100% tevredenheidsgarantie Direct beschikbaar na je betaling Lees online óf als PDF Geen vaste maandelijkse kosten
logo-home
Samenvatting en uitwerking van alle examenvragen van het vak Concepts of Protein technology and applications (17/20) €18,99
In winkelwagen

Tentamen (uitwerkingen)

Samenvatting en uitwerking van alle examenvragen van het vak Concepts of Protein technology and applications (17/20)

 7 keer verkocht

Samenvatting en uitwerking van alle examenvragen van het vak Concepts of Protein technology and applications (17/20): Dit is een compacte samenvatting van alle oude en recente examenvragen van het vak Concepts of Protein technology and applications. Het omvat de meest belangrijke informatie die te ...

[Meer zien]

Voorbeeld 3 van de 16  pagina's

  • 18 september 2023
  • 16
  • 2023/2024
  • Tentamen (uitwerkingen)
  • Vragen en antwoorden
Alle documenten voor dit vak (23)
avatar-seller
lemmeslodders
VRAGEN CONCEPTS ORIGINEEL EXAMEN 1E
ZIT




VRAAG 9 = IS GESCHRAPT DUS MOETEN WE NIET KENNEN!!!!




Voor het inhaalexamen van mijn jaar 1e zit (1e Ma, 1e semester,
2022-2023)  Kwamen er heel wa vragen terug van die voorbeeld
examenvragen da hij er zelf had opgezet op BB  maar net voor
het inhaalexamen heeft hij dit er af gedaan en het staat er nog altijd
niet op dus  mss voor 2de zit  de moeite om is te bezien & ook
nog vragen uitwerken!!!




HOOFD VRAGEN:

1) Vraag 1: 2D-DIGE:  Principle, advantages/disadvantges, sample prep (8p):
Concept uitleggen + Advantages en Disadvantages geven & Sample prep een Protocol (zowa sample prep
en van heel het proces alle stappen doen denk) ervoor uitwerken:

Antwoord: CONCEPT

,Differential in gel electrophoresis (2D-DIGE): It involves 2D-GE separation of pre-labeled
fluorescent samples. Three dyes are imployed: Control (internal standard, Cy2), Cy3 and Cy5.
They all have the same mass so they don’t influence the separation and they have the same
hydrophobicity. By looking at a different wavelength you can see the different dyes:
differential fluorescent scanning generates a quantitative multiplexed output. Cy dye
fluorophore containing an NHS ester  it covalently binds to Lys of target protein via an
amide link. Trypsine digestion can be used afterwards because you won’t be adding the dyes
in a high amount. The cy2 image will be identical in both samples because it contains a bit of
both samples. It’s also a normalization tool. You can compensate the signal based on the cy2
image. Now you can run 3 samples on one gel: 2 you want to quantify and 1 internal
standard, instead of making separate gels.

Some dyes prefer certain proteins so you should also do a reverse dye: switching all labels so
you avoid mistakes. In the analysis:




 Yellow spots: intensities of red & green were roughly the same

 Red spots: high signal red, low signal green  differential spot: upregulated in sample with red dye

 Green spots: high signal green, low signal red  differential spot: upregulated in sample with green
dye



Take home points:

 DIGE  Involves 2D GE separation of pre-labeled fluorescent samples

 Three dyes employed Control (Cy2, internal standard), Cy3, Cy5

,  Cy2, Cy3 and Cy5 labeled samples are multiplexed and co-run on 2D GE

 Differential fluorescent scanning generates a quantitative multiplexed 2D GE output

 Cy dye fluorophore containing an NHS ester  it covalently binds to Lys of target
protein via an amide link.



Advantages en Disadvantages:

Advantages:
1) Good for hydrophobic protein analysis & post-translational analysis

2) It overcomes limitations in traditional 2D electrophoresis that are due to inter-gel
variation. This can be considerable even with identical samples. Since the proteins
from the different sample types (e.g. healthy/diseased, virulent/non-virulent) are run
on the same gel they can be directly compared. To do this with traditional 2D
electrophoresis requires large numbers of time-consuming repeats.



3) In experiments comprising several gels, a common technique is to include an internal
standard in each gel. The internal standard is prepared by mixing together several or
all of the samples in the experiment. This allows the measurement of the abundance
of a protein in each sample relative to the internal standard. Since the amounts of
each protein in the internal standard is known to be the same in every gel, this
method reduces inter-gel variation.



Disadvantages:

Je moet die Cy2, Cy3 en Cy5 toevoegen als extra stap. Dat hoef je bij gewone 2D-GE page
niet te doen  Dus dat is meer sample manipulation compared to simple 2D page

Dit zijn jouw voordelen als je samenvattingen koopt bij Stuvia:

Bewezen kwaliteit door reviews

Bewezen kwaliteit door reviews

Studenten hebben al meer dan 850.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet jij zeker dat je de beste keuze maakt!

In een paar klikken geregeld

In een paar klikken geregeld

Geen gedoe — betaal gewoon eenmalig met iDeal, Bancontact of creditcard en je bent klaar. Geen abonnement nodig.

Focus op de essentie

Focus op de essentie

Studenten maken samenvattingen voor studenten. Dat betekent: actuele inhoud waar jij écht wat aan hebt. Geen overbodige details!

Veelgestelde vragen

Wat krijg ik als ik dit document koop?

Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.

Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?

Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.

Van wie koop ik deze samenvatting?

Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper lemmeslodders. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.

Zit ik meteen vast aan een abonnement?

Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €18,99. Je zit daarna nergens aan vast.

Is Stuvia te vertrouwen?

4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)

Afgelopen 30 dagen zijn er 68175 samenvattingen verkocht

Opgericht in 2010, al 15 jaar dé plek om samenvattingen te kopen

Start met verkopen
€18,99  7x  verkocht
  • (0)
In winkelwagen
Toegevoegd