Resume
Samenvatting bio-informatica zoek- en analysetools
- Cours
- Bio-informatica
- Établissement
- Universiteit Hasselt (UHasselt)
Samenvatting bio-informatica zoek- en analysetools
[Montrer plus]
Vendeur
S'abonner
Aperçu du contenu
ONLINE ZOEK- ENANALYSETOOLS
NCBI (National Center for Biological Information) = toegang tot biomedische en
genomische informatie
GEN TOOLS
Splign (onderdeel van NCBI) = een hulpprogramma voor het berekenen van cDNA-
naar-Genomic, of gesplitste sequentie-uitlijningen. De kern van het programma is
een vergelijkingsalgoritme dat mogelijke genduplicaties identificeert, en een verfijnd
uitlijningsalgoritme dat intronen en splitsingssignalen herkent.
Primer3Plus = kiest primers uit een DNA-sequentie met behulp van Primer3
PROTEIN TOOLS
Interpro = biedt functionele analyse van eiwitten door ze te classificeren in families
en door domeinen en belangrijke sites te voorspellen.
Uniprot = de wetenschappelijke gemeenschap te voorzien van een uitgebreide,
hoogwaardige en vrij toegankelijke bron van eiwitsequentie en functionele
informatie.
RCSB Protein Database = mogelijk maken van een open toegang tot de
accumulerende kennis van 3D structuur, functie en evolutie van biologische
macromoleculen, waardoor de grenzen van de fundamentele biologie, de
biogeneeskunde en de biotechnologie worden verlegd.
PeptideCutter = voorspelt potentiële splitsingsplaatsen die gesplitst worden door
proteasen of chemicaliën in een bepaalde eiwitsequentie. PeptideCutter retourneert
de query sequentie met de mogelijke splitsingsplaatsen in kaart gebracht en / of een
tabel van splitsingsplaats posities.
ProteomeXchange = biedt een standaardmethode voor het indienen van op
massaspectrometrie gebaseerde proteomicsgegevens bij publiek toegankelijke
opslagplaatsen. Zodra u uw gegevens bij het PX-invoerpunt heeft ingediend, worden
deze automatisch verspreid naar alle andere repositories in het consortium
PeptideShaker = zoekmachineonafhankelijk platform voor de interpretatie van
proteomics identificatie resultaten van meerdere zoekmachines, die momenteel X!
Tandem, MS-GF+, MS Amanda, OMSSA, MyriMatch, Comet, Tide, Mascot,
Andromeda en mzIdentML ondersteunen. Door de resultaten van meerdere
zoekmachines te combineren en tegelijkertijd de PTM-lokalisatiescores te
herberekenen en de proteïne-inferentie opnieuw te doen, probeert PeptideShaker u
het best mogelijke inzicht te geven in uw proteomics-data!
Les avantages d'acheter des résumés chez Stuvia:
Qualité garantie par les avis des clients
Les clients de Stuvia ont évalués plus de 700 000 résumés. C'est comme ça que vous savez que vous achetez les meilleurs documents.
L’achat facile et rapide
Vous pouvez payer rapidement avec iDeal, carte de crédit ou Stuvia-crédit pour les résumés. Il n'y a pas d'adhésion nécessaire.
Focus sur l’essentiel
Vos camarades écrivent eux-mêmes les notes d’étude, c’est pourquoi les documents sont toujours fiables et à jour. Cela garantit que vous arrivez rapidement au coeur du matériel.
Foire aux questions
Qu'est-ce que j'obtiens en achetant ce document ?
Vous obtenez un PDF, disponible immédiatement après votre achat. Le document acheté est accessible à tout moment, n'importe où et indéfiniment via votre profil.
Garantie de remboursement : comment ça marche ?
Notre garantie de satisfaction garantit que vous trouverez toujours un document d'étude qui vous convient. Vous remplissez un formulaire et notre équipe du service client s'occupe du reste.
Auprès de qui est-ce que j'achète ce résumé ?
Stuvia est une place de marché. Alors, vous n'achetez donc pas ce document chez nous, mais auprès du vendeur anasloyens. Stuvia facilite les paiements au vendeur.
Est-ce que j'aurai un abonnement?
Non, vous n'achetez ce résumé que pour €6,49. Vous n'êtes lié à rien après votre achat.
Peut-on faire confiance à Stuvia ?
4.6 étoiles sur Google & Trustpilot (+1000 avis)
53022 résumés ont été vendus ces 30 derniers jours
Fondée en 2010, la référence pour acheter des résumés depuis déjà 14 ans