Samenvatting
Samenvatting zelfstudie EBC
- Instelling
- Universiteit Utrecht (UU)
Samenvatting van alle zelfstudiestof van EBC
[Meer zien]Voorbeeld 4 van de 46 pagina's
Voorbeeld 4 van de 46 pagina's
In winkelwagengesponsord bericht van onze partner
Gekoppeld boek
Titel boek:
Auteur(s):
- Uitgave:
- ISBN:
- Druk:
Voorbeeld van de inhoud
Zelfstudie 1Signal transduction depends on molecular circuits
1. Vrijlating van primaire messengers → door een trigger bv. wond
2. Ontvangen van primaire messenger → aan membraanreceptor die conformatie
ondergaat en informatie van omgeving naar inhoud van cel stuurt
3. Heruitzending door second messenger → worden geactiveerd door
conformatieverandering van receptor
a. Consequenties van second messengers:
b. Kunnen door heel de cel diffusseren en bv. genexpressie beïnvloeden
c. Signaal kan geamplificeerd worden, lage concentratie van signaalmoleculen
in omgeving kan dus grote intracellulaire signaal en reactie opwekken in cel.
4. Activatie van effectors die direct de fysiologische reactie veranderen, zoals pompen
en enzymen transcriptiefactoren
5. Verwijdering van signaal. Anders verliezen cellen hun reactie op nieuwe signalen, of
krijg je ongecontroleerde celgroei en kanker
Eicosanoid hormones are derived from polyunsaturated fatty acids
- Arachidonate, 20:4 vetzuur van linolaat
- Alle signaalmoleculen die hieruit afstammen heten
eicosanoids omdat ze 20 C-atomen hebben
- Het zijn lokale, autocriene, kort levende hormonen
- Prostaglandine stimuleert onder andere: inflammatie,
bloeddoorstroming naar organen, ion transport across
membraan, moduleren van synaptische transmissie
en induceren van slaap.
Steroid hormones are crucial signal molecules
- Binden en activeren transcriptiefactoren
- Androgene → mannelijke secundaire kenmerken
- Testosteron gereduceerd naar dihydrotestosteron
- Estrogens → vrouwelijke secundaire kenmerken
- Glucocorticoïden → gluconeogenese en opbouw
glycogeen
- Mineralocorticoïden (aldosteron) → bloeddruk
Gene expression is regulated by hormones
, - Nucleaire hormoon receptoren zijn oplosbaar want zitten in kern ipv membraan en
reguleren genexpressie door aan reguliere DNA sequentie te binden.
- Hebben 4 domeinen: amino terminal activation domain (AF1), DNA binding domain,
hinge domain(stuurt receptor naar nucleus) en ligand-binding domain met activatie
domain (AF2)
- Zinc-finger domains: cysteïne residuen in DNA binding domain binden zink ionen in
DNA
- Ligand binding allows de receptor om andere eiwitten aan te trekken die transcriptie
faciliteren door interactie met de activatie domeinen
- Coactivators(p16 familie): eiwitten die binden nadat ligand gebonden heeft. Samen
met andere eiwitten modificeren ze chromatine en de transcriptiemechanismen om
genexpressie te reguleren
- Als er geen ligand is dan zijn corepressor eiwitten gebonden aan binding domein van
coactivators op receptor. Als ligand bindt, ontbindt corepressor en kunnen
coactivators binden
- Agonisten binden aan nucleaire hormoonreceptor en activeren signaaltransductiepad
en antagonisten inhiberen juist dit pad.
Q: ze moeten door membraan heen
Receptor proteins transmit information into the cell
- Ongeactiveerd heeft G-protein GDP(een soort guanyl nucleotide) gebonden en is het
een heterodimeer van alfa, beta en gamma subunits. Alfa bindt de nucleotide.
- Ligand bindt aan receptor en dit complex interacteert met het G-protein en opent de
nucleotide bindingssite, waardoor GDP eruit gaat en GTP kan binden aan
bindingssite → alfa subunit laat los van beta en gamma → Galfa bindt aan adenylate
cyclase etc….
- 15 genen coderen voor Galfa, eentje wordt algemeen expressed en de andere
worden expressed in specifieke celtypen
- Galfa subunits hebben intrinsieke GTPase activiteit waardoor ze hun eigen GTP
kunnen hydrolyseren tot GDP. Dit gebeurt spontaan. AlfaG met GDP bindt dan weer
aan beta en gamma G
- Receptor gaat weer terug naar oude vorm doordat ligand loslaat. De kans dat de
receptor in ongebonden vorm blijft, hangt af van de concentratie van ligand in
omgeving
Q: cAMP en IP3 zijn vrij en DAG blijft in membraan
Q: in verschillende celtypen activeert PK-A verschillende andere eiwitten
Calcium ion is a ubiquitous cytoplasmic messenger
- Calmodulin wordt geactiveerd door binding van Ca²⁺ aan zijn 4
bindingssites, wanneer de cytoplasmatische calcium level is verhoogd
- Calmodulin is een EF-hand eiwit.
- Ca²⁺-calmodulin complex stimuleert een wijde variëteit aan enzymen,
pompen en andere eiwitten
- Targets van Ca²⁺-calmodulin complex zijn CaM kinase en Ca²⁺-ATPase
pomp(pompt Ca²⁺ de cel uit)
,Some receptors dimerize in response to ligand binding and recruit tyrosine kinases
- Conformatie van GPCR is een verandering in tertiaire structuur en dimeer vorming is
verandering in quaternaire structuur
- Voorbeeld groeihormoon receptor. Één groeihormoon bindt aan het extracellulaire
domein van 2 receptoren, waardoor die dimeriseren. Extracellulaire domeinen komen
hierdoor ook bij elkaar en ook de daarbij geassocieerde tyrosine protein kinases, die
aan elk intracellulair domein is gebonden. Hierdoor fosforyleren ze elkaar(cross
fosforylatie) waardoor de kinases worden geactiveerd die weer andere eiwitten
fosforyleren.
- Sommige groeifactoren(zoals EGF) binden aan de extracellulaire domeinen van
transmembrane receptoren die tyrosine kinase domeinen in hun extracellulaire
domeinen hebben. Deze receptor tyrosine kinases (RTKs) signaleren op dezelfde
manier als hierboven. Plaatje laat specifiek zien voor EGF.
- Grb-2 is een adaptor eiwit.
- Uiteindelijk worden kinases geactiveerd
- Sos is een guanine-nucleotide exchange factor (GEF). Opent de nucleotide-binding
pocket van RAS waardoor GDP eruit gaat en GTP erin
- Ras valt onder de kleine G-proteïnen(small GTPases) → reguleert celgroei.
- Wisselen tussen GDP en GTP gebonden en zijn monomerisch ipv dimeer(zoals
G-protein)
- Hebben ook intrinsieke GTPase activiteit voor verwijdering van signaal.
GTPase-activating proteins(GAPs) helpen hierbij.
Metabolisme in context: insulin signaling regulates metabolism
- Insuline wordt vrijgelaten door beta-cellen in pancreas na eten
- Insuline receptor is een tyrosine kinase receptor, maar verschilt omdat het altijd
in een dimeer vorm is en niet alleen met insuline gebonden. Zwarte streepjes op
plaatje is disulfidebinding
- Als insuline bindt vindt cross fosforylering van beide kinases plaats. Kinases
fosforyleren andere delen van receptor waar andere eiwitten binden zoals
insuline-receptor substraten (IRS). IRS worden ook
gefosforyleerd door de kinases van de insuline
receptor.
- IRS is adaptor protein en wordt herkend door
andere eiwitten. P-3-kinase fosforyleert PIP2 tot
PIP3 (ATP nodig). PIP3 activeert PDK1 en die
activeert Akt(ook wel protein kinase B)
, - Akt fosforyleert alle enzymen voor glycogeen synthese en ook GLUT4 die
naar membraan gaat en glucose de cel in laat gaan
- Kijk waar amplificatie is!
- Verwijdering van insuline signaal: Tyrosine fosfatases verwijderen fosforyl
groep van tyrosine residuen op insuline receptor. Lipide fosfatases
hydrolyseren PIP3 naar PIP2. Serine fosfatases verwijderen fosforyl groep
van geactiveerde kinases zoals Akt. Veel van deze fosfatases worden al
geactiveerd als insuline aan de receptor bindt.
Q: Serine en threonine
Defects in signaling pathways can lead to diseases
- Proto-oncogene zijn vaak signaaltransductie eiwitten. Bij mutatie kan
ongecontroleerde celgroei ontstaan en heet het een oncogen.
- Gemuteerde Ras heeft geen intrinsieke GTPase activiteit en staat dus altijd
aan en dus continue cel groei.
- Gemuteerde of overexpressed tyrosine kinases receptoren leiden ook tot
tumoren. Medicijn is antilichamen die aan receptor binden waardoor ligand
niet kan binden of receptor niet conformatie kan veranderen.
- Beide genen van tumor suppressor genen gemuteerd → celgroei wordt niet
geïnhibeerd. Tumor suppressor eiwitten stoppen signaal pad en triggeren celdood.
- In kanker vaak ook overactieve kinases. bijv. ontstaan door translocatie tussen
chromosoom 9 en 22 waardoor bcr-abl gen ontstaat waardoor tyrosine kinase dubbel
wordt geproduceerd.
Q: Ras is monomeer en G-protein dimeer. Ras is kleiner dan G-protein. Hebben beide
intrinsieke GTPase activiteit. Allebei cyclus met GTP binden en dan weer GDP.
Zelfstudie 2 HC4 en HC5
Passieve transporters move solute along its electrochemical gradient
- Passieve transporters, transporteren specifieke stofjes over het membraan met hun
elektrochemische gradiënt mee. Als stofje ongeladen is dan met zijn
concentratiegradiënt mee.
- Het stofje bindt aan de kant van de transporter waar een hogere concentratie is van
het stofje. De transporter verandert spontaan en random van conformatie, waardoor
stofje aan andere kant komt.
- De passieve transporters zijn heel selectief voor welke stofje ze binden
Pompen
- Transmembrane pompen pompen actief solutes(opgeloste stoffen) tegen hun
elektrochemische gradiënt in
- Figuur 12.10 blz. 397. Vaak combinaties van deze pompen. Bv. ATP-drive Na⁺-pomp
pompt Na⁺ tegen elektrochemische gradiënt in. Dan kan Na⁺ door de gradiënt-driven
pomp heen met zijn elektrochemische gradiënt mee. Hierdoor ontstaat een
elektrochemische gradiënt over het membraan en dit geeft weer de energie voor
actieve transport van een ander stofje om tegen zijn elektrochemische gradiënt in te
gaan.
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper lonnekespek. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €6,49. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 67096 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen