100% tevredenheidsgarantie Direct beschikbaar na je betaling Lees online óf als PDF Geen vaste maandelijkse kosten
logo-home
Introduction to Bioorganic Chemistry and Chemical Biology: ANSweRS To CHAPTeR 6 €16,49
In winkelwagen

Tentamen (uitwerkingen)

Introduction to Bioorganic Chemistry and Chemical Biology: ANSweRS To CHAPTeR 6

 0 keer verkocht
  • Vak
  • Instelling

Answer 6.1 Solve the equation. Convert temperature in °C to K by adding 273. Plug the numbers into ΔG = ΔH – TΔS. Kassociation = e–ΔG/RT. This is the equilibrium constant for association, so take the inverse: Kd = 1/Kassociation. Calculated using Kd = koff/kon: Answer 6.3 when the ...

[Meer zien]

Voorbeeld 2 van de 8  pagina's

  • 30 april 2021
  • 8
  • 2019/2020
  • Tentamen (uitwerkingen)
  • Vragen en antwoorden
avatar-seller
Introduction to Bioorganic Chemistry and Chemical Biology 1




Answers to Chapter 6
(in-text & asterisked problems)



Answer 6.1
Solve the equation.
Convert temperature in °C to K by adding 273.
Plug the numbers into ΔG = ΔH – TΔS.
Kassociation = e–ΔG/RT.
This is the equilibrium constant for association, so take the inverse:




m
er as
Kd = 1/Kassociation.




co
Protein Protein ΔH ΔS Kd




eH w
(kcal mol–1) (cal K–1 mol–1)




o.
mutant TCR β S. aureus –15.8 –21 at 25 °C 9.6 × 10–8 M
chain 8.2

rs e
enterotoxin C3
ou urc
p67phox Rac•GTP –7.3 52 at 18 °C 1.7 × 10–6 M
complex

iso-1- iso-1-cc –2.6 18.5 at 25 °C 1.1 × 10–6 M
o
cytochrome c peroxidase
aC s
vi y re


Answer 6.2
Calculated using Kd = koff/kon:

Protein Small ligands kon (M–1 s–1) koff (s–1) Kd
ed d




chymotrypsin proflavin 1 × 108 8300 8.3 × 10–5
ar stu




creatine kinase ADP 0.2 × 108 18,000 9.0 × 10–4

G-3-P dehydrog. NAD+ 0.2 × 108 1000 5.0 × 10–5

lactate dehydrog. NADH 10 × 108 10,000 1.0 × 10–5
is




alcohol dehydrog. NADH 0.3 × 108 9 3.0 × 10–7
Th




lysozyme (N-Ac-Glu)2 0.4 × 108 100,000 2.5 × 10–3

ribonuclease 3ʹ-UMP 0.8 × 108 11,000 1.4 × 10–5
sh




Protein Large ligands kon (M–1 s–1) koff (s–1) Kd

tRNASer tRNASer 2 × 108 11 5.5 × 10–8
synthetase

trypsin protein inhibitor 0.07 × 106 0.0002 2.9 × 10–9

insulin insulin 1 × 108 20,000 2.0 × 10–4

β-lactoglobulin β-lactoglobulin 0.00005 × 108 2 4.0 × 10–4

α-chymotrypsin α-chymotrypsin 0.000004 × 108 0.7 1.8 × 10–3

This study source was downloaded by 100000763811389 from CourseHero.com on 04-29-2021 03:42:03 GMT -05:00


https://www.coursehero.com/file/37863525/Answers-to-Chapter-6pdf/

, 2 Introduction to Bioorganic Chemistry and Chemical Biology: Answers to Chapter 6


Answer 6.3
When the concentration of NADH is 3 × 10–7 M, the ratio of bound to unbound alcohol
dehydrogenase is 1:1. From there, the ratio of bound to unbound enzyme can easily be
estimated at other concentrations of NADH.
KD = 3 × 10–7 M
bound unbound
+ NADH
enzyme•NADH enzyme


[NADH] [enzyme•NADH] : [enzyme]
3 × 10–6 M 10 : 1
Introduction to Bioorganic Chemistry and Chemical Biology | A6019
10–7
3 ×Van M & Weiss | 978-0-8153-4214-4
Vranken 1 : 1
www.garlandscience.com
3 ש10–8 M design
1 by www.blink.biz
: 10
3 × 10–9 M 1 : 100

A When [NADH] = 3 μM, the ratio of bound to unbound enzyme is 10/11 ≈ 91%.
B When [NADH] = 3 nM, the ratio of bound to unbound enzyme is 1/101 ≈ 1%.




m
Answer 6.4




er as
cancer cells




co
[Curcumin] Dead / Live Percentage




eH w
(µM) viable
5.5 1 : 1 50




o.
O OH
11 2 : 1 33


rs e MeO OMe
55
550
10
100
:
:
1
1
9.1
1.0
ou urc
HO curcumin OH 5500 1000 : 1 0.10
Introduction to Bioorganic Chemistry and Chemical Biology | A6117
Van Vranken & Weiss | 978-0-8153-4214-4
Curcumin has poor bioavailability. At an oral dose of 8 g of curcumin per day, the peak
© www.garlandscience.com design by www.blink.biz
serum concentrations of curcumin reach only 1.8 μM. Hypothetically, eating large
o

quantities of curcumin might be effective for colorectal cancer in the GI tract, but not for
aC s

systemic cancers like leukemias.
vi y re



Answer 6.5
A Galactose binds most tightly because it has the lowest Km; however, the affinities of
all three substrates are within a factor of two.
ed d




B Galactose is isomerized more than 100 times faster than the other two substrates
ar stu




on the basis of the kcat/Km values: galactose (3700 mM–1 s–1), glucose (13 mM–1 s–1),
xylose (20 mM–1 s–1).
C If the system is at equilibrium, when the concentration of glucose is 10 Km (340 mM),
the ratio of glucose–enzyme complex to free enzyme will be 10:1. In a typical mam-
is




malian cell, the intracellular glucose concentration is less than 1 mM. Of course the
amount of free enzyme is likely to be small because galactose and other sugars can
Th




occupy the enzyme active site.

Answer 6.6
A The substrate with the lowest Km binds most tightly: LRRASLG.
sh




B The substrate with the highest kcat is phosphorylated fastest (once it binds): LR-
RASLG.
C The relative rates of phosphorylation will be proportional to kcat/Km. LRRASLG is bet-
ter than LRAASLG by a factor of 1507.

Substrate Km (μM) kcat (s–1) kcat / Km (M–1 s–1)
LRAASLG 12200 8.7 0.00071
LHRASLG 804 19.8 0.0246
LRRASLG 31 33.1 1.07
This study source was downloaded by 100000763811389 from CourseHero.com on 04-29-2021 03:42:03 GMT -05:00


https://www.coursehero.com/file/37863525/Answers-to-Chapter-6pdf/

Dit zijn jouw voordelen als je samenvattingen koopt bij Stuvia:

Bewezen kwaliteit door reviews

Bewezen kwaliteit door reviews

Studenten hebben al meer dan 850.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet jij zeker dat je de beste keuze maakt!

In een paar klikken geregeld

In een paar klikken geregeld

Geen gedoe — betaal gewoon eenmalig met iDeal, Bancontact of creditcard en je bent klaar. Geen abonnement nodig.

Focus op de essentie

Focus op de essentie

Studenten maken samenvattingen voor studenten. Dat betekent: actuele inhoud waar jij écht wat aan hebt. Geen overbodige details!

Veelgestelde vragen

Wat krijg ik als ik dit document koop?

Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.

Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?

Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.

Van wie koop ik deze samenvatting?

Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper Welch1. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.

Zit ik meteen vast aan een abonnement?

Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €16,49. Je zit daarna nergens aan vast.

Is Stuvia te vertrouwen?

4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)

Afgelopen 30 dagen zijn er 63950 samenvattingen verkocht

Opgericht in 2010, al 15 jaar dé plek om samenvattingen te kopen

Start met verkopen

Laatst bekeken door jou


€16,49
  • (0)
In winkelwagen
Toegevoegd