Samenvatting
Samenvatting Toegepaste microbiologie
- Instelling
- Karel De Grote-Hogeschool (KdG)
Samenvatting theorie toegepaste microbiologie. 3de jaar bachelor biochemie.
[Meer zien]Voorbeeld 4 van de 43 pagina's
Voorbeeld 4 van de 43 pagina's
In winkelwagenVerkoper
Volgen
Voorbeeld van de inhoud
Toegepaste microbiologieInhoud
1 Genen .................................................................................................................................................... 4
1.1 De flow van genetische informatie ............................................................................................... 4
1.2 De structuur van nucleinezuren .................................................................................................... 4
1.2.1 Structuur van DNA ................................................................................................................. 4
1.2.2 Structuur van RNA ................................................................................................................. 5
1.3 Eukaryoot DNA .............................................................................................................................. 6
1.4 DNA replicatie................................................................................................................................ 6
1.4.1 Rollling circle replication ....................................................................................................... 6
1.4.2 Eukaryoten DNA replication .................................................................................................. 6
1.4.3 Replication machinery ........................................................................................................... 6
1.5 Genen ............................................................................................................................................ 7
1.5.1 Genen die coderen voor eiweitten........................................................................................ 8
1.5.2 Genen die coderen voor tRNA en rRNA ................................................................................ 8
1.6 Transcriptie .................................................................................................................................... 9
1.7 Translatie ....................................................................................................................................... 9
2 Regulatie van genexpressie ................................................................................................................. 10
2.1.1 Regulatorische eiwitten....................................................................................................... 10
2.1.2 Het lac operon ..................................................................................................................... 12
2.1.3 Lac operon: Negatieve controle van induceerbare genen .................................................. 13
2.1.4 Het tryptofaan operon:negatieve controle van represseerbare genen .............................. 13
2.1.5 Het arabinose operon: controle door een eiwit met dubbele werking .............................. 13
2.1.6 Twee componenten systemen en fosforelay systemen ...................................................... 13
2.2 Regulatie van transcriptie elongatie............................................................................................ 14
2.2.1 Attenuatie............................................................................................................................ 14
2.2.2 Riboswitches ........................................................................................................................ 16
2.3 Regulatie op translatie niveau ..................................................................................................... 16
2.3.1 Regulatie van translatie door riboswitches ......................................................................... 16
2.3.2 Regulatie van translatie door small RNA ............................................................................. 16
2.4 Globale regulatorische systemen ................................................................................................ 16
, 2.4.1 Katabolische repressie......................................................................................................... 17
2.4.2 Catabolisch activator protein (CAP) .................................................................................... 17
3 Genetische variatie .............................................................................................................................. 17
3.1 Mutaties ...................................................................................................................................... 17
3.1.1 Spontante mutaties ............................................................................................................. 17
3.1.2 Geinduceerde mutaties ....................................................................................................... 18
3.1.3 Effecten van mutaties.......................................................................................................... 18
3.1.4 Mutaties in genen die coderen voor eiwitten ..................................................................... 19
3.1.5 Effect van mutaties .............................................................................................................. 20
3.1.6 Mutaties in regulatorische sequenties ................................................................................ 20
3.2 Detectie en isolatie van mutanten .............................................................................................. 20
3.2.1 Detectie van mutanten........................................................................................................ 20
3.2.2 Carcinogeneciteitstesten ..................................................................................................... 20
3.3 DNA herstel ................................................................................................................................. 21
3.3.1 Excision repair ..................................................................................................................... 21
3.3.2 Direct repair......................................................................................................................... 22
3.3.3 Mismatch repair .................................................................................................................. 22
3.3.4 Recombination repair .......................................................................................................... 22
3.3.5 SOS response ....................................................................................................................... 22
3.4 Genetische variatie ...................................................................................................................... 23
3.4.1 Recombinatie in eukaryoten ............................................................................................... 23
3.4.2 Horizontale genentransfer in prokaryoten.......................................................................... 23
3.4.3 Bacteriaal plasmide ............................................................................................................. 25
3.4.4 Conjugatie............................................................................................................................ 25
3.4.5 Transformatie ...................................................................................................................... 26
3.4.6 Transductie .......................................................................................................................... 27
3.5 Mapping het genoom .................................................................................................................. 28
3.5.1 Hfr mapping ......................................................................................................................... 29
3.5.2 Transformatie mapping ....................................................................................................... 29
4 Recombinant DNA technologie ........................................................................................................... 29
4.1 Restricite enzymes....................................................................................................................... 30
4.2 Gelelectroforese .......................................................................................................................... 30
4.3 Southern blotting ........................................................................................................................ 30
,4.4 DNA fingerprinting ...................................................................................................................... 31
4.5 Moleculaire hybridisatie .............................................................................................................. 31
4.6 cDNA ............................................................................................................................................ 31
4.7 PCR............................................................................................................................................... 32
4.8 kloneneren .................................................................................................................................. 34
4.8.1 Kloneringsvectoren.............................................................................................................. 34
4.8.2 Plasmiden als kloneringsvector ........................................................................................... 34
4.8.3 Fagen als vectoren ............................................................................................................... 36
4.8.4 Cosmiden als vectoren ........................................................................................................ 36
4.8.5 Artificiele chromosomen als vectoren ................................................................................ 36
4.9 Expressievectoren ....................................................................................................................... 37
4.9.2 Eukaryote expressiesystemen ............................................................................................. 38
4.10 Genenbanken of genenbibliotheken ........................................................................................... 39
4.10.1 Fenotypische rescue ............................................................................................................ 39
4.10.2 Probe vs primer ................................................................................................................... 39
4.10.3 Probe werking...................................................................................................................... 40
4.11 Genetic engineering .................................................................................................................... 40
4.11.1 Knock outs ........................................................................................................................... 40
4.11.2 Raportergenen GFP ............................................................................................................. 41
4.11.3 Gentherapie......................................................................................................................... 41
4.11.4 RNA interferentie (‘gene silencing’) .................................................................................... 41
4.11.5 Crispr CAS 9 ......................................................................................................................... 42
, 1 Genen
DNA = molecule dat de genetische informatie van een organisme bevat.
RNA = zorgt ervoor dat deze genetische informatie tot expressie komt zodat enzymen en andere eiwitten
aangemaakt kunnen worden.
1.1 De flow van genetische informatie
van DNA, over RNA tot eiwit ➔ het centrale dogma
De flow van de ene generatie op de andere (replicatie);
De flow binnen een cel (genexpressie)
DNA fungeert als opslagmolecule van alle genetische informatie die gedupliceerd
wordt en doorgegeven aan het nageslacht.
Synthese van DNA kopie ➔ replicatie. Wordt gekatalyseerd door DNA
polymerase.
Genexpressie begint met de aanmaak van van een RNA kopie van het gen. ➔
transcriptie
DNA-base sequentie wordt overschreven in een RNA-base sequentie, uitgevoerd
door RNA-polymerase.
Tijdens de laatste fase van genexpressie, de translatie. Wordt de basensequentie van het mRNA vertaald
naar een aminozuursequentie van een polypetide-keten.
1.2 De structuur van nucleinezuren
DNA en RNA zijn polymeren van nucleotiden, hangen aan elkaar via fosfo diester verbindingen.
DNA ➔ G, C, T, A suiker = deoxyribose
RNA ➔ G, C, U, A suiker = ribose
1.2.1 Structuur van DNA
2 polynucleotide-strengen die opgerold zijn zodat ze een dubbele helix vormen. Bevat purines en
pyrimidines (allebeie vastgehecht aan het 1’-C uiteinde van de suikers) die samengehouden worden via
fosofdiester bindingen.
Een fosforzuur vormt een binding tussen een 3’OH uieinde van het ene suiker en een 5’OH uiteinde van
het naburige suiker.
Purine = A G A vormt 2 H bruggen, G vormt er 3
Pyrimidine = T C U
Verschillen DNA en RNA: de stikstof bases, de suiker, single/double stranded
(suiker + base (zonder fosforgroep) = nucleoside)
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
√ Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, Bancontact of creditcard voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper wesleyl1. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €6,49. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 73314 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen