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Résumé Semestre de Microbiologie L2 - S3
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Ensemble des cours rédigés et divisés en chapitres (avantage pour faire des fiches et bosser tranquille)
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MicrobiologieChapitre 1 : Présentation générale du règne fongique (Approches cellulaires,
physiologiques et génétiques)
Introduction à la microbiologie
La microbiologie est l’étude des microorganismes unicellulaire (taille inférieure à 0,1mm). Par
exemple chez les champignons, on peut considérer aussi bien la levure et les champignons de Paris
car ils sont proches phylogénétiquement parlant.
On retrouve dans la microbiologie :
- des unicellulaires procaryotes : bactéries et Archées,
- des unicellulaires ou pluricellulaires eucaryotes
- les virus (et apparentés)
➔ Les Virus :
Les Virus (virion, particule virale ou nucléocapside) possèdent un effet pathogène et également un
pouvoir infectieux. Selon le virus on a soit de l’ADN, soit de l’ARN (circulaire ou linéaire → ARN ou
ADN, monocaténaire ou bicaténaire → ADN). Ce matériel génétique est de petite taille (entre 10 et
100gènes). Les virus ont une structure icosaédrique, ou hélicoïdale ou complexe. Ils ne sont pas
visibles en microscopie optique mais uniquement en microscopie électronique. Ils sont capables de
traverser des pores de très petite taille, on parle d’entité ultra-filtrable (pore inférieur à 22µm). Le
virus a la capacité de pénétrer dans une cellules hôte. Une fois dans la cellule hôte, il va détourner le
fonctionnement de la machinerie cellulaire à son profit. Cela conduit à l’effet pathogène. La cellule
infectée va se mettre à produire de nouvelle particule virale, va être ensuite lésé afin de libérer les
particules virales produite qui iront infecter de nouvelles cellules.
➔ Les Viroïdes :
Les viroïdes sont des protéines dites protéines prions. On part d’une forme normale de protéine A
du système neveu central. Dans certaines conditions, elle peut changer de conformations et devenir
une forme anormale b inactive. Cette protéine devient don responsable de pathologie et infectieuse.
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, Microbiologie
Chapitre 1 : Présentation générale du règne fongique (Approches cellulaires,
physiologiques et génétiques)
➔ Procaryotes/ Eucaryotes
Les procaryotes contrairement aux eucaryotes ne possèdent pas de noyau. Chez les procaryotes, il y
a qu’un seul chromosome circulaire, chez les eucaryotes, il y a plusieurs chromosomes linéaires. Chez
les eucaryotes, on trouve des mitochondries (et chez certains des chloroplastes). Chez les
procaryotes, on trouve les archées et les bactéries.
Chez les eucaryotes, on trouve :
- Les métazoaires (animaux) → pluricellulaires → absences de paroi cellulaire
- Les plantes → pluricellulaires ou unicellulaire (algue verte) → présence de paroi
pectocellulosique → lignée verte : chlorophylle.
- Les champignons → pluricellulaires ou unicellulaires → présence de glucane et de chitine
- Les algues (chromistes = toutes les algues sauf les vertes) → unicellulaires ou
pluricellulaire→ paroi pectocellulosique
- Les protozoaires (protistes) → unicellulaires → pas de paroi
Introduction aux champignons :
Les champignons sont des eucaryotes, constitués d’une paroi de chitine et de glucane et qui sont
hétérotrophes au CO2. Ils possèdent une structure peu différenciée (pas de feuille, as de tige…).
Historiquement les champignons étaient considérés comme des thallophytes cryptogames. Les
thallophytes sont un groupe polyphylétique d'organismes non mobiles décrits comme des « plantes
inférieures », non vascularisées, sans feuille, ni tige, ni racine, possédant un corps indifférencié : le
thalle. Le mot cryptogame signifie que les organes reproducteurs sont cachés ou peu apparent.
De nos jours un champignon est un règne à part. Ils appartiennent au règne fongique.
I. Caractères fondamentaux du règne fongique
1. Organismes eucaryotes
Les eucaryotes possèdent un noyau. Il y a donc nécessité d’envoyer des messages du cytoplasme
vers le noyau, et du noyau vers le cytoplasme.
Les champignons possèdent des filaments ou hyphes sur lesquels on trouve l’article apical qui
permet la croissance (via la mitose = division cellulaire) et l’excrétion.
Dans cet article apical on trouve :
- Des mitochondries abondantes (= rôle dans la respiration)
- Des vacuoles (= permettent le stockage)
- Des peroxysomes (= organite entouré par une membrane qui permet de détoxifier la cellule
en dégradant certaines molécules)
- Un noyau entouré d’une enveloppe nucléaire (= membrane nucléaire interne + membrane
nucléaire interne).
- Des vésicules
- Une membrane cytoplasmique
- Une paroi
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Chapitre 1 : Présentation générale du règne fongique (Approches cellulaires,
physiologiques et génétiques)
L’ensemble des hyphes s’appelle le mycélium ou colonie mycélienne. Il s’agit de l’appareil végétatif
du champignon. La croissance des champignons est synchrone.
2. Paroi cellulaire avec chitine
La paroi cellulaire des champignons est constituée de chitine et de glucanes.
Selon les champignons, la composition de la paroi varie. Plus on s’approche de l’article apical plus la
paroi est fine.
La croissance des hyphes des champignons filamenteux est :
- polaire et apicale.
- Se déroule au niveau de l’apex de l’article apical de l’hyphe, lieu où la paroi n’est pas encore
organisée en microfibrilles et ou la paroi est peu rigide (voir absente).
- Permise par d’importants courants cytoplasmiques qui sont dirigés vers l’apex ce qui
constitue le moteur de la croissance.
Au niveau de la membrane cytoplasmique de l’apex aboutissent de nombreuses vésicules apportant
les matériaux nécessaires à sa constitution.
Les matériaux (chitines glucanes, protéines de structure, …) vont se rigidifier en se polymérisant
(réticulation) pour former la paroi mature de la partie subapicale de l’hyphe terminal.
On suppose qu’à l’extrémité de l’apex, il n’y a pas d’élément pariétaux ce qui favorise à la fois la
croissance mais aussi la sécrétion de grosses molécules en particulier des protéines.
Chez les champignons filamenteux croissance, biosynthèse et sécrétion de protéines sont
étroitement liés.
Chez la levure, il y a bourgeonnement puis séparation ce qui donne la cellule fille.
L’arrêt de la croissance s’appelle la sénescence, cela est lié au vieillissement cellulaire.
Au bout de 7 à 8 divisions la cellule devient incapable de croître et de se diviser, cela conduit à sa
mort.
3. Mode de vie hétérotrophes
Les champignons sont des hétérotrophes vis-à-vis du carbone. Ils vont chercher de la matière
organique. Ils peuvent trouver cette matière organique de différentes façons :
- Ils peuvent utiliser de la matière organique morte : saprophytes ou nécrotrophes.
- Ils peuvent utiliser de la matière organique vivante : parasites ou biotrophes.
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, Microbiologie
Chapitre 1 : Présentation générale du règne fongique (Approches cellulaires,
physiologiques et génétiques)
II. Caractères additionnels
1. Nutrition par absorption
A l’apex, le champignon va s’écrêter des enzymes hydrolytiques. Ces enzymes vont hydrolyser les
macromolécules afin d’obtenir de nutriments de petite taille qui pourront être diffusé dans les
parois. Les champignons se nourrissent de matières organiques présentes dans leur environnement
en sécrétant des enzymes qui attaquent et « digèrent » (hydrolyse) les divers composés organiques
en les réduisant en petites molécules solubles.
Les champignons absorbent la matière organique : les molécules hydrolysées par l’action des
enzymes exo-cellulaires se diffusent à travers les parois et les membranes cellulaires.
A. Les Champignons nécrotrophes
Les champignons nécrotrophes [nécrotrophisme] sont des champignons qui se développent aux
dépend de la matière organique en décomposition (litière, bois mort, excréments…). Ils recyclent les
éléments organiques à la surface de la planète. Ils sont également appelés saprophytes.
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