Samenvatting Biochemie, hoofdstuk 3 (J. Van Lint) + oefenvragen BMW en THK
26 keer bekeken 1 keer verkocht
Vak
Biochemie En Moleculaire Biologie
Instelling
Katholieke Universiteit Leuven (KU Leuven)
Samenvatting op basis van mijn notities, de slides en het boek. Achteraan zijn er een aantal oefenvragen terug te vinden die al dan niet op Sofia staan. Voor de richtingen Biomedische Wetenschappen en Tandheelkunde, deze behandelen dezelfde leerstof. :))
- Bepaalt functie, bv. Porine heeft gaten, vormt poriën van membraan
- Kan verstoord worden bij mutaties ⇒ basis voor ziekten
- Peptide= kort polymeer van aminozuren
● Binding carboxylgroep + aminogroep (gebonden aan H2O) =
polypetpideruggengraad
○ Hebben allerlei uitsteeksels door zijketens ⇒ bepalen eigenschappen eiwit
● Van vele eiwitten weet men functie nog niet
○ Voorspelling proberen te maken door primaire structuur te vergelijken met de
sequentie van alle andere eiwitten in de proteïnedatabase
■ Men kan hier hypothetisch een functie op plakken ⇒ moet
experimenteel nagegaan worden
● Structuren evolueren mee met organisme
○ Levensnoodzakelijke structuren muteren niet
○ Mutatie kan voordelig en nadelig zijn
○ Wordt nagegaan met cytochroom c
■ Men kan hiermee zien welke kleine variaties er zijn opgetreden ⇒
nieuwe stambomen opstellen op een manier die vroeger niet mogelijk
was
1
,Secundaire structuur
● Lokale conformatie van een deel vh eiwit
● Peptidebinding = vlakke structuur
○ Elektronen worden verdeeld over C-O en C-N
■ Ontstaan van partieel planaire binding
■ Vorm binding bevindt zich tussen 2 vormen door resonantie tussen 2
structuren de even stabiel zijn, partieel dubbelbindingskarakter
■ Geen rotatie mogelijk om C-N (op afbeelding aangeduid met *)
● Torsiehoeken
○ Bindingshoeken van Calpha , aangeduid in roze op structuur
○ Hier is wel rotatie mogelijk
○ Meest uitgerokken conformaties is phi = 180° en psi = 180°, zijn
oorspronkelijke hoeken
○ Niet alle verschillende combinaties van torsiehoeken zijn mogelijk:
■ Van der Waals-krachten
■ R-groepen
2
, ● ‘Welke torsiehoekencombinatie is mogelijk met R-groepen in gedachte?’
○ Prof. Ramachandran maakte diagram
■ Afstanden tussen alle atomen van een tripeptide te berekenen bij elke
waarde van phi en psi
■ Alles wat blauw is kan
● Donkerblauw ⇒ geen sterische hinder
● Middenblauw ⇒ uiterste limiet wat er toegelaten is
● Lichtblauw ⇒ enkel toegelaten wanneer flexibiliteit is in
bindingshoeken
■ Alles wat grijs is kan niet ⇒ hier overlappen de VdW-radii
Dit laat toe om structuren die gevonden zijn met de computer te toetsen
- Men kan zo juiste structuren vinden + ruimtelijk te zien krijgen
Alfa-helix
● Eenvoudigste structuur die polypeptideketen kan aannemen
○ Polypeptideruggengraat helicoïdaal naar rechts gewonden rondom
denkbeeldige as
○ R-groepen AZ steken naar buiten
○ Psi van -45° tot -50°
○ Phi van -60°
● Optimaal gebruik van interne H-bruggen
○ Stabilisatie door H-brug tussen positieve N van een peptidebinding en een
negatieve O van een ander peptidebinding 4 AZ verder richting de N-terminus
⇒ dit doen alle peptidebindingen, behalve de uiteinden
3
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper EmilieFZ. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €4,00. Je zit daarna nergens aan vast.
