100% tevredenheidsgarantie Direct beschikbaar na betaling Zowel online als in PDF Je zit nergens aan vast
logo-home
Eerder door jou gezocht
Eerder door jou gezocht
logo
Index practica bio-informatica €3,49
In winkelwagen
Snel navigeren naar
Voorbeeld
  2.  
  3. Universiteit Antwerpen (UA)
  4.  
  5. Biomedische Wetenschappen
  6.  
  7. Bio-informatica

Overig

Index practica bio-informatica
 3 keer bekeken  0 keer verkocht

Korte overzicht, index, lijst die alle paginanummers weergeeft over een bepaald onderwerp om deze snel te vinden in een openboek examen. Specifiek over de slides van de practica van bio-informatica.

Voorbeeld 1 van de 3  pagina's

Document informatie

  • 30 november 2021
  • 3
  • 2020/2021
  • Overig
  • Onbekend

Onderwerpen

Geschreven voor

Alle documenten voor dit vak (10)

Verkoper

avatar-seller
jennadeneve

Voorbeeld van de inhoud

Hoofdstuk Onderwerpen Slides Verbetering
pagina's
P1: Databases and  NCBI Databases  4-30  3-11
alignment o Gene database  4-8  3
o GenBank  9-15  6
 Accession number
 Version number
 FASTA file
o All databases  8
o dbSNP (grootste databank voor nucleotide  16  9
variatie)  17-21
 Uniprot (! Protein databases)  12-15
o Swiss-Prot + TrEMBL  22-29




 Pairwise alignment  32-59  16-30
o Getting familiar with dot plots  32-28  16-19
o Studying influence word size on dot plots  39-40  20-21
o Read a dot plot  41-42  22-23
o Exploring the NW and SW algorithms  43  24
o Selecting the proper alignment tool  44-51  24-25
 52-59  26-30
o Effect of parameters on pairwise alignments
(gap opening penalty, the gap extension
penalty and the score matrix)


 60-66  31-34
 61-62  31-33
 Multiple alignment
o Progressive versus iterative methods
Differences between Clustal Omega, T-Coffee,
 63-66  34
MUSCLE and MAFFT
o Comparison of orthologous gene products
P2: Search and  Sequence similarity search  5-36  3-20
motifs o Reason & BLAST explained  6-10
o word size  18-19  3-5
o BLAST  20-36  5-20
Expected ( E ) value, UniProtKB/SwissProt, algorithm
parameters; MEGABLAST, BLASTx (proteins)

 39-56  21-29
 Sequence motifs  21-26
o Basic motif exercises  39-51
 ENSMBL
 Prosite
A curated and annotated protein
functional profiles and patterns database
 Interpro
Intergrates several sequence signature
databases such as Prosite, Pfam, Blocks,
ProDom and PRINTS.

Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:

√ Verzekerd van kwaliteit door reviews

√ Verzekerd van kwaliteit door reviews

Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!

Snel en makkelijk kopen

Snel en makkelijk kopen

Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, Bancontact of creditcard voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.

Focus op de essentie

Focus op de essentie

Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!

Veelgestelde vragen

Wat krijg ik als ik dit document koop?

Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.

Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?

Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.

Van wie koop ik deze samenvatting?

Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper jennadeneve. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.

Zit ik meteen vast aan een abonnement?

Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €3,49. Je zit daarna nergens aan vast.

Is Stuvia te vertrouwen?

4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)

Afgelopen 30 dagen zijn er 52510 samenvattingen verkocht

Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen

Start met verkopen
€3,49
  • (0)
In winkelwagen
Toegevoegd