Answers of all the exam questions from the course 'Genome Technology and Applications' (19/20): It contains a compact summary and elaboration of all the exam questions from the course 'Genome Technology and Applications' , This document can be learned in 2-3 days (19/20).
Gene and Genome Technology
13/01/20 - 08u30 group 1
5 questions. 1 oral, 4 written.
Oral: You discovered a new bird species and want to sequence the complete genome. Which
technique would you use? Which ones wouldn't be good and why?
Written 1: array-CGH vs. SNP-array. What are the similarities and differences of these
techniques used for finding deletions and duplications?
Written 2: PacBIO and Nanopore; both techniques that are able to sequence long sequences.
Choose one to explain and explain why they're able to read long sequences.
3: a) You want to clone a PCR product into a specific vector into an EcoRI site. The PCR
product however doesn't have an EcoRI site. How would you solve this knowing that it has to
go in the EcoRI site? (max 10 lines)
Written 3: b) List the different cloning vectors, the sizes of the insert for each and best known
applications for each.
Written 4: In evolution, how do gene duplications occur and what will happen to these genes after
a few generations?
14/01 - 8u30
1) Ion proton sequencing. Why difficulties with long stretches of homosequences (AAAAAAAA or
GGGGGGG)
2) A) …
B) site directed mutagenesis + drawing
3) Relevance of genotyping of CYP2D6 and CYP3A4 in context pharmacogenomics
4) Explain
a) Exon shuffling
b) Paralogue
c) TPMT
d) Mycoplasma genitalia
5) Oral. Human protein expression in T cells.. Not a lot known. Goal: purification. Strategy?
16/01 - 13u00
1) A clinician comes to you because she found a patient that has the clinical symptoms of a
specific genomic disease. This disease has a deletion of a CNV including 5 genes. You use a
SNP assay to look at the DNA of your patient and you discover no such deletion of a CNV in
this region. What would you tell the clinician to test next?
2) a) A clinician wants to do a mutation analysis in the coding region of a gene. This gene
consists of only one coding exon. They want to do a PCR, a cloning, pick up a clone and do
Sanger sequencing. What is the problem with this, what did they forget? How can you resolve
this problem?
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
√ Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, Bancontact of creditcard voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper lemmeslodders. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €7,39. Je zit daarna nergens aan vast.
