100% tevredenheidsgarantie Direct beschikbaar na betaling Zowel online als in PDF Je zit nergens aan vast
logo-home
Volledige samenvatting 'Methoden in het Biomedisch Onderzoek' gebaseerd op slides van Johan Swinnen €6,99   In winkelwagen

Samenvatting

Volledige samenvatting 'Methoden in het Biomedisch Onderzoek' gebaseerd op slides van Johan Swinnen

 37 keer bekeken  1 keer verkocht

Dit document omvat een samenvatting van het vak Methoden in het Biomedisch Onderzoek en is gebaseerd op de slides van Johan Swinnen. Het is een handige rode draad om de cursus te leren.

Voorbeeld 4 van de 57  pagina's

  • 2 januari 2023
  • 57
  • 2019/2020
  • Samenvatting
Alle documenten voor dit vak (11)
avatar-seller
loniebaeyens
Methoden hoofdstuk 1: Inleiding en situering

 Algemene info (+ vb vragen)

Methoden hoofdstuk 2: Biomedische vraagstelling en onderzoeksmethodiek

2.1 Het domein van BMW onderzoek is zeer breed

 Disciplines: fysiologie vs pathologie

 Niveaus: organisme – weefsel – cel – subcellulair

2.2 Breed gamma aan vraagstellingen

 Open exploratief: geen hypothese, veel methoden gebruiken

 Hypothese-gedreven: vooropgesteld antwoord, specifieke methodes

 Fundamenteel: hoe iets in mekaar zit, geen concrete toepassing / translationeel: overgang
fundament en klinisch, doelgerichter, toepassing nodig / klinisch: patiënt-gericht, PICO
principe, 4 fasen  vrijwilligers, patiënten, grotere groep, hele grote groep  effect, dosis
optim + eff, werking, neveneff, EU  EMA goedkeuring

 Analyse in vivo: levend organisme bepaling / ex vivo: metingen op staal organisme / in vitro:
metingen in proefbuis / in silico: analyseren met computer

2.3 Ontwerp van biomedische experimenten

 Probleem  literatuur  hypothese  bio/modelsyst  bepaling variabele  keuze
methode  uitvoering experiment  herhaling exp  analyse resultaten  formulering
conclusie

2.4 Twee grote klassen van methoden

 Methoden voor analyse: iets meten

 Methoden voor modulatie: iets veranderen aan organisme/proefdiermodel

2.5 Statische bepalingen vs kwantitatieve, dynamische en vergelijkende analyse

 Statisch: iets relatief onveranderd bepalen, discrete waarden

 Kwantitatief, dynamisch, vergelijkend: iets dat makkelijk varieert bepalen, range v waarden

2.6 Selectie van de methode

 Cfr criteria

2.7 Vereisten/eigenschappen van methoden

 Precisie = variabiliteit = maat voor reproduceerbaarheid

,  Accuraatheid: verschil tssn gemeten en “echte” waarden

 Detectielimiet = gevoeligheid = kleinste waarde die met bepaalde gekozen zekerheid
gemeten kn w

 Analytische range / dynamic range = gebied dat reproduceerbare gegevens geeft

 Analytische specificiteit = selectiviteit = mate waardoor andere componenten in het systeem
interfereren

 Analytische sensiviteit = maat v verandering in output tov verandering in input

 Robuustheid = mate waarin methode consistent resultaat geeft ondanks kleine versch in
experimentele parameters

2.8 Experimentele variatie

 Systematische fout (= reproduceerbare fout) vs random fout (onvoorspelbare fout)

Methoden hoofdstuk 3: Studiemateriaal

3.1 Humaan organisme

 Organisme – vloeistoffen – weefselbiopten

 Voordelen: direct relevant

 Nadelen: beperkte mogelijkheden (ethische commissie) – informed consent

3.2 Modelsystemen

3.2.1 Xenograften

 Bv transplantatie humaan weefsel in muis (PDX), kankercellijn (subcutaan, orthotopisch)

 Voor- en nadelen: in vivo testen wat nt op mens, artificieel: verschil muis-mens en
uitgeschakeld imm syst, duur

3.2.2 Weefselculturen

 Voorbeeld: explant huidtumor

 Voor- en nadelen: manipuleerbaar, cel-cel interactie, beperkt houdbaar, dedifferentiatie

3.2.3 Celculturen

 Primaire culturen (rechtsreeks v weefsel bereid)

o Werkwijze: stukjes hechten plastiek  uitgroeien op versch manieren, mechan diss,
enzym diss, EDTA (cellen losser v elkaar)

o Voor- en nadelen: vele celtypes, zuiver of co (cel-cel), eig deels bewaard, makkelijk
manipuleren, slechts enkele passages (telomeren), moeilijk zuivere culturen

,  Geïmmortaliseerde cellijnen

o Werkwijze: primaire culturen transfecteren/transduceren of infecteren 
immortalisatie  doorkweken + stock invriezen (serum + DMSO)

 Kankercellijnen

o Werkwijze: cellen v tumor (al immortalis), beschikbaar in banken (aanvragen)

o Voor- en nadelen: goedkoop, kweekbaar, manipuleerbaar, afwijkend, eig veranderen
(lagere passage starten), heterogeen karyotype

 Stamcellen

o Multicellulaire organismen, zelfhernieuwing, differentiëren

o Adult: herstelsysteem voor lichaam, multipotent (beenmerg, bloed, weefsel)

o ESC: morula (totipotent), IMC v blastocyst (pluripotent)

 Nadelen: ethisch, pre-differentiatie noodz  teratoma’s (kanker), vreemd
voor imm syst

o iPSC (geïnduceerde pluripotente stamcellen): gediff adulte cellen  dedifferent mbv
eiw belangr voor ESC pluripotentie (4 sleutelgenen)

 Voor- en nadelen: patiënt-specifiek, lange expansie, (theoretisch) alle
celtypes maken in vitro, karyotype checken, goeie controle nodig,
variabiliteit, weinig robuust, dure media

 Toepassing: transplantatie genetisch matching gezonde cellen of ziekte
specifieke behandeling

 Organoïden

3.2.4 Werken met celculturen

 Recipiënten: platen en flessen, statisch & dynamisch

 Celcultuur media:

o Basale media: glucose, Na-pyruvaat, essent az, zouten, vitamines

o Foetaal kalf serum: vit, sporenelem, lipiden, vz, mineralen, carbohydr,
decomplementatie, nadelen: batch variatie, groei-inhib fact, nt gedefin, mog
contamin, ethische bezwaren,  serum vervangingen

o Alternatieve energiebronnen: L-glutamine, pyruvaat

o pH buffer: CO2/Na-bicarbon, fosfaat, HEPES, pH-indic: fenolrood

o Antibiotica

, o Medium sterilisatie: filtratie over membr, bewaren donker

 Celcultuuromgeving: celcultuurlokaal met beperkte toegang

o Bioveiligheidsklassen: I, II, III, IV

 Cellen oogsten, tellen, passeren

o Terminologie: doubling time, passage, split ratio

o Oogsten: enzymatisch, trituratie

o Tellen: celsuspensie met Trp blauw (blauw = dood)

 Manueel: mbv Burker telkamer

 Geautomatiseerd: via foto (snel, precies, duur) of via Coulter counting 
cellen (mengen elektroliet) in vloeist stroom door porie, elektr geleiding
verandert (daling stroom) afh v grootte cel, dat meten

 Cryopreservatie: medium (DMSO, FBS  vriespunt verlagen, beter dehydrateren), rate-
controlled cooling in isopropanol, daarna vloeibare stikstof, ontdooien: snel (DMSO toxisch),
dilutie groeimedium, centrifugatie, resuspensie

 Sterilisatie en desinfectie:

o Steriliseren = doden alle (micro)organismen mbv autoclaaf, droge hitte, gas, straling,
filtratie

o Desinfecteren = verhinderen overdracht (micro)organismen mbv vernveling
ethanol/isopropanol, straling (UV licht)

 Contaminatie:

o Bronnen: operator, omgeving, LAF, …

o Types: bacterieel, gist, schimmel, virus, …

o Detectie: macroscopisch zichtbaar (verkleuring, troebel), microscopisch, mycoplasma
(regelmatig testen, PCR of colorimetrisch)

 Algemene voor-en nadelen: goede controle, goedkoper, miniaturisatie, manipuleerbaar,
serum of slecht gedefinieerde bestanddelen nodig, steriliteit nodig, instabiel, artificieel
(anders dan in vivo), uitputting media, cellijn misidentificatie (authentificatie mbv
karyotypering, PCR STR)

3.2.5 Modelorganismen

 Voor- en nadelen: eenvoudig, manipuleerbaar, meetbaar, kweekbaar, goedkoop

 Gist

Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:

√  	Verzekerd van kwaliteit door reviews

√ Verzekerd van kwaliteit door reviews

Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!

Snel en makkelijk kopen

Snel en makkelijk kopen

Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, Bancontact of creditcard voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.

Focus op de essentie

Focus op de essentie

Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!

Veelgestelde vragen

Wat krijg ik als ik dit document koop?

Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.

Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?

Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.

Van wie koop ik deze samenvatting?

Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper loniebaeyens. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.

Zit ik meteen vast aan een abonnement?

Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €6,99. Je zit daarna nergens aan vast.

Is Stuvia te vertrouwen?

4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)

Afgelopen 30 dagen zijn er 67866 samenvattingen verkocht

Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen

Start met verkopen
€6,99  1x  verkocht
  • (0)
  Kopen