Binnen de Bio - informatica is het belangrijk dat je plasmiden kan ontwikkelen. Het ontwikkelen van plasmiden gebeurt via het programma pDRAW. In dit document wordt stap voor stap uitgelegd hoe je moet werken met pDRAW om een plasmide te ontwerpen.
1) Accession number (Genbank)
o Vb. pSPORT 1 Acc = U12390
o Belangrijk
o 1 Sequentie. Geen witruimtes enkel en alleen de sequentie.
o Plasmide heeft 1 grootte!
2) Sequentie van pSPORT1 (Copy – Past)
o File New Enter Sequence
o Klikken op “Oké”
o Sequentie wordt lineair voorgesteld, Hoe veranderen?
Edit DNA name, properties and annotations DNA – information
DNA – name = pSPORT1
DNA is circulair
3) Sequentie circulair maken – visualiseren
o Sequentie wordt lineair voorgesteld, Hoe veranderen?
Edit DNA name, properties and annotations DNA – information
DNA – name = pSPORT1
DNA is circulair
4) Invoegen annotaties
o Belangrijke annotaties:
MCS
Antibioticaresistentiegen
Restrictie – enzymen EZ – selection Sequentie type
6bp selecteren en Interrupted, Nonpalindromic,
Degenerated mag weg
o Info opzoeken op Genbank
o Hoe ingeven?
Edit Annotation Add
o Lac – repressor (ORF) = 464 – 1546 (Richting: )
o Amp (ORF) = 2661 – 3521 (Richting: )
5) Opslaan pDraw file
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
√ Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, Bancontact of creditcard voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper matissedecaluwe. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €5,49. Je zit daarna nergens aan vast.