Samenvatting
Summary Tutorial club 3 - Replication & Cell Cycle
Tutorial club 3 - Replication & Cell Cycle
[Meer zien]Voorbeeld 2 van de 8 pagina's
Voorbeeld 2 van de 8 pagina's
In winkelwagengesponsord bericht van onze partner
Voorbeeld van de inhoud
Biochemistry and Molecular Biology II – Tutorial club 3: Questions onReplication & Cell Cycle (28-05-18)
BMB2 tutorial (May 2018) DNA metabolism (Lodish 7 Chapter 4)
Q1: (a) What are the known functions of human DNA polymerase and
?
- Pol a: the RNA and DNA primers are necessary, in order for the okazaki-
fragments on the lagging strand to be transcribed.
(b) Which of these polymerases have proofreading activity? DNA pol and
have 3’ → 5’ exonuclease activity.
(c) What happens if DNA pol has an impaired proofreading activity in mice?
There will be a greater risk on mutations to form. Removal of the proofreading
function of DNA pol y leads to loss of mitochondrial functioning which can/will lead to
premature ageing. The concept is that mutant mitochondrial ATP synthetase subunits
generate reactive oxygen species (ROS) that damage the proteome and the nuclear
genome, causing aging.
Q2: a,b,c) Eukaryotes have repair systems that prevent mutations due to
copying errors and exposure to mutagens. What are the three excision-repair
systems found in eukaryotes.
1. Base excision repair (BER) → caused by a deamination of cytosine. Corrects
G-U and G-T mismatches. It removes T and U. Eventually DNA ligase seals
the gap. Should happen before replication. DNA glycosylase flips out the
wrong base. Then APEI endonuclease removes the incorrect base.
2. Mismatch repair (MMR) → This is caused by faulty proofreading. MS2 MS6-
complex recognize the mismatch. DNA helicase unwinds the DNA, allowing an
exonuclease to remove the mismatch. After, DNA polymerase can correct the
mismatch. In the end, DNA ligase seals everything up again and the mismatch
is corrected.
3. Nucleotide excision repair (NER) → Sunlight can cause NERs (UV-radiation
causes thymine-thymine dimers). RNA polymerase II only recognizes NERs
within a gene and the gene has to be transcribed. XP-G and XP-F are two
endonucleases which cut into one strand, in order to remove the damaged
part.
, d) In what way will repair of a transcribed region differ from a non-transcribed
one when it comes to UV-mediated DNA damage? Cell cycle (Lodish 7:
Chapters 19 and 24)
Breaks in the existing (transcribed) region need to be corrected, but it is not known
which bases were in the position to be repaired. Because UV-mediated DNA damage
has an effect on both strands.
*Non-homologous end-joining repair mechanism can be used which repairs double
strand breaks but causes mutations at the repair junction.
The recognition mechanism now occurs by RNA polymerase II and not by XP????
The name XPC comes from xeroderma pigmentosum.
The name CS comes from Cockayne syndrome.
Q3: What is a yeast cdc mutant? Give one example
1. S.pombe (fission yeast)
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper rishology. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €3,99. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 64450 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 15 jaar dé plek om samenvattingen te kopen