollege 9 jan. 2024 – introductie
leerstof deel II
Campbell – H26, H27, H31 en aanvullende info samengevat in leerdoelen
hoorcolleges en online kennisclips
online blackboard quiz – deadline vrijdag 17h
online xerte module (week 7)
werkcolleges 16 en 25 jan. (week 8 en 9) en practicum 18 jan.
eindtoets 30 jan. weegt voor 30% mee
microbiologie – belangrijk en divers vakgebied
● virussen
○ technisch gezien niet levend / geen organisme
○ wel veel invloed op levende organismen
○ bevatten genetisch materiaal
○ hebben een eiwitmantel
○ zijn afhankelijk van andere cellen voor replicatie
● prokaryote micro-organismen
○ domein Bacteria en Archaea
○ eencellig
○ geen nucleus en geen organellen
● eukaryote micro-organismen
○ koninkrijk schimmels
○ protisten: alle eukaryoten behalve planten, dieren en schimmels
○ een- en meercelligen
○ nucleus en organellen
microbiologie tools
● microscopie
○ lichtmicroscopie
■ Brightfield – celkleuringen (fuchsine, Gram)
■ fluorescentie – structuur kleuringen, reporter eiwitten
○ elektronenmicroscopie
■ SEM (scanning) – oppervlakte cellen/structuren
■ TEM (transmissie) – binnenkant en contouren cellen/structuren
● kweken: nutriënten, koolstofbronnen, (a)biotische factoren
○ petrischaal met agar en media
○ erlenmeyer met vloeibaar media
○ fermentoren
● sequencing: sanger (DNA van 1 organisme), metagenomics (meerdere organismen)
○ kan ook onafhankelijk van kweken (metagenomics)
○ DNA isoleren uit reincultuur (1 soort) of uit een omgevingssample of
microbioomsample (community)
○ detectie van moleculaire markers: PCR met universele primers tegen
■ 16 rRNA gen (bacteriën)
■ ITS – Internal Transcribed Spacer (schimmels)
, Planten en micro-organismen (B-B1PLMI20) - hoorcollege en kennisclip - deeltoets 2
Waarom microben kweken?
● bepalen met welke (nieuwe) soort men te maken heeft
○ morfologie m.b.v. microscopie
○ diagnostiek → selectieve media, experimenten
○ reincultuur → sequencing
■ taxonomie (sanger sequencing)
■ genoom analyse (short- and long read sequencing)
moleculaire markers sequencen
● 16S (bacteriën – kleine subunit ribosoom) of ITS (schimmels)
○ ITS codeert niet voor eiwit → mutaties kunnen behouden worden
● onderdeel van het rDNA
● geconserveerd
● variabele stukken
● PCR (polymerase chain reaction) amplificatie met ‘universele’ primers
○ denaturatie (hoge temperatuur) → DNA strengen uit elkaar
○ 2 primers hechten op een bepaalde temperatuur aan de strengen
○ nucleotiden (bouwstenen), Taq polymerase
○ temperatuurcyclus
■ denatureren DNA
■ binden primers
■ verlengen DNA keten
○ herhalen → veel DNA → makkelijker te sequencen
● sequencen van PCR producten
● vergelijken met sequenties in database → al bekend of verwant aan bekende soorten
○ identificeren en verwantschap
Hoe ga je te werk om een schimmel te identificeren?
● sanger sequencing ITS
belang van studie naar micro-organismen
● belangrijke mutualisten en ziekteverwekkers
● grote invloed op ecosystemen – rol in cycli van elementen
● producenten van toepasbare enzymen, medicijnen
● biologische bestrijdingsmiddelen
● voedselbereiding en -productie
kennisclip 7.1 Virussen
eigenschappen virussen
● zijn klein
● hebben erfelijk materiaal
● delen niet
● missen eiwit translatie machinerie
● synthetiseren geen ATP
● zijn afhankelijk van gastheercellen voor vermenigvuldigen
● virussen infecteren mensen, dieren, planten, schimmels en bacteriën
Les avantages d'acheter des résumés chez Stuvia:
Qualité garantie par les avis des clients
Les clients de Stuvia ont évalués plus de 700 000 résumés. C'est comme ça que vous savez que vous achetez les meilleurs documents.
L’achat facile et rapide
Vous pouvez payer rapidement avec iDeal, carte de crédit ou Stuvia-crédit pour les résumés. Il n'y a pas d'adhésion nécessaire.
Focus sur l’essentiel
Vos camarades écrivent eux-mêmes les notes d’étude, c’est pourquoi les documents sont toujours fiables et à jour. Cela garantit que vous arrivez rapidement au coeur du matériel.
Foire aux questions
Qu'est-ce que j'obtiens en achetant ce document ?
Vous obtenez un PDF, disponible immédiatement après votre achat. Le document acheté est accessible à tout moment, n'importe où et indéfiniment via votre profil.
Garantie de remboursement : comment ça marche ?
Notre garantie de satisfaction garantit que vous trouverez toujours un document d'étude qui vous convient. Vous remplissez un formulaire et notre équipe du service client s'occupe du reste.
Auprès de qui est-ce que j'achète ce résumé ?
Stuvia est une place de marché. Alors, vous n'achetez donc pas ce document chez nous, mais auprès du vendeur Ribizlik. Stuvia facilite les paiements au vendeur.
Est-ce que j'aurai un abonnement?
Non, vous n'achetez ce résumé que pour €3,49. Vous n'êtes lié à rien après votre achat.
