Samenvatting op basis van mijn notities, de slides en het boek. Achteraan zijn er een aantal oefenvragen terug te vinden die al dan niet op Sofia staan. Voor de richtingen Biomedische Wetenschappen en Tandheelkunde, deze behandelen dezelfde leerstof. :))
● Carboxylgroep ( -COOH) op c1, hieruit verder nummeren
● Alpha-koolstof waar -coo en aminogroep op staan
Niet polaire, alifatische R-groepen
= structuren die geen aromatische ring bevatten
- Inert
- Niet polair ⇒ hydrofoob = drijvende kracht waar een eiwit opvouwt
- Geen functionele groepen
● Glycine (Gly), (G)
○ Kleinste aminozuur, heeft geen zijketen, enkel H ⇒ grote conformationele
flexibiliteit in eiwitketen
○ Niet-asymmetrisch (enige az)
● Alanine (Ala), (A)
○ Zijketen: CH3
○ In Vitro Mutagenese ⇒ ‘Waar liggen de plekken in het eiwit de
kenmerken/cruciale dingen bepalen?’ = moeilijk te bepalen
■ Men steekt deze kenmerken + DNA in plasmide ⇒ hiervan kan men
codons van veranderen = bepaalde aminozuren veranderen door een
ander
■ ‘Waarom geen glycine gebruiken?’ Omdat deze structuur van eiwit
kan veranderen door flexibiliteit dus daarom op 1 na kleinste
aminozuur gebruiken
● Valine (Val), (V)
○ Restgroep: C3H7
● Leucine (Leu), (L)
○ Restgroep: C4H9
● Methionine (Met), (M)
○ Restgroep: C3H7S
, ● Isoleucine (Ile), (I)
○ Restgroep: C2H5
Ala, Val, Leu, Met en Ile:
- Dragen geen functionele groepen
- Zijketens hebben neiging te clusteren ⇒ stabilisatie eiwit tegen hydrofobe interacties
- Verschillende vormen dragen bij tot vorm eiwit door ruimte-inname
Polaire, niet-geladen R-groepen
= Polair door toevoeging van halogenen in R-groep
● Serine (Ser) (S)
○ Restgroep: CH2OH
○ Vorming van H-bruggen adhv -OH ⇒ structuur en interacties eiwitten
○ Kan gefosforyleerd worden ⇒ functie eiwit, signaaltransductie
○ Polair door -OH
● Cysteïne (Cys) (C)
○ Restgroep: CH2SH
○ SH-groep (sulfhydryl) zorgt voor polariteit
○ Pka ≈ 8, ionisatie op licht alkalische pH
○ In oxidatie 2 cys wordt door disulfidebrug verbonden tot cystine ⇒ dit kan
ook binnen eiwit wat zorgt voor stabiele 3D-structuur
○ Belangrijk binnen katalytisch centra enzymen: de ionisatie van SH zorgt voor
een sterk nucleofiele zwavelgroep = zeer reactief
● Proline (Pro) (P)
○ Restgroep: vormt ringstructuur, C3H6
○ Door ring geen vrije rotatie mogelijk tussen N en C
○ Vormen van bochten in peptideketens ⇒ meer complexiteit
○ Trans-structuur is stabieler, maar cis-structuur verschilt ook niet heel hard ⇒
bij cis ontstaat knik
○ Gematigd polair
● Asparagine (Asn) (N)
○ Restgroep: heeft carbonzuuramidegroep, CH2CONH2
○ Amide van asparaginezuur
○ Via zijketen H doneren/accepteren bij vorming H-bruggen
, ● Glutamine (Gln) (Q)
○ Restgroep: heeft carbonzuuramidegroep, C2H4CONH2
○ Amide van glutaminezuur
○ “
● Histidine (His) (H)
○ Restgroep: vormt ringstructuur =Imidazol ⇒ Pka ≈ 7
○ Bij fysiologische Ph is 50/50 ongeladen/geladen
○ ‘Zwitsers zakmes’ want zowel zeer nucleofiel als elektrofiel
○ Ook populair in katalytische centra door nucleofiele N
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
√ Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, Bancontact of creditcard voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper EmilieBMW. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €4,00. Je zit daarna nergens aan vast.