Lecture notes study book Molecular Biology of Cancer of Lauren Pecorino (Lecture 4 Oncogenesis: The cell cycle) - ISBN: 9780198833024, Edition: 5th Revised edition, Year of publication: - (The cell cycle)
Sequencing → comparing the normal DNA with the tumour DNA with labelled nucleotides.
When you see double waves at such a sequencing graph, it is a frameshift, because you’ll have a
wildtype version and a mutated version. (Slide with: deletion of G).
Massive Parallel Sequencing or Next Generation Sequencing
➢ High throughput sequencing method of whole genomes
➢ Allows detection of mutations, chromosomal changes and translocations
c.384A>T c. = RNA sequence, 384 = the number of the nucleotide
g.16000A>T g. means genomic sequence.
p.Gly85>Glu p. is a protein
ATG = Start codon. A is the 1st nucleotide (number 1). Here you start counting. 5’ of RNA is capped
and the 3’end has PolyA.
Epigenetic changes are modifications. CpG → CmpG. It can induce gene silencing. In cancer: hypo-
and hypermethylation in tumor suppressor genes (TSGs). Bisulfite modifications cause the formation
of uracil instead of Cytosine → detect methylated C’s since they stay the same.
Lecture 4 The Cell Cycle
Rob Wolthuis
S-phase: DNA replication fork (replisome) consists of multiple DNA polymerases incorporated in a
molecular machine containing helicases and ligases and topo-isomerases. Leading and lagging strand.
Risk: fork collapse and DNA replication stress (nucleotide depletion, DNA damage, slowing down).
The duplicated chromosome is still connected with the previous chromosome (X shape during
replication → connection = kinetochore). Microtubules (mitotic spindle) connect to these
kinetochores of the chromatids during mitosis.
Cell division usually takes about one day. G1 = 11h, S = 6h, G2 = 6h, Mitosis = 40min.
1. Keep the Replicated Chromosomes Together
2. Condense the DNA
3. Remove the Nuclear Membrane
4. Build a Mechanical Structure: the Mitotic Spindle
5. Properly Attach All the Chromosomes to the Spindle
6. Separate the Sister Chromatids and Pull them apart
7. Make New Nuclei and Decondense the DNA
S = Synthesis of sister chromatids. G2 = sister chromatids condense but remain joint. Mitosis is a
dangerous state, therefore it doesn’t take long. The cells don’t have a nucleus at this point. The
chromosomes are floating through the cell.
Prophase = condensing phase. Prometaphase = trying to get the chromosomes in the middle.
Eventually (after mitosis) you’ll have two diploid cells (daughter cells).
Cyclin B1 bound to Cdk1 (cyclin dependant kinase) induces mitosis. First: appearance of cyclin B, then
activation of cyclin B (mitosis). When Cyclin B1 disappears → mitosis stops and G1 phase is induced.
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper SophiedBoer. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €2,99. Je zit daarna nergens aan vast.
