ACS BIOCHEMISTRY EXAM STUDY QUESTIONS AND ANSWERS UPDATED 2024
11 vues 0 fois vendu
Cours
ACS BIOCHEMISTRY
Établissement
ACS BIOCHEMISTRY
Henderson-Hasselbach Equation - pH = pKa + log ([A-] / [HA])
FMOC Chemical Synthesis - Used in synthesis of a growing amino acid chain to a polystyrene bead. FMOC is used as a protecting group on the N-terminus.
Salting Out (Purification) - Changes soluble protein to solid precipitate. Protei...
FMOC Chemical Synthesis - Used in synthesis of a growing amino acid chain to a
polystyrene bead. FMOC is used as a protecting group on the N-terminus.
Salting Out (Purification) - Changes soluble protein to solid precipitate. Protein
precipitates when the charges on the protein match the charges in the solution.
Size-Exclusion Chromatography - Separates sample based on size with smaller
molecules eluting later.
Ion-Exchange Chromatography - Separates sample based on charge. CM attracts +,
DEAE attracts -. May have repulsion effect on like charges. Salt or acid used to remove
stuck proteins.
Hydrophobic/Reverse Phase Chromatography - Beads are coated with a carbon chain.
Hydrophobic proteins stick better. Elute with non-H-bonding solvent (acetonitrile).
Affinity Chromatography - Attach a ligand that binds a protein to a bead. Elute with
harsh chemicals or similar ligand.
SDS-PAGE - Uses SDS. Gel is made from cross-linked polyacrylamide. Separates
based off of mass with smaller molecules moving faster. Visualized with Coomassie
blue.
SDS - Sodium dodecyl sulfate. Unfolds proteins and gives them uniform negative
charge.
Isoelectric Focusing - Variation of gel electrophoresis where protein charge matters.
Involves electrodes and pH gradient. Protein stops at their pI when neutral.
ACS BIOCHEMISTRY EXAM
, ACS BIOCHEMISTRY EXAM
FDNB (1-fluoro-2,3-dinitrobenzene) - FDNB reacts with the N-terminus of the protein to
produce a 2,4-dinitrophenol derivative that labels the first residue. Can repeat hydrolysis
to determine sequential amino acids.
DTT (dithiothreitol) - Reduces disulfide bonds.
Iodoacetate - Adds carboxymethyl group on free -SH groups. Blocks disulfide bonding.
Homologs - Shares 25% identity with another gene
Orthologs - Similar genes in different organisms
Paralogs - Similar "paired" genes in the same organism
Ramachandran Plot - Shows favorable phi-psi angle combinations. 3 main "wells" for α-
helices, ß-sheets, and left-handed α-helices.
Glycine Ramachandran Plot - Glycine can adopt more angles. (H's for R-group).
Proline Ramachandran Plot - Proline adopts fewer angles. Amino group is incorporated
into a ring.
α-helices - Ala is common, Gly & Pro are not very common. Side-chain interactions
every 3 or 4 residues. Turns once every 3.6 residues. Distance between backbones is
5.4Å.
Helix Dipole - Formed from added dipole moments of all hydrogen bonds in an α-helix.
N-terminus is δ+ and C-terminus is δ-.
ß-sheet - Either parallel or anti-parallel. Often twisted to increase strength.
ACS BIOCHEMISTRY EXAM
Les avantages d'acheter des résumés chez Stuvia:
Qualité garantie par les avis des clients
Les clients de Stuvia ont évalués plus de 700 000 résumés. C'est comme ça que vous savez que vous achetez les meilleurs documents.
L’achat facile et rapide
Vous pouvez payer rapidement avec iDeal, carte de crédit ou Stuvia-crédit pour les résumés. Il n'y a pas d'adhésion nécessaire.
Focus sur l’essentiel
Vos camarades écrivent eux-mêmes les notes d’étude, c’est pourquoi les documents sont toujours fiables et à jour. Cela garantit que vous arrivez rapidement au coeur du matériel.
Foire aux questions
Qu'est-ce que j'obtiens en achetant ce document ?
Vous obtenez un PDF, disponible immédiatement après votre achat. Le document acheté est accessible à tout moment, n'importe où et indéfiniment via votre profil.
Garantie de remboursement : comment ça marche ?
Notre garantie de satisfaction garantit que vous trouverez toujours un document d'étude qui vous convient. Vous remplissez un formulaire et notre équipe du service client s'occupe du reste.
Auprès de qui est-ce que j'achète ce résumé ?
Stuvia est une place de marché. Alors, vous n'achetez donc pas ce document chez nous, mais auprès du vendeur Bestzone. Stuvia facilite les paiements au vendeur.
Est-ce que j'aurai un abonnement?
Non, vous n'achetez ce résumé que pour €15,22. Vous n'êtes lié à rien après votre achat.
