Samenvatting
Samenvatting MGOT deeltentamen 1
Samenvatting van alles van MGOT deeltentamen 1
[Meer zien]Voorbeeld 4 van de 37 pagina's
Voorbeeld 4 van de 37 pagina's
In winkelwagengesponsord bericht van onze partner
Voorbeeld van de inhoud
MGOT deeltentamen 1HC 2 & 3 & DNA Repair
DNA komt voor in:
- Kern
- Mitochondrium
- Chloroplast
Genetische elementen
- Chromosoom
- Circulair (Prokaryoten)
- Lineair (Eukaryoten)
- Plasmiden
- Circulair DNA
- Heeeeel bijzonder in Eukaryoten
- Virale genomen
- DNA of RNA
- Geïntegreerd of vrij in de cel
- Transposons
- Mobile genetische elementen
- Organellen
- In mitochondrien
- In chloroplasten
Replicatie
- Prokaryoten
- Unieke origin
- Ori en terminatie zone
- Eukaryoten
- Geen sterk gedefinieerde Ori
- Meerdere plekken replicatie
- Kan zelfs replicatie in een replicatie
- Alleen dan duurt replicatie maar 20 min
Seggregatie
- Eukaryoten
- Segregatie duurt langer omdat het uit chromatines moet
worden gepakt
- Replicatie en transcriptie lopen tegen elkaar in
- Elk gen heeft z’n eigen promoter
- 1 gen —> 1 mRNA —> 1 eiwit
- Prokaryoten:
- Hebben geen kern maar een nucleoid waar chromosomen
“samen komen”
- Geen mooie mitose, de nucleoiden gaan naar de
uiteinden, dan kan deling plaatsvinden
- Replicatie en transcriptie lopen niet tegen elkaar in
- Op 1 operon vinden meerdere start en stop sequenties
plaats
- Meerdere genen
- Lac operon: 3 genen —> 1 mRNA —> 3 eiwitten
,Plasmiden
- Extrachromosomaal DNA
- Bevat niet essentiële genen
- Zorgt dat bacterie kan leven in andere milieus (vergroot aanpassingsvermogen)
- Afbraak van vervuiling
- Resistentie tegen bacteriën
- Pathogeniteit
- Symbiose
- Onafhankelijke replicatie
- Gebruikt hiervoor enzymen van de cel
- Maakt zelf eiwitten voor replicatie-initiatie
- COlE1 plasmide
- ROP en RNAI reguleren RNAII
- RNAII zorgt voor start van replicatie
- RNA bindt aan enkelstrengs DNA en functioneert als primer voor DNA pol
- Ori belangrijk voor:
- Compatibiliteit
- Twee plasmiden met dezelfde ori kunnen niet samen in de cel voorkomen
- Zijn niet compatibel
- Hierdoor gaat de cel delen, denkt dat het twee dezelfde plasmiden zijn
- Host range
- Copy number
- Single copy
- Replicatie lijkt op die van chromosoom
- 1 replicatie per celcyclus
- Gecontroleerde segregatie over dochtercellen
- Iedere dochtercel krijgt een plasmide
- Multiple copy
- Meerdere replicaties per celcyclus
- Vaak een karakteristiek aantal (bijv. 10-20/cell)
- Segregatie verloopt random (niet gereguleerd)
- Dochtercellen normaliter iig 1 plasmide
- Partitionering
- Verdeling van plasmiden over cellen
- Single copy: actieve partitionering
- Plasmide codeert voor toxine en antigif —> antigif vervalt —> cel dood
- Alleen plasmide kan de cel redden
- Passieve segregatie
- Bij high copy plasmiden
- ColE1 bestaat uit toxinegen en immuniteitsgen
- Zo is het plasmide selfish DNA, ten koste van de host
- Antidote maken zodat de host niet dood gaat
DNA topoisomerase
- Topoisomerase II kan supercoils maken
- Maakt het compacter, minder toegankelijk
DNA gelelektroforese
- DNA is negatief geladen
- EtBr gaat tussen de basen van DNA zitten —> fluoriseren
,- Topologie van DNA bepaald mobiliteit
- Supercoiled: compact maar heeft nog alle lading
Intronen zitten in het gen, integeen DNA zit tussen genen (junk DNA)
Mechanismen van genetic exchange
- Conjugatie
- F pili trekt bacteriën bij elkaar —> kanaaltje
- Plasmide wordt overgedragen in enkelstrengsvorm
- Nick wordt gemaakt in DNA —> DNA polymerase gaat de streng polymeriseren —> de
andere streng komt vrij en wordt naar de acceptor gebracht
- F plasmide groot plasmide: veel genen nodig voor conjugatie
- Operon met transfer genen: kanaal maken, DNA vrijmaken
- Transfer vindt plaats op de oriT: transfer origin
- TraA codeert voor eiwitten die pili maken
- TraJ: regulatie eiwitten
- TraY maakt nick in het DNA en multimer ontwindt het DNA
- Acceptor moet nog geen F plasmide hebben: anders geen conjugatie
- Tet resistentie: herkennen
- F plasmide kan ook integreren in het genoom: episoom
- Conjugatie kan nog steeds plaatsvinden
- Enorm belangrijk in bacteriële evolutie
- Sommigen plasmide zijn niet zelf overdraagbaar:
- Hebben oriT maar hebben ander plasmide nodig voor tra functie —> gebruiken tra genen
van andere bacterie stam
- Accepter, helper & donor
- Transductie
- Faag lambda
- Lineair maar wordt circulair in de bacterie
- Lysogeen
- Integeren in het genoom —> is dan een profaag
- Basis voor gateway cloning
- Repliceert mee met het chrosomosoom
- Proces kan ook omgedraaid worden waardoor hij in de andere fase komt —> “Integratie
& Excisie”
- Lytisch
, - Virusdeeltjes worden gemaakt
- Circulair DNA wordt verpakt in faagdeeltjes
- Foutief kan er ipv faag DNA, E. coli DNA
worden verpakt in de faag
- Omdat het DNA dan homoloog is kan het
DNA worden uitgewisseld
- Defect a- gen uitgewisseld worden voor een intact a+ gen:
- Transformatie
- Naakt DNA inbrengen met DNA bindende eiwitten op het membraan van de bacterie
- Kan zijn dat bacterie dat dan houd als gunstig is
- Enkelstrengs —> dubbelstrengs —> recombinatie —> in het genoom
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper pipleopold. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €6,96. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 59325 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen