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Résumé - biochimie : métabolisme des protéines et des acides aminés
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Résumé (mise en forme et traduction) du cours de médecine vétérinaire de biochimie sur le métabolisme des protéines et des acides aminés
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Stoffwechsel 16 :Protein- & Aminosäurenstoffwechsel I
Objectifs d'apprentissage
- Les protéines en tant que facteur alimentaire - Bilan azoté
- Acides aminés essentiels/non essentiels
- Protéases
- Dégradation intracellulaire des protéines dans le lysosome
- Dégradation intracellulaire des protéines dans le protéasome
Structure générale des acides aminés (répétition)
- Chez les mammifères, on trouve plus de 600 acides aminés (AA)
différents.
- Pas seulement des acides α-aminés, mais aussi des acides β- (par ex. β-
Ala – avec deux c tous seuls, un α et un β) et γ-aminés (par ex. GABA).
- La biosynthèse des protéines nécessite 20 acides α-aminés différents
(acides aminés protéinogènes, tous de configuration L).
- Certains des 20 acides aminés protéinogènes peuvent être produits par l'organisme
lui-même (acides aminés non essentiels), d'autres doivent être apportés par
l'alimentation (acides aminés essentiels).
Acides aminés modifiés / non protéinogènes
- Se forment par modification chimique à partir d'AS
protéinogènes (post-traductionnel). à souvent modifié
après la synthèse de protéine
- Modifications chimiques fréquentes :
o Phosphorylation (important mécanisme pour activer
et désactiver des protéines)
o Acétylation
o Méthylation
o Hydroxylation
o γ-carboxylation (rajout d’un groupe carboxyl)
o Cyclisation intramoléculaire
- Certaines modifications sont réversibles et ont des fonctions
régulatrices
- Quelques AS non protéinogènes importants :
o Ornithine (AA qui vient dans le cycle de l’urine)
o Citrulline (AA aussi dans le cycle de l’urine)
o 3,4-dihydroxyphénylalanine (DOPA)
o Homocystéine
, Exemple : collagène comme support d'acides aminés modifiés
- Collagènes : protéines fibrillaires. Principal composant de la matrice
extracellulaire des ligaments et des tendons.
- Les collagènes sont constitués de trois hélices α homo- ou
hétéromères qui s'assemblent en une triple hélice à droite.
- Synthèse des collagènes dans le RE. Pendant la synthèse, les résidus
Pro et certains résidus Lys de la chaîne protéique en croissance sont
modifiés par des hydroxylases Prolyl- ou Lysyl. Ces hydroxylations
sont importantes pour l'assemblage et la stabilité de la triple hélice.
- Les hydroxylases ont besoin de vit. C comme cofacteur (réduction
de Fe3+ en Fe2+). En cas de carence en vit. C, des collagènes
défectueux se forment ⇒ maladie : scorbut
Les OH sur la chaine servent à faire des ponts hydrogènes.
Acides aminés protéinogènes
Tableau à pour les humains
Remarque : en l'absence d'AS
essentiels, le bilan azoté est
négatif.
D'ailleurs, en raison de l'absence
de seulement trois enzymes clés,
les organismes animaux ne
peuvent pas produire eux-mêmes
8 AS essentiels !
Tableau bleu : si on n’a pas de
Met, on ne peut pas fabriquer de
Cys, donc Cys est AA
conditionnellement essentiel,
même chose pour la 2e ligne
Chez le chat, arginin est essentiel, le trouve essentiellement dans la viande (ne peuvent pas
être vegétarien), arginin importent pour le cycle de l’urine, monte le niveau d’ammoniac
dans le sang
Faut savoir lesquels à peu près sont essentiels chez l’humain
Entrée et sortie des acides aminés
- Les flux entrants et sortants
d'acides aminés s'équilibrent.
- Valeur biologique : les protéines
alimentaires végétales et animales
ont une qualité différente pour
l'alimentation humaine (en fonction
de ce qu’on mange, contient plus
ou moins de AA essentiels, la
plupart du temps font parties de la
protéine)
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