100% tevredenheidsgarantie Direct beschikbaar na betaling Zowel online als in PDF Je zit nergens aan vast
logo-home
Eerder door jou gezocht
Eerder door jou gezocht
logo
Samenvatting Overzicht Bio informatica Cursus (Behaald Resultaat: 16/20) €6,49   In winkelwagen
Snel navigeren naar
Voorbeeld
  2.  
  3. Universiteit Antwerpen (UA)
  4.  
  5. Biomedische Wetenschappen
  6.  
  7. Bio-informatica

Samenvatting

Samenvatting Overzicht Bio informatica Cursus (Behaald Resultaat: 16/20)
 25 keer bekeken  0 keer verkocht

Dit document bevat een overzicht van alle onderwerpen van bio informatica gegeven in academiejaar . Ik heb hiervoor een overzicht gemaakt van alle algoritmes en dit al kort uitgelicht. Verder bevat het per les en practica een overzicht van de belangrijkste onderdelen en verwijzingen naar de dia's w...

[Meer zien]

Voorbeeld 4 van de 90  pagina's

Document informatie

  • 3 november 2021
  • 90
  • 2021/2022
  • Samenvatting

Onderwerpen

Geschreven voor

Alle documenten voor dit vak (10)

Verkoper

avatar-seller
lemmeslodders

Ontvangen beoordelingen

Voorbeeld van de inhoud

Samenvatting bio informatica
(inclusief oefeningen)

geschreven door

2017




De Marktplaats voor het Kopen en Verkopen van je Samenvattingen

Op Stuvia vind je de beste samenvattingen, geschreven door je medestudenten. Voorkom
herkansingen en haal hogere cijfers met samenvattingen specifiek voor jouw studie.




www.stuvia.be




Gedownload door: nikidelva | niki.delva@hotmail.be
Dit document is auteursrechtelijk beschermd, het verspreiden van dit document is strafbaar.

, Stuvia - Koop en Verkoop de Beste Samenvattingen




Samenvatting
bioinformatica
Biomedische wetenschappen
2018-2019




Gedownload door: nikidelva | niki.delva@hotmail.be
Dit document is auteursrechtelijk beschermd, het verspreiden van dit document is strafbaar.

, Stuvia - Koop en Verkoop de Beste Samenvattingen



HOOFDSTUK 1: INTRODUCTION
1. Getting started
1.1. Sequenties
− Bevatten veel informatie
− Hoe informatie tevoorschijn halen?
1. Sequenties vergelijken
2. Sequentie databases doorzoeken
3. Evolutionaire verbanden vaststellen
4. Sequentiepatronen ontdekken
5. Eiwitfuncties voorspellen

1.2. Human genome
− Elke cel heeft exact dezelfde kopie
− 46 chromosomen
− Gecodeerd door volgorde van nucleotiden (A, T, C, G)

Genome sequencing
1. DNA extraheren uit weefsel
2. DNA kopiëren (PCR)
3. DNA in stukken knippen
4. Kleine stukjes sequencen
5. Resultaat = grote verzameling van korte sequenties

Rol van bioinformatica
− Alle stukjes in elkaar puzzelen zodat het hele genoom leesbaar wordt
= Genome assembly

Metagenomics
− Metagenomics = genetisch materiaal dat uit de omgeving afkomstig is gaan bestuderen
− vb. microbiële ecologie van een vijver bestuderen

1000 genomes project
− 1000 genomes project = internationale samenwerking om wereldwijd 1000 genomen te
sequencen
− Doel = humane genetische variatie vastleggen

1.3. DNA represents only one level of biological complexity
DNA
− Bevat informatie die het individu definieert
− Mutaties kunnen voorkomen (positief of negatief)
− Hoe beter de genen, hoe beter de voortplantingsmogelijkheden
→ Populatie evolueert naar een populatie met hogere fitness
− Wordt afgeschreven tot RNA transcripten
− RNa transcripten worden eiwitten

Sources of extra complexity
− Interacties = moleculen interageren met elkaar en beïnvloeden elkaar
− Variatie = veel verschillende genen, RNA transcripten (→ alterna:eve splicing) en eiwi;en
(→ post transla:onele modifica:es)
− Spatiotemporal dynamics = hoeveelheid van elk molecule varieert doorheen de tijd en
ruimte

2

Gedownload door: nikidelva | niki.delva@hotmail.be
Dit document is auteursrechtelijk beschermd, het verspreiden van dit document is strafbaar.

, Stuvia - Koop en Verkoop de Beste Samenvattingen



Emergent properties
− Plots verschijnende eigenschappen dankzij deze extra complexiteit
− "whole" is more than the sum of the components
− Goldstein definitie van emergence
→ Het verschijnen va nieuwe eigenschappen tijdens een zichzelf organiserend proces in
complexe systemen

1.4. Systeembiologie
− Netwerk van netwerken
− Nieuwe inzichten over systeembiologie leidt tot ontwikkeling van nieuwe technieken wat
leidt tot nieuwe soorten data

1.5. What is bioinformatics?
Bioinformatics scope
− Scope = strekking
− Bioinformatica
= Computationele tools en benaderingen gebruiken om biologische/medische/… data
nuttig te gebruiken
= Ook nodig om data op te slaan/organiseren/…
− Interpreteren van moleculaire data

Computationele biologie
− Computationele biologie
→ Ontwikkeling en gebruik van data analytische, theoretische en computationele
methoden om biologische/sociale/… systemen te bestuderen

Bioinformatics vs data mining
− Bioinformatica = toegepaste data mining
− Data mining = grote databases bestuderen om nieuwe info te bekomen
− Bioinformatica = analyse van moleculair biologische data om een vraag te beantwoorden

1.6. Relevante trends
− Al deze trends zorgen voor een groei van bio informatica

① High throughput revolu:on
− High throughput = technieken leveren veel data
− Veel data kan bestudeerd worden
− Maar: informatica kosten zijn duurder dan bv. de sequencing kosten
− Wet van Moore = zegt hoe de rekenkracht goedkoper wordt
→ Computers worden niet snel genoeg sneller voor de overvloed aan informatie

② Central dogma outdated
− Centrale dogmatheorie = nucleïnezuren (DNA en RNA) leveren informatie over naar eiwitten
en dit kan niet omgekeerd
→ DNA → RNA → eiwit
− Maar: men weet dat het veel complexer is dan dit, vb. epigenetica

③ Genome and society
− DNA is iets normaal geworden
− Iedereen kan commerciële DNA tests afnemen

④ The big data wave
− Wereld genereert meer data dan ooit

3

Gedownload door: nikidelva | niki.delva@hotmail.be
Dit document is auteursrechtelijk beschermd, het verspreiden van dit document is strafbaar.

Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:

√ Verzekerd van kwaliteit door reviews

√ Verzekerd van kwaliteit door reviews

Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!

Snel en makkelijk kopen

Snel en makkelijk kopen

Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, Bancontact of creditcard voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.

Focus op de essentie

Focus op de essentie

Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!

Veelgestelde vragen

Wat krijg ik als ik dit document koop?

Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.

Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?

Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.

Van wie koop ik deze samenvatting?

Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper lemmeslodders. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.

Zit ik meteen vast aan een abonnement?

Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €6,49. Je zit daarna nergens aan vast.

Is Stuvia te vertrouwen?

4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)

Afgelopen 30 dagen zijn er 77988 samenvattingen verkocht

Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen

Start met verkopen
€6,49
  • (0)
  Kopen