Samenvatting
samenvatting Cel IV: moleculaire biologie
- Instelling
- Universiteit Gent (UGent)
samenvatting van Cel IV: partim moleculaire biologie (lesgevers: Gerlo + Callewaert)
[Meer zien]Voorbeeld 4 van de 31 pagina's
Voorbeeld 4 van de 31 pagina's
In winkelwagen
Voorbeeld van de inhoud
CEL IV: moleculaire biologieH1: grondleggers van de moleculaire biologie
Mendel (1865):
- Overerving bij erwtenplanten
- P-generatie: zuiver
- F1-generatie: allemaal hetzelfde
- F2-generatie: 3:1
- Monohybride
- Uniformiteitswet
- Splitsingswet = wet der segregatie
- Onafhankelijkheidswet
Flemming:
- Kleuring chromatine
- Bestaan chromosomen + splitsing tijdens mitose
Sutton & Boveri:
- Meiose: van diploïd naar haploïd
- Chromosomen gedragen zich onafhankelijk van elkaar
Thomas Morgan:
- Fruitvliegjes: oogkleur (wit ipv rood) op X chromosoom
- Erfelijke informatie op chromosomen
Miescher:
- Eiwitten en nucleïne uit celkern
Levene:
- Nucleotide: suiker + base (A,C,T,G) + fosfaatgroep
- Tetranucleotiden
Griffith:
- Stam R: rough, niet ziek
- Stam S: smooth, ziek + sterven
- Levend R + dood S: R => S, sterven
- Transforming principle
Avery, McLeod, McCarthy:
- Dood S behandelen met proteasen, ribonucleasen, desoxyribonucleasen
- In contact met levende R => levende S bij proteasen, ribonucleasen
- DNA is transformerende factor
Hershey & Chase:
- Bacteriofagen injecteren hun genetisch materiaal in de bacterie
- Radioisotopen: 35S (eiw.) en 32P (DNA)
- Bacteriën en fagen gescheiden + gecentrifugeerd => bacterie: zwaardere partikels, fagen: opl
- Bewijs dat DNA transformerend factor is
Chargaff:
- A,T,G,C nt in =e hoevelheid
, - A = T, G = C
- Regel van Chargaff
Watson & Crick:
- Dubbele helix
- Rosalind Franklin (Wilkins)
- Pauling
- Nobelprijs
- Centrale dogma: DNA => RNA => eiwit
H2: de structuur van DNA
De primaire structuur
- Nucleosiden: pentose + base
- Nucleotiden:
o Suiker: pentose: desoxyribose
o Fosfaatgroep (5’)
o Stikstofhoudende base: (1’)
Purines: adenine, guanine (9-N)
Pyrimidines: cytosine, thymine (1-N)
- 5’3’ fosfodïesterbinding tussen OH-groep (3’) en fosfaatgroep (5’)
o Eliminatie water en pyrofosfaat
De secundaire structuur
- Waterstofbrug + van der Waalskrachten tussen basen => stabiliteit
- Watson-Crick/complementaire basenparing (A en T/ G en C)
- Base stacking
- Grote en kleine groeves
- Rechtshandig
- Anti-parallel
- 2 conformaties: A-DNA en B-DNA
- Denaturatie: waterstofbruggen w verbroken (smelten)
- Absorptie UV is bij enkelstrengig DNA 2x zo sterk als bij dubbelstrengig: hyperchromiciteit
- Smeltteperatuur/Tm: temp. Waarbij ½ van dubbelstrengig DNA gedenatureerd is (G-C)
- Renaturatie/annealing: weer nieuwe dubbele helix vormen
- Hybridisatie: complementaire DNA strengen van versch. oorsprong paren
o Snelheid afh. v. concentratie, zoutconcentratie, temperatuur, complexiteit
De tertiaire structuur
- Supercoiling
H3: genoomorganisatie en evolutie
Genoomsequentie
- Prokaryota: Eubacteria & Archaea + Eukaryota
- Elke somatische cel bevat een identieke versie vh genoom (diploïd)
o !RBC
o ! B/T-lymfocyten
Variaties in genoomorganisatie
- Dubbel/enkelstrengig
, - Lineair/circulair
- Variatie in #chromosomen
- Polyploïdie
- Mens: slecht 2% vh DNA codeert voor eiwitten (22 000)
Repititief DNA <-> uniek/low copy number DNA (spacer DNA)
- C-value: hoeveelheid DNA per haploïd genoom => C-value paradox
- Tandem repeats = satelliet DNA:
o Heterochromatine: telomeren + centromeren
o Hoog repititief DNA
o Satellieten
o Minisatellieten = VNTRs
o Microsatellieten = STRs
- Interspersed elements:
o (kopieën van) transposeerbare elementen => selfish, parasitair DNA
o Gemiddeld repititief DNA
o LINEs: > 500 bp
o SINEs: < 500 bp
Extrachromosomaal DNA en horizontale gentransfer
- Horizontale/laterale gentransfer: genomisch DNA ve organisme doorgeven aan ander
organisme
- Mitochondriaal genoom: mtDNA
o Ontstaan uit bacteriële endosymbionten
o Heteroplasmie: zowel mutante als normale mtDNA’s
o 1000/cel
o Maternale overerving
o Circulair
o Enkel coderend DNA
- Plasmide DNA (prokaryoten)
- Uitwisseling genen:
o Conjugatie = bacterieel paren:
Tussen F+ stam en F- stam
F+ is donor van F-plasmide
F-plasmide w doorgegeven via cytoplasmatische brug
Recombinatie: Hfr-cel: delen van chromosomen overdragen aan F-plasmide
Excisie: F-factor uit chromosoom verwijderen !R-genen
o Transformatie:
Opname vreemd DNA uit omringend milieu
Recombinant DNA onderzoek
DNAse
o Transductie:
Integrase: herkenning specifieke chromosoomsequentie in bacterieel
genoom
Lytisch: λ faag injecteert λ genoom in gastheercel => aanmaak virale eiwitten
=> gastheercel barst open + viruspartikels komen vrij
Transductie: bacterieel genoom w verknipt => in viruspartikels =>
overgedragen naar andere bacteriecel
, Lysogeen: λ genoom integreert in chromosomen van gastheercel => pro-faag
=> λ genoom w vermenigvuldigd => milieuwijziging: λ genoom komt vrij
Transductie: λ genoom w uitgeknipt => gastheer DNA in viruspartikel
getransporteerd naar andere cel
Genenclusters
- Solitaire genen
- Genduplicatie: homologe genen: paraloog/ortholoog => gespecialiseerde functies
- Multigen superfamilie: ontstaan door duplicatie van oergen
- α- en β-globine in genenclusters: gedupliceerde genen liggen naast elkaar
- pseudogenen: niet-functionele kopijen, door mutaties na genduplicatie
- syntenie: #chromosomen verschillend, maar genenkoppeling =
Het menselijk genoomproject
- opgestart in jaren ’90, eerste versie in 2001
- functional genomics
- comparative genomics (BLAST)
Polymorfisme
- polymorf: komen in meer dan 1 vorm voor
- SNP’s = snips = single nucleotide polymorphisms:
o Individuele nucleotide met 2 of meer variaties
o Frequentie >1%
o 3 miljoen = 1/1000 bp
o 4000 ziektebeelden met gekende genetische achtergroend
o <1% is functioneel relevant
- Farmaco-genomics: relatie tussen genetische verschillen en effectiviteit/toxiciteit
geneesmiddelen
- Copy Number Variants: grotere variaties (inserties, deleties)
- HLA systeem: transplantaties
- DNA fingerprinting: Southern blotting:
o DNA isoleren en in stukjes knippen met restrictive enzyme
o Gelelktroforese: fragmenten scheiden op basis van grootte
o Denaturatie DNA
o DNA op membraan + radioactieve probe (hybridisatie)
o Detectie probe via autoradiografie
Genoomsequentie van hominiden
- Bonobo en chimpansee meest verwant ad mens
Condensatie vh genoom
- Histonen + DNA: nucleosoom solenoïde lussen chromosoom (beads-on-a-string:
ontdekt adhv MNase)
- Histonen: eiwitten
o Basisch: Lys + Arg
o Kern/core histonen: H2A, H2B, H3, H4 => histonstaarten
o Linker histonen: H1
o Octameer (2 moleculen H2A, H2B, H3, H4) met daarrond DNA (2x)
o Stabilisatie/compacte structuur DNA
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
√ Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, Bancontact of creditcard voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper bronywiedeman. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €5,19. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 80467 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen