Samenvatting

Samenvatting Biochemie: Metabolisme II (2022-23)(C003369)

4 keer verkocht

Instelling
Universiteit Gent (UGent)

Alle hoofdstukken, namelijk: carbohydraten-, lipiden-, aminozuur- en nucleotidenmetabolisme, enzymkinetiek (excl. werkcollege) & integratie van het energiemetabolisme. Dit is gebaseerd op Ufora PPTs, lesnotities en het boek . Volledig in het Nederlands uitgezonderd de figuren. Bevat ook een lijst ...

[Meer zien]

Voorbeeld 9 van de 74 pagina's

Bekijk voorbeeld

Geupload op 21 januari 2023
Aantal pagina's 74
Geschreven in 2022/2023
Type Samenvatting

carbohydraten
lipidenmetabolisme
aminozuurmetabolisme
enzymkinetiek
nucleotidemetabolisme
pathologiën
biochemie
metabolisme
c003369
integratie van het energiemetabolisme
biochemie en biotechnologie

Volgen

He1senberg Lid sinds 2 jaar 26 documenten verkocht

€8,00

In winkelwagen

Op verlanglijstje

100% tevredenheidsgarantie
Direct beschikbaar na je betaling
Lees online óf als PDF
Geen vaste maandelijkse kosten

He1senberg Samenvatting Universiteit Gent

Biochemie: metabolisme II
(C003369)
Academiejaar: 2022-2023
Lesgever(s): L. Meuris, (N. Callewaert)

,2

,Carbohydraten
Carbohydraten structuurchemie 04
Opbouw van glycanen vereist geactiveerde suiker-bouwstenen 07
Glycosyltransferasen 08
Eiwit-gebonden glycanen 08

Lipidenmetabolisme
Vet-vertering, absorptie en systemisch transport 10
Vetzuuroxidatie 12
Afbraak van vetzuren met dubbele binding of oneven aantal C-atomen 14
Ketogenese 16
Vetzuursynthese 16
Regulatie vetzuurmetabolisme en transport vetzuren in het lichaam 19
Synthese van complexe lipiden 22
Synthese van cholesterol 24
Regulatie en transport van cholesterol 27
Lipid bilayer, membraaneiwitten, membraanstructuur & biosynthese 29

Aminozuurmetabolisme
Eiwit-afbraak 32
Aminozuur-afbraak 34
Aminozuur-biosynthese & afgeleide 39

Enzymkinetiek 42

Nucleotidemetabolisme
Ribonucleotide synthese 48
Deoxyribonucleotide synthese 54
Afbraak van nucleotiden 57

Integratie van het energiemetabolisme
Zoogdieren energiemetabolisme: de “hardware” 58
Orgaanspecialisatie 62
Regulatie: de “software” 65

Pathologiën 71

Referenties
› Ufora PowerPoints
› 978-1-119-45166-2

3

, Hoofdstuk 1
Carbohydraten

Carbohydraten structuurchemie
Structuurchemie
 Fisher projectie
 D-monosacchariden te herleiden tot D-glyceraldehyde

 Enkele aldosen (CHO; aldehydegroep)

D-Glucose (Glc) D-Ribose (Rib) D-Mannose (Man) D-Galactose (Gal)
 Enkele ketosen (C=O; ketongroep)

D-ribulose D-Fructose

 D/L: zegt iets specifiek over het stereogeen centrum dat het verst verwijderd is van de keton of
aldehyde functie in monosacchariden
 R/S: heeft betrekking op de absolute configuratie rond een (gelijk welke) stereogeen centrum

 (Stereo)isomeren
➢ Isomeer = zelfde moleculaire functie
➢ Stereoisomeer = zelfde moleculaire functie en zelfde volgorde van covalente bindingen
maar verschil in stereochemie
➢ Diastereomeren = stereomeren met verschillende configuratie rond minstens één
stereogeen centrum
▪ Enantiomeer = spiegelbeeld = stereoisomeren met verschillende configuratie rond alle
stereogene centra
▪ Epimeren = stereoisomeren met verschillende configuratie rond exact één stereogeen
centrum

4

,Ringvorming
 Hemiacetal/hemiketal vorming (zie figuur)
 Pyranose (6C) of furanose (5C) – Benaming enkel gebruikt in cyclisch vorm
 Anomeer koolstof/centrum wordt nieuwe stereogeen centrum -> alfa of beta

 Mutatrotatie
➢ Van alfa naar beta-vorm via lineaire vorm
➢ Is evenwichtsreactie
➢ Vanaf covalente binding niet meer mogelijk
 Ringen zijn niet vlak
➢ Chair: meest stabiel \/\
➢ Boat: enzymatische reacties \__/
➢ Axiaal: OH’s uit het vlak
➢ Equatoriaal: OH’s in het vlak
➢ Sterische hindering vooral van belang

5

,Monosaccharidemodificaties
 Oxidatie van de aldose (-onic acid) of primaire alcoholfunctie (-uronic acid)

D-gluconic acid / D-glucuronic acid /
D-gluconzuur D-glucuronzuur
 Reductie -> deoxysuikers (zie verder, ribonucleotide reductase)
 Amminatie
➢ geen localisatie in naamgeving (-amine) omdat vrijwel altijd op C2 plaatsvindt
➢ Aminogroep (NH2) vaak geacetyleerd
➢ Uitzondering: siaalzuur-derivaten (C9-suikers (Hexose + pyruvaat))
▪ Geacetyleerde aminegroep op C4
▪ Altijd Alfa-vorm

CH2OH CH2OH

H O H H O H
H H
OH H OH H
OH OH OH O OH
H NH2 H N C CH3
H
-D-glucosamine -D-N-acetylglucosamine

Glycoconjugaten
 Biomoleculen die aan carbohydraten zijn gebonden
 Koppeling aan het anomeer centrum = glycosidische binding

6

,Veel voorkomende disachariden
 Reducerend/niet-reducerend
➢ Reducerend: als een unit nog een vrij anomeer koolstof bevat
➢ Niet-reducerend: omgekeerd, bv. Koppeling twee anomere centra
 Lactose
➢ Reducerend suiker
➢ Galactose--1,4-glucose
➢ Lactose intolerantie
 Sucrose
➢ Niet-reducerend suiker
➢ Glucose--1,2--Fructose
➢ Sucrose-mimics: artificiële zoetstoffen
➢ tra

Veel voorkomende polysachariden
 Cellulose
➢ -1,4-glucose
➢ H-bruggen en stacking van ringen -> kristalijn
 Chitine
➢ GlcNac--1,4-GlcNac (N-acetylglucosaminepolymeer)
➢ Geleedpotigen, schimmels en vis maar niet bij zoogdieren en planten
➢ Lichaamsvreemd voor zoogdieren -> immuunreactie
➢ Dieren hebben keratine (EW) in de plaats
 Zetmeel
➢ Mengsel van amylose en amylopectine
▪ Amylose: -1,4-Glucose
▪ Amylopectine: -1,4-Glucose en -1,6 vertakkingen
• Gelijkaardig aan glycogeen maar minder vertakt
➢ Gebruikt als opslagmolecule in plaats van monomere vorm omdat het een lagere
osmotische druk heeft
➢ Afbraak: amylase, alfa-glycosidase, debranching enzyme
 Glycosaminoglycanen
➢ Herhalende disaccharide; geoxideerd suiker + acetylaminezuur
➢ Component van extracellulaire matrix
➢ Steunverlenend
➢ Groeifactorgradiënt (schade detectie, immuuncellen)
➢ Vb. heparine (inhibeert bloedstolling) (Mastcellen)

Opbouw van glycanen vereist geactiveerde suiker-
bouwstenen
“Suikernucleotiden”-synthese
 Geactiveerde monosaccharide (anomeer gefosforyleerd)
 Glycosyltransferasen
 Reactie van een geactiveerd monosaccharide met een nucleosidetrifosfaat
 Netwerk van reacties, endo/exo-geen
 Glycosylaties aan membranen
➢ Met behulp van polyprenolfosfaat-gebonden
monosacchariden
➢ (Dolichol-fosfaat)
➢ Bevat hydroob (ingebed in membraan)
▪ en hydrofiel deel (op oppervlak, gebonden met suiker)

7

,glycosyltransferasen
 Glycosylatie: carbohydraatgroep aan een andere molecule
 Glucosylatie: glucose aan een andere molecule
 Glycatie: niet-enzymatische koppeling carbohydraten aan een biomolecule
 Geactiveerd donor suiker + ROH acceptor suiker
➢  of , maar onveranderlijk

Eiwit-gebonden glycanen
“glycoproteïne” / “proteoglycaan”
 Afhankelijk van welk deel grootst is
 Glycoproteïnen (bv. N-,O- glycanen)
 Proteoglycanen (bv. GAG's en
glycosylphosphatidylinositol ankers)

N-glycosylatie
 N-glycanen = asparagine (asn) - verbonden oligosacchariden
 Asn - X - thr/ser (waarbij X alle AZ behalve proline kan zijn)
 N-glycaan synthese (=geconserveerde ER-gelokaliseerde pathway)
➢ Een oligosaccharide (met 9 mannose, 3 glucose en 2 GlcNAc-residuen) wordt
gesynthetiseerd op een lipide (dolichol) in het ER membraan (eerst cytosolair, vervolgens in
lumen)
➢ De oligosaccharide wordt gebonden aan de asn van een groeiend polypeptideketen die
gesynthetiseerd wordt door een ER-geassocieerd ribosoom (cotranslationeel).
➢ Sommige suikers worden verwijderd tijdens de processing, die begint in het lumen van het
ER en gaat verder in het Golgi. De enzymatische trimming wordt gekatalyseerd door
glucosidases en mannosidases
➢ Glycosyltransferases voegen (in het Golgi) andere monosaccharide eenheden toe zoals
GlcNAc, galactose, fucose en siaalzuur. Dit zorgt voor een zeer grote diversificatie

8

,  Glyosylatie als quality-control mechanisme (In eukaryoten)
➢ De aanhechting van de oligosacharide verifieert dat het eiwit met succes wordt
getransloceerd van het cytosol naar het ER-lumen.
➢ De daaropvolgende verwijdering van de twee terminale glucoseresiduen stelt het eiwit in
staat om te interageren met een chaperonne die de gedeeltelijk verwerkte oligosaccharide
herkent.
➢ De membraangebonden chaperonne, calnexin genaamd, of het oplosbare homologe
calreticuline, bindt het onrijpe (uitgevouwen) glycoproteïne om het vouwen ervan te
vergemakkelijken en om het te beschermen tegen afbraak of vroegtijdige overdracht naar
het Golgi-apparaat.

➢ Nadat het opgevouwen glycoproteïne is vrijgesteld uit calnexin/calreticulin, gaat het door
de rest van de oligosaccharide-processing pathway.
➢ Een glycoproteïne dat vrijkomt voordat het zijn volwassen conformatie heeft aangenomen,
kan nog steeds de volgende stap van verwerking ondergaan, namelijk het verwijderen van
een ander glucoseresidu.
➢ Wanneer dit echter gebeurt, bevestigt een glycosyltransferase (dat alleen ontvouwde
glycoproteïnen herkent) een glucoseresidu aan het onrijpe oligosaccharide. (UGGT = GT =
UDP-Glc-gylcoprotein glucosyltransferase)
➢ Als gevolg hiervan kan het glycoproteïne opnieuw binden aan calnexin / calreticulin voor
een nieuwe kans om goed te vouwen

 Drie klassen: “High mannose, “hybrid” & “complex” -type

O-glycosylatie
 Mucine-type O-glycosylatie, meest voorkomende in zoogdieren
➢ GalNac als initiërend monosaccharide
➢ =("core-1" O-glycaan)
➢ Ser/Thr
 Heel grote diversiteit door verschillende types core structuren,
➢ verlengingen en eindstandige structuren
 Mucines in de secreten van slijmcellen
 Slaan ER stadium over
 Gebruiken zelfde enzymen als N-glycosylatie

De glycocalyx
 Bedekking van cellen met glycoconjugaten
 Cel-cel communicatie en interactie
 Interactie met pathogenen

Modulatoren van glycoproteïne functionaliteit
 Glycanen hoofdzakelijk hydrofiel
 Bedekken eiwitoppervlak -> kunnen actief centrum bedekken bv.

9

Dit zijn jouw voordelen als je samenvattingen koopt bij Stuvia:

Bewezen kwaliteit door reviews

Studenten hebben al meer dan 850.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet jij zeker dat je de beste keuze maakt!

In een paar klikken geregeld

Geen gedoe — betaal gewoon eenmalig met iDeal, Bancontact of creditcard en je bent klaar. Geen abonnement nodig.

Focus op de essentie

Studenten maken samenvattingen voor studenten. Dat betekent: actuele inhoud waar jij écht wat aan hebt. Geen overbodige details!

Veelgestelde vragen

Wat krijg ik als ik dit document koop?

Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.

Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?

Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.

Van wie koop ik deze samenvatting?

Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper He1senberg. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.

Zit ik meteen vast aan een abonnement?

Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €8,00. Je zit daarna nergens aan vast.

Is Stuvia te vertrouwen?

4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)

Afgelopen 30 dagen zijn er 68175 samenvattingen verkocht

Opgericht in 2010, al 15 jaar dé plek om samenvattingen te kopen

Start met verkopen

Samenvatting

Samenvatting Biochemie: Metabolisme II (2022-23)(C003369)

Document informatie

Onderwerpen

Geschreven voor

Verkoper

Ontvangen beoordelingen

Voorbeeld van de inhoud