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Samenvatting cursus: inleiding tot de biostatistiek

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(Behaalde score:15/20) Dit document bevat een beknopte samenvatting van de cursus, inclusief de extra informatie vermeld in de zelfstudie video's. Vermelding van paginanummers bij belangrijke concepten is zeer handig bij het open boek examen.

Aperçu 4 sur 61  pages

  • 1 juin 2024
  • 61
  • 2023/2024
  • Resume
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kaatvanderbauwhede
Hoofdstuk 1: inleiding.............................................................................................................................9
Falsificatieprincipe van Popper...............................................................................................9
Vals positieve & vals negatieve resultaten..............................................................................9
Double blinding.......................................................................................................................9
Hoofdstuk 2: belangrijke concepten & conventies: pg. 61......................................................................9
2.1 Inleiding.......................................................................................................................................9
2.2 Variabelen : pg. 64........................................................................................................................9
Kwalitatieve variabelen...........................................................................................................9
Kwantitatieve/numerieke variabelen....................................................................................10
2.4 Toevalsveranderlijken (of toevallige veranderlijken) : pg. 66......................................................10
2.5 Beschrijven van de populatie: pg. 66..........................................................................................10
2.5.1.2 Continue toevallig veranderlijke: pg. 72............................................................................10
Normaalverdeling.................................................................................................................10
2.5.1.2.1 Cumulatieve distributie: pg. 73..................................................................................11
2.5.1.2.2 Gemiddelde en variantie (& standaardafwijking) : pg. 76..........................................11
2.5.2 Standardisatie: pg. 78..........................................................................................................11
2.5.3 Achtergrond Normale verdeling: pg. 79...............................................................................12
Een (1- α)100% referentie-interval voor een veranderlijke X................................................12
2.6 Steekproef : pg. 83......................................................................................................................12
2.8 NHANES: Lengte: pg. 84..............................................................................................................12
2.8.1 Empirische distributie : pg. 85..............................................................................................12
2.8.2 Normale benadering: pg. 88................................................................................................12
Hoofdstuk 3: Studiedesign: pg. 95........................................................................................................12
3.2 Steekproefdesigns: pg. 97...........................................................................................................12
3.3 Experimentele studies: pg. 99.....................................................................................................13
Confounding: pg. 102............................................................................................................13
Gerandomiseerd gecontroleerde studie : pg. 103.................................................................13
3.3.2 Gerandomiseerde gecontroleerde studies: pg. 105.............................................................13
Systematische allocatie = toevallige allocatie : pg. 106.........................................................13
Randomisatietechnieken: pg. 106-108..................................................................................13
3.3.3 Parallelle designs : pg. 110...................................................................................................14
3.3.4 Cross-over designs: pg. 110.................................................................................................14
3.3.5 Factoriële designs : pg. 112..................................................................................................14
3.3.6 Quasi-experimentele designs: pg. 113.................................................................................14
3.4 Observationele studies: pg. 114..................................................................................................14
*Prognostische factoren : pg. 108.........................................................................................14

1

, Simpson’s paradox: pg. 116...................................................................................................15
3.5 Prospectieve studies : pg. 118....................................................................................................15
3.6 Retrospectieve studies : pg. 118.................................................................................................15
3.7 Niet-gecontroleerde studies: pg. 121..........................................................................................15
3.7.1 Pre-test/Post-test studies: pg. 121.......................................................................................15
3.7.2 Cross-sectionele surveys......................................................................................................15
Hoofdstuk 4: Data exploratie en beschrijvende statistiek: pg. 123.......................................................16
4.2 Univariate beschrijving van de variabelen: pg. 125.....................................................................16
4.3 Samenvattingsmaten voor continue variabelen: pg. 132............................................................16
4.3.1 Maten voor de centrale ligging: pg. 133..............................................................................16
Het (rekenkundig) gemiddelde: pg. 133................................................................................16
De mediaan : pg. 134............................................................................................................16
De modus: pg. 135................................................................................................................17
Geometrisch gemiddelde: pg. 136........................................................................................17
4.3.2 Spreidingsmaten: pg. 139....................................................................................................17
Variantie van een reeks waarnemingen : pg. 141.................................................................17
(Steekproef)Standaarddeviatie of standaardafwijking s : pg. 141.........................................18
Range: pg. 142......................................................................................................................18
Interkwartielafstand: pg. 142................................................................................................18
Variatiecoëfficiënt: pg. 142...................................................................................................18
4.4 De normale benadering van gegevens: pg. 142..........................................................................18
4.4.1 QQ-plots: pg. 143.................................................................................................................18
4.5 Samenvattingsmaten voor categorische variabelen : pg. 149.....................................................20
4.5.1 Prospectieve studies en lukrake steekproeven....................................................................20
Absolute risico verschil: pg. 149............................................................................................20
Relatief risico: pg. 150...........................................................................................................20
Relatief risico verschil : pg. 151.............................................................................................20
4.5.2 Retrospectieve studies : pg. 151..........................................................................................20
De odds op een gebeurtenis : pg. 152..................................................................................20
Odds ratio op een gegeven gebeurtenis: pg. 153..................................................................21
4.5.3 Rates versus risico’s : pg. 154...............................................................................................21
4.6 Associaties tussen 2 variabelen : pg. 155....................................................................................21
4.6.1 Associatie tussen 2 kwalitatieve variabelen :pg.155............................................................21
4.6.2 Associatie tussen 1 kwalitatieve en 1 continue variabele : pg. 155......................................21
4.7 Associatie tussen 2 continue variabelen: pg. 159.......................................................................22
4.7.1 Covariantie en correlatie : pg. 165.......................................................................................22

2

, Covariantie: niet-gestandardiseerd: pg. 165.........................................................................22
Correlatie: gestandardiseerd: pg. 165...................................................................................22
4.7.2 Pearson correlatie : pg. 166.................................................................................................22
4.7.2.1 Impact van outliers : pg. 168.........................................................................................23
4.7.2.1 De pearson correlatie pikt enkel lineaire associatie op : pg. 168..................................23
4.7.3 Verschillende groottes van correlaties : pg. 170...................................................................23
4.7.4 Spearman correlatie : pg. 172..............................................................................................24
Hoofdstuk 5: Statistische besluitvorming : pg. 177...............................................................................24
5.2 Captopril voorbeeld : pg. 178.....................................................................................................24
5.2.1 Proefopzet : pg. 179.............................................................................................................24
5.3 Puntschatters: het steekproefgemiddelde: pg. 186....................................................................24
5.3.2 Het steekproefgemiddelde is onvertekend: pg. 188............................................................25
5.3.3 Imprecisie/standard error : pg. 190.....................................................................................25
Noodzaak van onafhankelijkheid: pg. 194.............................................................................25
5.3.3.1 Variantie schatter voor 𝑋̄ (steekproefgemiddelde): pg. 195........................................26
Standaarddeviatie van 𝑋̄ = STANDARD ERROR = SE: pg . 195...............................................26
5.3.3.2 Standaarddeviatie vs standard error : pg. 196..............................................................26
Gemiddelden : pg. 198..........................................................................................................26
Standaarddeviatie : pg. 199..................................................................................................27
Standaard error van het gemiddelde : pg. 200......................................................................27
5.3.3.3 Normaal verdeelde gegevens : pg. 200.........................................................................27
5.3.4 Verdeling van het steekproefgemiddelde : pg. 202..............................................................27
5.3.4.3 Niet-normaal verdeelde data: de centrale limietstelling: pg. 207 + 291........................28
5.4 Intervalschatters : pg. 216...........................................................................................................28
5.4.1 Gekende variantie op de metingen : pg. 216.......................................................................28
95% betrouwbaarheidsinterval voor het populatiegemiddelde : pg. 217.............................28
5.4.1.2 Andere betrouwbaarheidsniveaus : pg. 222.................................................................28
Een (1- α)100% betrouwbaarheidsinterval voor een populatieparameter : pg. 223.............28
5.4.2 Ongekende variantie σ2 op de metingen: pg. 223................................................................29
5.5 Principe van Hypothesetoetsen (via one sample t-test) : pg. 230...............................................29
5.5.1 Introductie d.m.v. captopril voorbeeld : pg. 230..................................................................29
5.5.1.1 Permutatietest (voor one-sample t-test) : pg. 231........................................................30
5.5.1.2 Pivot : pg. 237...............................................................................................................30
5.5.1.4 Permutatietests zijn computationeel veeleisend: pg. 239.............................................30
5.5.3 Test-statistiek T (one sample t-test/gepaarde t-test): pg. 242..............................................30
5.5.4 De p-waarde : pg. 244..........................................................................................................31

3

, Significantieniveau : pg 245..................................................................................................31
5.5.5 Kritieke waarde : pg. 246.....................................................................................................31
5.5.6 Beslissingsfouten : pg. 248...................................................................................................31
5.5.6.1 Type 1 fout : pg. 248.....................................................................................................31
5.5.6.2 Type 2 fout : pg. 251.....................................................................................................31
De kracht van een test : pg. 251............................................................................................32
5.5.7 Conclusies Captopril voorbeeld : pg. 253.............................................................................32
5.5.8 Eenzijdig of tweezijdig toetsen : pg. 255..............................................................................32
5.6 Geclusterde metingen : pg. 260..................................................................................................33
5.7 Two-sample t-test : pg. 263.........................................................................................................33
Effectgrootte : pg. 267...........................................................................................................33
Variantie op het verschil : pg. 268.........................................................................................33
Standard error : pg. 268.......................................................................................................33
Gepoolde variantieschatter Sp2: pg. 268................................................................................35
Teststatistiek T (two sampe t-test) : pg. 269..........................................................................35
5.8 Aannames !!! : pg. 271................................................................................................................35
5.8.1 Nagaan van de veronderstelling van Normaliteit : pg. 271..................................................35
5.8.2 Nagaan van homoscedasticiteit : pg. 272.............................................................................36
Welch two-sample T-test : pg. 273........................................................................................36
Hoofdstuk 6 : Enkelvoudige lineaire regressie : pg. 277........................................................................36
6.2 Lineaire regressie : pg. 283.........................................................................................................36
6.3 Parameterschatting : pg. 285......................................................................................................36
Residuen ei : pg. 286.............................................................................................................37
Schatten van β1 en β2 : pg. 287............................................................................................37
6.4 Statistische besluitvorming : pg. 288..........................................................................................37
Mean squared error = MSE : pg. 291....................................................................................37
Standard error van de parameterschatters = SEβ0 en SEβ1 : pg. 291.......................................38
Betrouwbaarheidsinterval voor de helling en toetsen: pg. 291............................................38
6.5 Nagaan van modelveronderstellingen : pg. 293..........................................................................39
6.6 Afwijkingen van modelveronderstellingen : pg. 297...................................................................39
Transformatie van de verklarende variabele (predictor X) : pg. 297.....................................40
Transformatie van de uitkomst (respons Y) : pg. 298............................................................40
Interpretatie van de modelparameters na log2 tranformatie : pg. 301.................................40
6.7 Besluitvorming over gemiddelde uitkomst : pg. 304...................................................................40
Standard error op schatter voor de gemiddelde uitkomst : pg. 304......................................40
Teststatistiek T (voor gemiddelde uitkomst) : pg. 304...........................................................41

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