LECTURE NOTES: VIDEO PART 4 OF BIOCHEMISTRY (BIOSCI98) AT UCI
7 keer bekeken 0 keer verkocht
Vak
Biochemistry (BIOSCI98)
Instelling
University Of California - Irvine
Notes on lecture video part 4 of Biochemistry course (BIOSCI98) at University of California, Irvine. Completed between weeks 4 and 6 of Winter 2018 quarter.
Part 4 - Video Lecture Notes
Sunday, February 10, 2019 1:27 PM
Purification Analysis
Reason To purify a protein To check if sample is
Protein Sequencing (identifying the sequence) pure
What happens after Continue w/ purification Discard sample that was
technique? analyzed
• Step #1: Cut up proteins into smaller peptides using proteases. Researcher can mon
How much sample is Entire sample is used As small a portion as protein purification: #
used? possible. bands decrease after
○ Sequence each peptide cut by a protease, sequence peptides cut by another protease.
Examples Column Chromatography PAGE (electrophoresis) fractionation step.
Precipitation: Salt Fractionation, pH SDS-PAGE
○ Traditional method is to sequence one protein at a time using Edman's degradation. change 2D PAGE?
Antibody-based: Western Blots,
Immunoprecipitation
○ Modern method is to sequence multiple proteins at a time using Mass Spectrometry. (Proteomics)
• Identify amino acids of each peptide fragment.
○ Edman's degradation: Remove each N-terminus a.a. from one end IN ORDER.
○ Mass spec: sequencing multiple peptides RANDOMLY.
• Once sequence of each fragment is known, determine order of fragments:
○ Cut same protein w/ different proteases.
○ Sequence both set of peptides.
○ Find first peptide of one set of peptides. Find the corresponding peptide in the other set.
○ Find the next peptide in the first set by determining which peptide is overlapping with the other set.
○ Continue with all the fragments-> peptides should have the same a.a. sequence and order as original
protein!
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
√ Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, Bancontact of creditcard voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper PrinceAlixD. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €2,91. Je zit daarna nergens aan vast.
