Samenvatting
Samenvatting biochemie theorie deel 2 (Clarys)
- Instelling
- Vrije Universiteit Brussel (VUB)
Vertaling van de slides + eigen notities + extra uitleg
[Meer zien]Voorbeeld 4 van de 148 pagina's
Voorbeeld 4 van de 148 pagina's
In winkelwagenVoorbeeld van de inhoud
Peter ClarysBIOCHEMIE VAN DE INSPANNING
HOC
1. Métabolisme : basisconcepten en design
Samenhangend ontwerp met veel gemeenschappelijk motieven (gebruik van energie en herhaalde verschijning
van een beperkt aantal van geactiveerde intermediairen).
→ Vb. acetyl-CoA
Veel reacties in metabolisme, weinig verschillende soorten. De mechanismen zijn relatief eenvoudig.
De metabolische routes worden gemeenschappelijk gereguleerd.
1.1 Algemene principes
1) Brandstoffen (vnl. KH en vetten maar eiwitten kunnen ook) worden afgebroken en grote moleculen
worden stap voor stap opgebouwd in metabole routes (= reeks gekoppelde reacties).
2) ATP (nodig voor alle vorm van leven): verbinden energiewegen → routes die energie nodig hebben en
routes die energie vrijstellen.
3) Oxidatie van koolstof bevattende substraten (brandstoffen) → vormt ATP.
4) Veel wegen, weinig verschillende soorten reacties. Veel gemeenschappelijke intermediairen.
→ (Vb. Acetyl co A, geactiveerd C2 fragment komen we tegen in vetzuurmetabolisme, KH
metabolisme en eiwitmetabolisme.
5) Metabolische wegen worden sterk gereguleerd. Opbouw en afbraak gebeuren nooit tegelijkertijd.
Regulatie is nodig omdat sommige processen snel dienen opgestart te worden (vb. anaerobe
glycolyse).
6) Enzymen die betrokken zijn georganiseerd in grote complexen om efficiëntie te verhogen. Enzymen
liggen in een rij en het product van de ene wordt het substraat van de 2 e enzym in de rij zodat het
substraat gewoon doorgegeven wordt → verhoogt snelheid/ flow.
Enzymen liggen vast op cytoskelet.
Het metabolisme bestaat uit gekoppelde reacties
Levende organismen hebben een continue input van energie nodig voor drie belangrijke doeleinden:
- Mechanische werk in spiercontractie en cellulaire bewegingen → ATP is nodig
- Actief transport van moleculen en ionen
- Synthese van macromoleculen en biomoleculen vanaf simpele precursoren.
1
, Peter Clarys
Fototrofen halen energie uit zonlichten → CO2 en H2O aan elkaar binden om glucose aan te maken. Daarvoor is
ATP nodig en reducerend vermogen.
Chemotrofen halen energie dankzij oxidatie van de voedingsproducten en energie te gaan generen.
➔ Beide maken gebruik van een protonengradiënt. Bij de Fototrofen in chloroplasten en bij chemotrofen
in mitochondriën.
Het metabolisme bestaat uit energie leverende en energie vergende reacties
Wegen zijn onafhankelijk en de coördinatie van activiteit gebeurt door sensitieve communicatie waar
allosterische* enzymen predominant zijn.
*Enzymen die kunnen binden aan regulatoren waardoor de vorm en activiteit kan veranderen.
2 grote klassen van reacties:
- Converteren energie uit brandstoffen in biologisch bruikbare vormen
- Input van energie nodig
Katabolisme: brandstof zijn KH, vetten
worden geoxideerd en worden omgezet
naar CO2, H2O en energie
Anabolisme: bouwblokjes aan elkaar via
energie
Belangrijk is dat biosynthetische en afbraakroutes zijn altijd verschillend.
2
, Peter Clarys
Beperkt aantal types reacties (6)
Ongunstig = energieverbruik
Gunstig = energie komt vrij
Thermodynamisch ongunstige reacties worden aangedreven door thermodynamisch gunstige reacties
→ energie verbruiken, kan niet spontaan doorgaan
→ Levert energie op
→ Globaal een gunstige reactie
Een thermodynamisch ongunstige reactie kan worden aangedreven door een thermodynamisch gunstige
reactie waaraan het is gekoppeld.
ATP is het universele betaalmiddel van vrije energie in biologische systemen
De hydrolyse (splitsen door toevoeging van water) van ATP is exergonische → energie komt vrij.
Er komt een grote hoeveelheid vrije energie vrij wanneer ATP wordt gehydrolyseerd tot adenosine difosfaat
(ADP) en orthofosfaat (Pi) of wanneer ATP wordt gehydrolyseerd tot adenosine monofosfaat (AMP) en
pyrofosfaat (PPi).
→ Uit AMP kunnen we geen energie meer halen want dit is een esterbinding.
→ Levert meer energie op.
3
, Peter Clarys
ATP wordt vaak een hoogenergetische fosfaatverbinding genoemd, en de fosfoanhydride-bindingen zijn dat
ook hoogenergetische obligaties genoemd. Inderdaad, een "kronkel" (～ P) wordt vaak gebruikt om een
dergelijke aan te duiden band. ATP heeft een hoog fosforyl-overdrachtspotentieel.
NAD+, FAD en CoA zijn derivaten van ATP
De rol van ATP in het energiemetabolisme staat voorop: ATP in de structuur van elektronendragers en de
acylgroepdrager.
De Fosforyl-transfer potentiaal is een belangrijke vorm van cellulaire energie transformatie
→ mogelijkheid om fosforgroep over te dragen
Sommige verbindingen in biologische systemen hebben een hogere fosforyl-overdrachtspotentieel dan dat van
ATP.
Deze verbindingen omvatten fosfoenolpyruvaat (PEP), 1,3-bisfosfoglyceraat (1,3-BPG) en creatine fosfaat.
Ze kunnen hun fosforylgroep overbrengen naar ADP om ATP te vormen
Hoger potentiaal (meer energie dat vrijkomt) → PEP, creatine-fosfaat
kunnen een fosforylgroep transferen naar ADP om ATP te maken.
Niet het geval voor alles onder ATP.
4
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
√ Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, Bancontact of creditcard voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper camillegeurts. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €10,49. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 67474 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen