WORKSHOP3:
OVERLEVINGSANALYSE
OEFENINGEN DEEL 1
1. Bereken de Ŝ(t) op elk moment.
- 𝑛𝑗 = aantal personen at risk vlak voor het j-de sterfmoment
- 𝑚𝑗 = aantal doden/gebeurtenissen op tijdstip 𝑡(𝑗)
- 𝑞𝑗 = aantal gecensureerde observaties tussen het j-de en (j+1)ste
sterfmoment
Weten niet of hij dood of levens is want gecensureerd
Met Q geen rekening houden => wordt afgetrokken
Formule: S(tj)= S(tj-1)*((nj-mj)/nj)
tj nj mj qj Ŝ(tj)
0 21 0 0 (21-0)/21=1 (altijd)
6 21 3 1 1*(21-3)/21=0.85
7 17 1 1 0.85*(17-1)/17=0.81
10 15 1 2 0.81*(15-1)/15=0.75
13 12 1 0 0.75*(12-1)/11=0.69
16 11 1 3 0.69*(11-1)/11=0.63
22 7 1 0 0.63*(7-1)/7=0.54
23 6 1 5 0.54*(6-1)/6=0.45
2. Beschouw een eenvoudig voorbeeld van vijf kankerpatiënten die
deelnemen aan een klinische studie, zoals geïllustreerd in het
volgende diagram:
a. Herschrijf deze overlevingstijden in termen van patiënttijd en maak
een eenvoudige dataset met de overlevingstijd en status voor elke
patiënt.
SPSS:
, b. Hoeveel patiënten zijn er overleden? 3
c. Hoeveel persoonsjaren zijn er in deze studie? 5+5+4+3+1=18
d. Wat is de gemiddelde hazard op sterfte of het sterftecijfer per
persoonsjaar?
Formule: totaal #falen/som vd geobserveerde overlevingstijden
H=3/18=0.17
3. Wat is je conclusie op basis van onderstaande figuur en de resultaten
van de log-rank test?
KM-curves: lopen samen tot mediane overlevingstijd (0.5)
log rank test onderzoekt of de 2 KM-curves van elkaar verschillen
- H0: er is geen verschil in de KM-curves tussen de 2 behandelingen
P=0.2519 >0.05
Nulhypothese NIET verwerpen
Geen significant verschil tussen therapie 1 en 2
OEFENINGEN DEEL 2 IN SPSS
In de datafile ‘Shinsplints_workshop_survival.sav’ kan je de resultaten vinden van
een onderzoek bij 188 atleten naar risicofactoren op shinsplints, een
overbelastingsletsel ter hoogte van het onderbeen. Op moment van start van de
studie werden lopers getest op een aantal mogelijke risicofactoren om dan te
onderzoeken welke risicofactoren bijdragen aan het ontstaan van shinsplints. Daarna
werden ze gevolgd in de tijd en werden letsels geregistreerd.
OVERLEVINGSANALYSE
OEFENINGEN DEEL 1
1. Bereken de Ŝ(t) op elk moment.
- 𝑛𝑗 = aantal personen at risk vlak voor het j-de sterfmoment
- 𝑚𝑗 = aantal doden/gebeurtenissen op tijdstip 𝑡(𝑗)
- 𝑞𝑗 = aantal gecensureerde observaties tussen het j-de en (j+1)ste
sterfmoment
Weten niet of hij dood of levens is want gecensureerd
Met Q geen rekening houden => wordt afgetrokken
Formule: S(tj)= S(tj-1)*((nj-mj)/nj)
tj nj mj qj Ŝ(tj)
0 21 0 0 (21-0)/21=1 (altijd)
6 21 3 1 1*(21-3)/21=0.85
7 17 1 1 0.85*(17-1)/17=0.81
10 15 1 2 0.81*(15-1)/15=0.75
13 12 1 0 0.75*(12-1)/11=0.69
16 11 1 3 0.69*(11-1)/11=0.63
22 7 1 0 0.63*(7-1)/7=0.54
23 6 1 5 0.54*(6-1)/6=0.45
2. Beschouw een eenvoudig voorbeeld van vijf kankerpatiënten die
deelnemen aan een klinische studie, zoals geïllustreerd in het
volgende diagram:
a. Herschrijf deze overlevingstijden in termen van patiënttijd en maak
een eenvoudige dataset met de overlevingstijd en status voor elke
patiënt.
SPSS:
, b. Hoeveel patiënten zijn er overleden? 3
c. Hoeveel persoonsjaren zijn er in deze studie? 5+5+4+3+1=18
d. Wat is de gemiddelde hazard op sterfte of het sterftecijfer per
persoonsjaar?
Formule: totaal #falen/som vd geobserveerde overlevingstijden
H=3/18=0.17
3. Wat is je conclusie op basis van onderstaande figuur en de resultaten
van de log-rank test?
KM-curves: lopen samen tot mediane overlevingstijd (0.5)
log rank test onderzoekt of de 2 KM-curves van elkaar verschillen
- H0: er is geen verschil in de KM-curves tussen de 2 behandelingen
P=0.2519 >0.05
Nulhypothese NIET verwerpen
Geen significant verschil tussen therapie 1 en 2
OEFENINGEN DEEL 2 IN SPSS
In de datafile ‘Shinsplints_workshop_survival.sav’ kan je de resultaten vinden van
een onderzoek bij 188 atleten naar risicofactoren op shinsplints, een
overbelastingsletsel ter hoogte van het onderbeen. Op moment van start van de
studie werden lopers getest op een aantal mogelijke risicofactoren om dan te
onderzoeken welke risicofactoren bijdragen aan het ontstaan van shinsplints. Daarna
werden ze gevolgd in de tijd en werden letsels geregistreerd.
