Observatie: bacteriën kunnen getransformeerd (= veranderd) worden doordat ze DNA uit de
omgeving kunnen opnemen
➔ geldt NIET voor elk DNA;
o DNA van bepaalde bacteriestammen werd dadelijk na opname afgebroken
o DNA van andere bacteriestammen bleef intact
➔ Er was een restrictie op het ‘soort’ DNA dat tot transformatie kon leiden
= aanwezigheid van endonucleasen die ‘vreemd’ DNA herkennen en afbreken
Endonucleasen = restrictie-enzymen: hydrolyseren de fosfodiesterbinding in de ruggegraat v/d
DNA keten en doen dit midden in een DNA fragment (i.t.t. de exonucleasen)
Restrictie-enzymen herkennen korte palindromische sequenties (4, 6-8 bp.) en knippen in of in de
omgeving van deze sequenties
➔ Meeste restrictie-enzymen knippen symmetrisch in de 2 DNA strengen v/d DNA dubbele
helix
➔ Na restrictie ontstaan ofwel blunt end uiteinden, ofwel 5’ overhangende uiteinden ofwel 3’
overhangende uiteinden
,Herkenningssequenties = restrictie-sites
→ restrictie-enzymen worden genoemd naar het organisme waaruit ze zijn afgezonderd
vb. EcoRI werd afgezonderd uit de E. coli stam R en kreeg het nummer I
Groot aantal restrictie-enzymen
→ het eigen DNA van de bacterie wordt beschermd tegen de restrictie-enzymen doordat de
bacteriën naast de restrictie-enzymen ook steeds een 2de enzyme bevatten dat specifieke basen in
de herkenningssites methyleert → deze sequentie kan niet meer herkend worden door de eigen
restrictie-enzymen
Met restrictie-enzymen lange DNA moleculen op reproduceerbare wijze fragmenteren
→ complexiteit v/h DNA wordt drastisch verminderd
RESULTAAT = dat 1 bepaald gen (en ook het hele genoom) steeds op dezelfde manier zal geknipt
worden → electroforese uitvoeren van dit geknipte genomische DNA → deze fragmenten zullen
gescheiden worden volgens lengte; het specifieke gen (of alle DNA fragmenten die het bevatten)
zal na de electroforese op een welbepaalde positie in de gel terechtgekomen zijn
, 10.2 TERUGVINDEN VAN EEN SPECIFIEK DNA FRAGMENT
Identificatie en isolatie v/h DNA fragment dat ons interesseert (bv. gen, enhancer, promotor, ORI)
→ gebruik maken v/d eigenschap dat DNA kan gedenatureerd worden en dat complementaire
DNA fragmenten kunnen hybridiseren
- Denatureren = het uit mekaar halen v/d 2 (complementaire) DNA strengen v/d dubbele
helix door de waterstofbruggen te breken
- Hybridiseren = het vormen van een dubbele DNA helix uit 2 enkelstrengige
complementaire nucleïnezuren (of RNA)
→ DNA fragment radioactief of fluorescent merken
→ na hybridisatie kan men het complementaire fragment in de gel lokaliseren
o Gemerkte fragment = probe
10.3 KLONEN VAN DNA FRAGMENTEN
10.3.1 PLASMIDEN
Plasmiden = minichromosomen die bij sommige bacteriën worden teruggevonden als
extrachromosomale, kleine, circulaire, dubbelstrengige DNAs
Plasmide moet een ORI bevatten om replicatie toe te laten (gaat anders verloren bij snelle
delingen v/d bacteriën) + een selectieve merker ( = gen dat codeert voor een bepaald voordeel
voor de gastheer; indien geen voordeel aan het dragen van plasmide zal dit snel verdwijnen)
Plasmiden gebruiken bij kloneren: reeks restrictie-sites naast elkaar inbrengen
→ leidt tot een ‘multiple cloning site’ of ‘polylinker’ → hierdoor kan men restrictiefragmenten van
verschillende kloneringsprojecten makkelijk in hetzelfde plasmide kloneren
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
√ Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, Bancontact of creditcard voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper merelBMW. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €4,59. Je zit daarna nergens aan vast.