Resume

Samenvatting Planten en micro-organismen - leerdoelen - deeltoets 2

0 fois vendu

Cours
Biologie van Planten

Établissement
Universiteit Utrecht (UU)

Dit omvat alle leerdoelen van het vak Planten en micro-organismen aan de Universiteit Utrecht. Gebruikt dit voor de tentamenvoorbereiding en geen zorgen! Het zijn veel leerdoelen, dus dit document kan zeker fijn zijn om te gebruiken tijdens het studeren. Soms staan er verwijzingen naar handige afbe...

[Montrer plus]

Aperçu 4 sur 44 pages

Voir l'exemple

Publié le 28 janvier 2024
Nombre de pages 44
Écrit en 2023/2024
Type Resume

virussen

Établissement
Universiteit Utrecht (UU)
Cours
Biologie
Cours
Biologie van Planten

Ribizlik

Membre depuis 5 année 155 documents vendus

€3,49

Ajouter au panier

Ajouter au liste de veux

Garantie de satisfaction à 100%
Disponible immédiatement après paiement
En ligne et en PDF
Tu n'es attaché à rien

Planten en micro-organismen (B-B1PLMI20) - leerdoelen - deeltoets 2 - week 7

De groepen micro-organismen noemen met hun belangrijkste karakteristieken.
bacteriën: prokaryote eencellige organismen
● missen een kern en andere door membraan omgeven organellen
● bezitten meestal circulaire chromosomen en vermenigvuldigen door deling
● hebben bijna altijd een celwand met peptidoglycaan
● hebben een flagel om te bewegen of aan een oppervlak te hechten

archaea: prokaryote eencellige organismen, waaronder de methanogenen
● missen een kern en andere door membraan omgeven organellen
● vermogen van sommige soorten om onder extreme condities te leven
● bezitten meestal circulaire chromosomen en vermenigvuldigen door deling
● hebben geen peptidoglycaan in hun celwand
● lijken qua transcriptie/translatie machinerie meer op eukaryoten dan bacteriën
● hebben een flagel, maar de eiwitten ervan lijken niet op de bacteriële eiwitten →
apart geëvolueerd

schimmels: eukaryote micro-organismen met een kern en organellen
● zijn meer verwant aan dieren dan aan planten
● zijn heterotroof
● vermenigvuldigen zich zowel geslachtelijk als ongeslachtelijk via sporen
● zijn een- of meercellig
● hebben chitine en glucaan in de celwand
● kunnen groeien als gist of in filamenteuze vorm

protisten: eukaryote micro-organismen met een kern en organellen
● zijn geen planten, dieren of schimmels
● kunnen heterotroof en autotroof zijn
● vermenigvuldigen zich geslachtelijk of ongeslachtelijk

archaea behoren de methanogenen toe

bacteriën bevatten geen kern en hebben meestal peptidoglycaan in hun celwand

protisten zijn eukaryoot, maar geen schimmel, plant of dier

schimmels zijn zonder uitzondering heterotroof

prokaryoten (bacteria en archaea) eukaryoten

DNA is circulair DNA is lineair

chromosoom in nucleoid: gebied van het chromosomen in nucleus
cytoplasma dat niet wordt omsloten door
een membraan

binary fission (aseksuele reproductie) mitose / meiose – (a)seksuele reproductie

,Planten en micro-organismen (B-B1PLMI20) - leerdoelen - deeltoets 2 - week 7

Uitleggen welke verschillende microbiologie tools er zijn en welke voor- en nadelen ze
hebben wat betreft hun toepasbaarheid.
microbiologie tools
● microscopie
○ lichtmicroscopie
■ Brightfield – celkleuringen (fuchsine, Gram)
■ fluorescentie – structuur kleuringen, reporter eiwitten
○ elektronenmicroscopie
■ SEM (scanning) – oppervlakte cellen/structuren
■ TEM (transmissie) – binnenkant en contouren cellen/structuren
● kweken: nutriënten, koolstofbronnen, (a)biotische factoren
○ petrischaal met agar en media
○ erlenmeyer met vloeibaar media
○ fermentoren
● sequencing: sanger (DNA van 1 organisme), metagenomics (meerdere organismen)
○ kan ook onafhankelijk van kweken (metagenomics)
○ DNA isoleren uit reincultuur (1 soort) of uit een omgevingssample of
microbioomsample (community)
○ detectie van moleculaire markers: PCR met universele primers tegen
■ 16 rRNA gen (bacteriën)
■ ITS – Internal Transcribed Spacer (schimmels)

Waarom microben kweken?
● bepalen met welke (nieuwe) soort men te maken heeft
○ morfologie m.b.v. microscopie
○ diagnostiek → selectieve media, experimenten
○ reincultuur → sequencing
■ taxonomie (sanger sequencing)
■ genoom analyse (short- and long read sequencing)

Hoe ga je te werk om een schimmel te identificeren?
● sanger sequencing ITS

er zijn verschillende soorten media die gebruikt worden om micro-organismen te kweken
● ongedefinieerd of rijk medium
○ bevat complexe ingrediënten, zoals gistextract en pepton (afgebroken
eiwitten), waardoor de samenstelling niet precies bekend is
● minimaal of gedefinieerd medium
○ heeft bekende hoeveelheden van alle ingrediënten

MacConkey-medium is zowel selectief als differentieel
● bevat galzouten en is daarom selectief voor gram-negatieve bacteriën
○ deze kunnen er wel op groeien, terwijl gram-positieve geremd worden
● is differentieel, omdat het als koolstofbron lactose en pepton bevat
○ als een bacterie lactose kan vergisten, wordt het medium zuur en kleurt roze

,Planten en micro-organismen (B-B1PLMI20) - leerdoelen - deeltoets 2 - week 7

Uitleggen wat het belang is van DNA-technieken voor het identificeren van
micro-organismen, beschrijven van de stappen van PCR en hoe PCR wordt toegepast voor
identificeren van micro-organismen.
belang van studie naar micro-organismen
● belangrijke mutualisten en ziekteverwekkers
● grote invloed op ecosystemen – rol in cycli van elementen
● producenten van toepasbare enzymen, medicijnen
● biologische bestrijdingsmiddelen
● voedselbereiding en -productie

DNA-technieken: micro-organismen worden geïdentificeerd zonder ze op te kweken
● bepaald gen amplificeren met de polymerase-kettingreactie (PCR)
○ er wordt een gen gebruikt met sterk conservatieve delen (die alle prokaryoten
hebben) en variabele domeinen (op grond waarvan je kunt identificeren)
○ er wordt vaak het gen gebruikt dat codeert voor het 16S-ribosomaal RNA,
een component van de kleine subeenheid van een prokaryotisch ribosoom
1. DNA isoleren
2. gen voor 16S rRNA amplificeren met PCR
3. sequensen DNA
4. vergelijken sequenties met die in database

metagenomics: sequensen van al het DNA uit de omgeving
● al het DNA isoleren, fragmenteren in stukken en die stukken sequensen
● mogelijk om organismen te vinden die geen of een afwijkend 16S-rRNA-gen hebben
○ geeft niet alleen beeld van prokaryoten, maar ook van virussen en eukaryoten
● mogelijk om informatie te krijgen over de genen die een organisme heeft
○ geeft meer informatie over het gevonden organisme

Uitleggen waarom het 16S rRNA gen en de ITS zo geschikt zijn voor het identificeren en het
aantonen van verwantschappen van bacteriën en schimmels.
moleculaire markers sequencen
● 16S (bacteriën – kleine subunit ribosoom) of ITS (schimmels)
○ ITS codeert niet voor eiwit → mutaties kunnen behouden worden
● onderdeel van het rDNA
● geconserveerd
● variabele stukken
● PCR (polymerase chain reaction) amplificatie met ‘universele’ primers
○ denaturatie (hoge temperatuur) → DNA strengen uit elkaar
○ 2 primers hechten op een bepaalde temperatuur aan de strengen
○ nucleotiden (bouwstenen), Taq polymerase
○ temperatuurcyclus: denatureren DNA → binden primers → verlengen DNA
○ herhalen → veel DNA → makkelijker te sequencen
● sequencen van PCR producten
● vergelijken met sequenties in database → al bekend of verwant aan bekende soorten
○ identificeren en verwantschap

, Planten en micro-organismen (B-B1PLMI20) - leerdoelen - deeltoets 2 - week 7

De verschillende fases in groeicurve benoemen en aangeven wat er tijdens fases gebeurt.

groeicurve

1. lagfase: bacteriën passen zich aan
de groeiomstandigheden aan
2. logfase: populatie groeit
exponentieel (y-as is een log-schaal,
waardoor het een rechte lijn is)
3. stationaire fase: populatie heeft
netto geen nieuwe bacteriën
4. afstervingsfase: aantal bacteriën
neemt af

Uitleggen en berekenen wat de generatietijd is.
generatietijd: tijd die een bacterie nodig heeft om zich te delen tijdens de exponentiële fase

Als het aantal cellen in 2 uur 16 is, heeft de bacterie zich 4 keer gedeeld. Dit gebeurde in
120 minuten. Het aantal minuten gedeeld door 4 is 30. De generatietijd is 30 minuten.

tijd (uur) aantal cellen

0 1

1 4

2 16

Uitleggen op welke manieren de hoeveelheid cellen in een cultuur worden bepaald en dit
toepassen.
plaattelmethode
● neem een 1 ml monster uit de oplossing en gebruik die voor een verdunningsreeks
1. plaats vanuit die verdunningen steeds 1 ml uit op een voedingsbodem
2. incubeer dit overnacht zodat er losse kolonies ontstaan
3. tel de kolonies om de concentratie in de oorspronkelijke cultuur te bepalen

Les avantages d'acheter des résumés chez Stuvia:

Qualité garantie par les avis des clients

Les clients de Stuvia ont évalués plus de 700 000 résumés. C'est comme ça que vous savez que vous achetez les meilleurs documents.

L’achat facile et rapide

Vous pouvez payer rapidement avec iDeal, carte de crédit ou Stuvia-crédit pour les résumés. Il n'y a pas d'adhésion nécessaire.

Focus sur l’essentiel

Vos camarades écrivent eux-mêmes les notes d’étude, c’est pourquoi les documents sont toujours fiables et à jour. Cela garantit que vous arrivez rapidement au coeur du matériel.

Foire aux questions

Qu'est-ce que j'obtiens en achetant ce document ?

Vous obtenez un PDF, disponible immédiatement après votre achat. Le document acheté est accessible à tout moment, n'importe où et indéfiniment via votre profil.

Garantie de remboursement : comment ça marche ?

Notre garantie de satisfaction garantit que vous trouverez toujours un document d'étude qui vous convient. Vous remplissez un formulaire et notre équipe du service client s'occupe du reste.

Auprès de qui est-ce que j'achète ce résumé ?

Stuvia est une place de marché. Alors, vous n'achetez donc pas ce document chez nous, mais auprès du vendeur Ribizlik. Stuvia facilite les paiements au vendeur.

Est-ce que j'aurai un abonnement?

Non, vous n'achetez ce résumé que pour €3,49. Vous n'êtes lié à rien après votre achat.

Peut-on faire confiance à Stuvia ?

4.6 étoiles sur Google & Trustpilot (+1000 avis)

69052 résumés ont été vendus ces 30 derniers jours

Fondée en 2010, la référence pour acheter des résumés depuis déjà 15 ans

Commencez à vendre!

Resume

Samenvatting Planten en micro-organismen - leerdoelen - deeltoets 2

Infos sur le Document

Sujets

École, étude et sujet

Vendeur

Avis reçus

Aperçu du contenu