Samenvatting
Samenvatting bio-informatica zoek- en analysetools
- Vak
- Bio-informatica
- Instelling
- Universiteit Hasselt (UHasselt)
Samenvatting bio-informatica zoek- en analysetools
[Meer zien]Voorbeeld 1 van de 4 pagina's
Voorbeeld 1 van de 4 pagina's
In winkelwagenVerkoper
Volgen
Voorbeeld van de inhoud
ONLINE ZOEK- ENANALYSETOOLS
NCBI (National Center for Biological Information) = toegang tot biomedische en
genomische informatie
GEN TOOLS
Splign (onderdeel van NCBI) = een hulpprogramma voor het berekenen van cDNA-
naar-Genomic, of gesplitste sequentie-uitlijningen. De kern van het programma is
een vergelijkingsalgoritme dat mogelijke genduplicaties identificeert, en een verfijnd
uitlijningsalgoritme dat intronen en splitsingssignalen herkent.
Primer3Plus = kiest primers uit een DNA-sequentie met behulp van Primer3
PROTEIN TOOLS
Interpro = biedt functionele analyse van eiwitten door ze te classificeren in families
en door domeinen en belangrijke sites te voorspellen.
Uniprot = de wetenschappelijke gemeenschap te voorzien van een uitgebreide,
hoogwaardige en vrij toegankelijke bron van eiwitsequentie en functionele
informatie.
RCSB Protein Database = mogelijk maken van een open toegang tot de
accumulerende kennis van 3D structuur, functie en evolutie van biologische
macromoleculen, waardoor de grenzen van de fundamentele biologie, de
biogeneeskunde en de biotechnologie worden verlegd.
PeptideCutter = voorspelt potentiële splitsingsplaatsen die gesplitst worden door
proteasen of chemicaliën in een bepaalde eiwitsequentie. PeptideCutter retourneert
de query sequentie met de mogelijke splitsingsplaatsen in kaart gebracht en / of een
tabel van splitsingsplaats posities.
ProteomeXchange = biedt een standaardmethode voor het indienen van op
massaspectrometrie gebaseerde proteomicsgegevens bij publiek toegankelijke
opslagplaatsen. Zodra u uw gegevens bij het PX-invoerpunt heeft ingediend, worden
deze automatisch verspreid naar alle andere repositories in het consortium
PeptideShaker = zoekmachineonafhankelijk platform voor de interpretatie van
proteomics identificatie resultaten van meerdere zoekmachines, die momenteel X!
Tandem, MS-GF+, MS Amanda, OMSSA, MyriMatch, Comet, Tide, Mascot,
Andromeda en mzIdentML ondersteunen. Door de resultaten van meerdere
zoekmachines te combineren en tegelijkertijd de PTM-lokalisatiescores te
herberekenen en de proteïne-inferentie opnieuw te doen, probeert PeptideShaker u
het best mogelijke inzicht te geven in uw proteomics-data!
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
√ Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, Bancontact of creditcard voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper anasloyens. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €6,49. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 53068 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen