Samenvatting van de werkcolleges (incl. uitwerkingen van de filmpjes How to in R) van het derdejaars vak Epidemiologie en economie in de bachelor Diergeneeskunde. Ook verkrijgbaar in bundel!
Inhoud:
- Werkcollege 1: Associatiematen en onderzoeksopzet
- Werkcollege 2: Lineaire modellen I – corre...
Aanneenncohort-studienzitennzowelognvoordelogennalogsnnadelogen:
Voordelogen:
o Denvologiordenklogopt:neerstnRF,ndannziekte.
o Effectnopnmeerderenziektenbestuderen.
Nadelogen:
o Onhandiinwanneernpeneennziektenhebtndienweiniinvoorkomt.nJenhebtndannerinveelogn
observatesnnodiinomnietsntenkunnennzeiiennovernhetnverschilogntussennbeideniroepen.
o Slogechtnteniebruikennwanneerneennziektenzichnloganizaamnontwikkelogd.nJenmoetndannerin
loganinobserveren.
o AlogsnpennietnweetnwatndenRFnvanneennbepaalogdenziektenzounkunnennzipn,nweetnpenooknnietn
hoenpendeniroepennmoetnopdelogen.nErnmoetndusnalognbestnhetneennennandernvanndenziekten
bekendnzipn.
Wanneerniebruiknpennouneenncase-controlognstudie?
eandii:
o Bipnzelogdzamenziektesn(efficiënt).
o Bipnzelogdzamenziektes:nORn~nRR.
o Alogsnpenieennideenhebtnvanndenrisicofactoren.
Nadeelog:
Samenvatend
Cohortnstudie:
o RRnuitntenrekenen.
o Nietnvoornzelogdzamenziektes.
o Associatentussenn1nRFnennvelogenziektes.
Case-controlognstudie:
o ORnuitntenrekenen.
o Welognvoornzelogdzamenziekten(enndannbenadertnORnhetnRR).
o Associatentussenn1nziektenennvelogenRF.
How to in R-script
Omntenbeiinnennmoetennwendendatabasenepibasixninstaloglogeren.nDezenzitnnamelogipknnietnstandaardninnR.n
Ditninstaloglogerennhoefnpenmaarnéénnkeerntendoen,nmaarnpenmoetnwelognelogkenkeerndezendatabasenopnieuwn
actverennmetnlibrary(iepibasix)!
a. Omndenassociatentussennvoerfrequentenennmaaitorsientenbestuderennkunnpenhetnbesten
iebruiknmakennvanneenncase-controlognstudie.nEennmaaitorsienisneennzelogdzamenaandoenini.
d. DenORnisnteninterpreterennalogsndenRR.nVoorndenirotenrassennielogdtndatndeniroepndienfrequentn
wordtnievoerdn0.212nmeernkansnheefnopnhetnontwikkelogennvanneennmaaitorsiendanndeniroepn
dieninfrequentnwordtnievoerd.nAndersniezeidnisndenkansnopnhetnontwikkelogennvanneenn
maaitorsien1/0.21n=n4.7nmaalogniroterninndeniroepndieninfrequentnwordtnievoerd.n
Voorndenklogeinenrassennielogdtndatndeniroepndienfrequentnwordtnievoerdn7.25nmeernkansnheefn
opnhetnontwikkelogennvanneennmaaitorsienverielogekennmetndeniroepndieninfrequentnwordtn
ievoerd.nInnditnievalognwarennernechternwelognweiniincases,nwatnhetnresulogtaatnonbetrouwbaarn
maakt.
a. Weniaanndenziektemaatnberekenenndienpastnbipnhetnoptredennvanndezenaandoenini.nOmdatnwe
tenmakennhebbennmetneennbinairenvariabelogen(ziek/nietnziek)nbinnennéénniroepn(katenninn
Nederlogand),nmakennweniebruiknvannprop.test:nprop.tiest(500,2000000):
b. eetnbetrouwbaarheidsintervalognieefnaanndatnern95%nkannisndatnbovenstaandenintervalognden
werkelogipkenkansnvannhetnoplogopennvannpology-neuropathienbevat.nDitnielogdtnaloglogeenntpdensnden
uitbraak.nJenhebtndusnnietnalogtpdndezenkans.
c. Omnerachterntenkomennwatndenmoielogipkenoorzaaknisnvanndenieobserveerdenverschipnselogennzoun
peniebruiknkunnennmakennvanneenncase-controlognstudie.nOoknhiernbetrefnhetnweerneenn
zelogdzamenziekte,nenndenuitbraaknisnalognvoorbipn(waardoorneenncohortnstudiennietnmeernkan).n
e. Wenwiloglogennnunwetennofndenassociatensiinifcantnis.nOmdatnwentenmakennhebbennmetntween
variabelogennpernexperimentelogeneenheidn(ziek/niet-zieknennvoernX/andernvoer)nmakennwen
iebruiknvanndenchi-kwadraatntest:nchisq.tiest(zienuw).
f. 99%nbetrouwbaarheidsintervalognvanndenLNn(oddsnrato):nBn±nz0.01nxnSEn=n2.952n±n2.58n
(standaardnbipn99%)nxn0.494.nDitnieefneennintervalognvann(1.68;n4.23).n
i. Omntotnhetn99%nbetrouwbaarheidsintervalognvanndenoddsnratontenkomennmoetnpendene-machtn
nemen:n(5.37-68.72).
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