100% tevredenheidsgarantie Direct beschikbaar na betaling Zowel online als in PDF Je zit nergens aan vast
logo-home
Eerder door jou gezocht
Eerder door jou gezocht
logo
Samenvatting van alle hoorcolleges, werkcolleges en zelfstudies van bio-informatica (BMW11219) €8,99   In winkelwagen
Snel navigeren naar
Voorbeeld
  2.  
  3. Universiteit Utrecht (UU)
  4.  
  5. Bio-informatica (BMW11219)

Samenvatting

Samenvatting van alle hoorcolleges, werkcolleges en zelfstudies van bio-informatica (BMW11219)
 21 keer bekeken  0 keer verkocht
  • Vak
  • Bio-informatica (BMW11219)
  • Instelling
  • Universiteit Utrecht (UU)

Deze gedetailleerde samenvatting behandelt alles wat aan bod is gekomen tijdens de hoorcolleges, werkcolleges en zelfstudies van de cursus Bio-informatica aan de Universiteit Utrecht (BMW11219). Hierdoor bevat het alle informatie die nodig is voor het eindtentamen.

Voorbeeld 4 van de 214  pagina's

Document informatie

  • 9 maart 2023
  • 214
  • 2019/2020
  • Samenvatting

Onderwerpen

  • logische operatoren
  • vectoren
  • matrices
  • lijsten
  • dataframes
  • factors
  • data importeren
  • kwaliteitscontrole
  • red flags
  • visualisatie
  • histogram
  • boxplot
  • correlatieplot
  • heatmap
  • afg
  • spreidingsdiagram scatter plot

Geschreven voor

  • Universiteit Utrecht (UU)
  • Biomedische Wetenschappen
  • Bio-informatica (BMW11219)
Alle documenten voor dit vak (1)

Verkoper

avatar-seller
xnicolevdz

Ontvangen beoordelingen

Voorbeeld van de inhoud

Samenvatting
Bio-informatica
WEEK 1 T/M WEEK 10
Biomedische Wetenschappen - 2019/2020
Door Nicole (studente BMW)

,Inhoudsopgave
Bio-informatica ........................................................................................................................................ 8
Terminologie ....................................................................................................................................... 8
Databases ........................................................................................................................................ 8
Omics ............................................................................................................................................... 8
Programmeren ................................................................................................................................ 8
Toepassingen ....................................................................................................................................... 8
Sequentie analyse............................................................................................................................ 9
Eiwitstructuren .............................................................................................................................. 10
Genexpressie ................................................................................................................................. 10
Biologische netwerken .................................................................................................................. 10
Introductie R Basis ................................................................................................................................. 11
Inleiding ............................................................................................................................................. 11
Programmeren .................................................................................................................................. 11
R en RStudio .................................................................................................................................. 12
Berekeningen................................................................................................................................. 12
Datatypes .......................................................................................................................................... 14
Logische operatoren ...................................................................................................................... 14
Datastructuren .................................................................................................................................. 15
Vectoren met willekeurige waarden en karakter.......................................................................... 16
Matrices ......................................................................................................................................... 16
Lijsten en dataframes .................................................................................................................... 17
Factors ........................................................................................................................................... 18
Introductie R Importeren ...................................................................................................................... 19
Data importeren ................................................................................................................................ 19
Kwaliteitscontrole.......................................................................................................................... 22
Data selecteren ................................................................................................................................. 23
Veelvoorkomende fouten ............................................................................................................. 23
Logische operatoren ...................................................................................................................... 24
Dataframe...................................................................................................................................... 24
Data sorteren en ordenen ................................................................................................................. 25
Missende gegevens ........................................................................................................................... 26
Rode vlaggen ................................................................................................................................. 26




1

,Introductie R Grafieken ......................................................................................................................... 28
Visualisatie......................................................................................................................................... 28
Spreidingsdiagram (scatterplot) .................................................................................................... 30
Histogram ...................................................................................................................................... 31
Boxplot .......................................................................................................................................... 32
Correlatieplot ................................................................................................................................ 33
Heatmap ........................................................................................................................................ 34
Aanpassen van visualisaties .............................................................................................................. 34
Assen ............................................................................................................................................. 34
Titel ................................................................................................................................................ 34
Markers ......................................................................................................................................... 34
Legenda ......................................................................................................................................... 36
Valkuilen en leugens van visualisaties............................................................................................... 36
Afgekapte as .................................................................................................................................. 36
Dubbele as ..................................................................................................................................... 37
Selectieve contrasten (heatmaps) ................................................................................................. 37
Opslaan van plots .............................................................................................................................. 39
Introductie R Cancer genomics ............................................................................................................. 40
Sequencing ........................................................................................................................................ 41
Mutaties ........................................................................................................................................ 41
Panorama van driver mutaties ...................................................................................................... 43
TGCA dataset ..................................................................................................................................... 44
Introductie R Functies ........................................................................................................................... 45
Functies in RStudio ............................................................................................................................ 45
Scope ................................................................................................................................................. 46
If/else statements ............................................................................................................................. 47
Apply .................................................................................................................................................. 48
Varianten van apply....................................................................................................................... 49
Onderzoeksvragen en designs ............................................................................................................... 51
Onderzoekscyclus .............................................................................................................................. 51
Onderzoeksvraag ........................................................................................................................... 51
Werkplan ....................................................................................................................................... 53
Onderzoeksopzet (design) ............................................................................................................. 54




2

, Beschrijvende statistiek......................................................................................................................... 61
Statistiek in onderzoek ...................................................................................................................... 61
Kengetallen continue uitkomstmaten ............................................................................................... 62
Locatiematen ................................................................................................................................. 62
Spreidingsmaten............................................................................................................................ 64
Overzicht ....................................................................................................................................... 64
Correlatie (samenhang) ..................................................................................................................... 65
Beschrijvende statistiek in RStudio ................................................................................................... 67
Frequentiematen en associatiematen .................................................................................................. 69
Frequentiematen............................................................................................................................... 69
Prevalentie..................................................................................................................................... 69
Incidentie ....................................................................................................................................... 69
Associatiematen ................................................................................................................................ 71
Relatief risico ................................................................................................................................. 71
Risicoverschil ................................................................................................................................. 73
Odds ratio ...................................................................................................................................... 73
Datacyclus.............................................................................................................................................. 75
Inleiding ............................................................................................................................................. 75
Datamanager ................................................................................................................................. 75
UPOD ............................................................................................................................................. 75
Stap 0 ............................................................................................................................................. 75
Data verzamelen (stap 1) .................................................................................................................. 76
Data verwerken (stap 2) .................................................................................................................... 77
Data analyseren (stap 3).................................................................................................................... 78
Data publiceren (stap 4) .................................................................................................................... 79
Data archiveren (stap 5) .................................................................................................................... 80
Data hergebruiken (stap 6)................................................................................................................ 81
FAIR data ........................................................................................................................................... 82
Findable ......................................................................................................................................... 82
Accesible ........................................................................................................................................ 82
Interoperable................................................................................................................................. 82
Reusable ........................................................................................................................................ 82
Next Generation Sequencing ................................................................................................................ 83
Sanger sequencing............................................................................................................................. 83
Sequentie technologieën .................................................................................................................. 84
Library preparation............................................................................................................................ 84

3

Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:

√ Verzekerd van kwaliteit door reviews

√ Verzekerd van kwaliteit door reviews

Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!

Snel en makkelijk kopen

Snel en makkelijk kopen

Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, Bancontact of creditcard voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.

Focus op de essentie

Focus op de essentie

Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!

Veelgestelde vragen

Wat krijg ik als ik dit document koop?

Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.

Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?

Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.

Van wie koop ik deze samenvatting?

Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper xnicolevdz. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.

Zit ik meteen vast aan een abonnement?

Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €8,99. Je zit daarna nergens aan vast.

Is Stuvia te vertrouwen?

4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)

Afgelopen 30 dagen zijn er 67866 samenvattingen verkocht

Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen

Start met verkopen

Laatst bekeken door jou

Tentamen (uitwerkingen) ·

(0)

NSG6430 Women's Health Questions with 100% Correct Answers | Latest Version 2024 | Verified

Samenvatting ·

(0)

Antwoordenbladen, opdrachtenbladen voor Duitse grammatica oefenen

Tentamen (uitwerkingen) ·

(0)

Chapters 1-8 Elsevier Evolve Questions and Answers

Tentamen (uitwerkingen) ·

(0)

EMT Class 2024 TEST Questions And Answers 100% Pass

€8,99
  • (0)
  Kopen