Hoofdstuk 9: DNA-analyse via restrictie en
hybridisatie
• Hybridisatie: een enkelstrengig stuk DNA, = probe, basenpaart met een complementair
stukje
Dit kan ook met RNA
→ Scheiding (denaturatie) v/d strengen in vitro met hitte of pH
→ Renaturatie bij lagere pH of temperatuur met toegevoegde probe
Hybridisatie
!!!! De probe is complementair aan de keten die opgespoord moet
worden → fluorescent merken
→ Naar gelang van stringentie (=condities: temp, pH) is de hybridisatie strenger of minder
Streng ⤷ Er is een perfecte match nodig
→ Gebruikt voor SNP-analyse
→ Via dot blot (druppels DNA of nylonmembraan)
→ Met DNA-chip (ASO op drager worden gehybridiseerd met DNA)
→ ASO’s = kunnen verschillende allelen onderscheiden
⤷ Allel-specifieke oligonucleotiden
→ De probe wordt in hoge concentratie toegevoegd => bindt eerst
• Restrictie-enzymen (endonucleases): herkent specifieke DNA-sequentie en knipt het DNA
=> restrictiefragmenten
→ Gelelektroforese: lengte bepalen
→ Herkenningssequenties: 4-6 basenpaarpalyndromen
→ Knipwijze: blunt (stomp) of sticky (overhangende) ends
⤷ ⤷
→ Enzymen vernoemd naar bacterie waaruit afkomstig
→ Pijl naar beneden om knipplaats aan te duiden (↓)
• Gelelektroforese:
▪ DNA: negatief geladen => migreert naar positieve pool
▪ Snelheid afhankelijk van grootte DNA-molecule
→ Agarosegel (100 basenparen – 20 kb)
→ Polyacrylamidegel (10 – 500 bp)
▪ Visualisatie door ethidiumbromide (oranje bij UV)
▪ Lengte van fragmenten door ladder met fragmenten met gekende grootte
• Southern analyse:
→ DNA-restrictiefragmenten gescheiden door gelelektroforese
→ Denaturatie (door pH)
→ Transferatie naar een membraan
→ Incubatie hybridisatiebuffer met gedenatureerde probe
→ Gebonden probe gevisualiseerd
• RFLP-analyse: Restrictie Fragment Lengte Polymorfisme
→ Verschil in lengte van restrictiefragmenten door verschil in DNA-sequentie
En zijn verschillende lengtes van restrictiefragmenten
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
√ Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, Bancontact of creditcard voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper ameliakirkov. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €5,49. Je zit daarna nergens aan vast.