Samenvatting
Samenvatting - toegepaste microbiologie theorie
- Instelling
- Karel De Grote-Hogeschool (KdG)
samenvatting en vertaling van H1-H5 van toegepaste microbiologie
[Meer zien]Voorbeeld 7 van de 50 pagina's
Voorbeeld 7 van de 50 pagina's
In winkelwagen
Voorbeeld van de inhoud
InhoudToegepaste microbiologie......................................................................................................................1
1. Genen.................................................................................................................................................1
1.1 Centrale dogma:...........................................................................................................................1
1.2 DNA replicatie...............................................................................................................................3
2. Regulatie van genexpressie................................................................................................................6
2.1 Transcriptie initiatie......................................................................................................................6
2.1.1 Induceerbare vs. onderdrukbare genen................................................................................6
2.1.2 Situatie 1: effect van een repressor op induceerbare genen.................................................7
2.1.3 Situatie 2: effect van een repressor op onderdrukbare genen..............................................7
2.1.4 Situatie 3: effect van een activator op induceerbaar gen......................................................8
2.1.5 Situatie 4: effect van een activator op een onderdrukbaar gen.............................................8
2.2 Transcriptie elongatie...................................................................................................................8
2.2.1 Attenuatie..............................................................................................................................8
2.2.2 Riboswitches........................................................................................................................10
2.3 Translatie....................................................................................................................................10
2.3.1 Kleine RNA moleculen..........................................................................................................10
2.4 Posttranslatie (niet in deze cursus).............................................................................................10
3. Genetische variatie...........................................................................................................................11
3.1 Tautomerisatie............................................................................................................................11
3.2 Soorten mutatie..........................................................................................................................12
3.3 Gevolg van mutaties...................................................................................................................12
3.4 Mutant detectie systeem............................................................................................................13
3.4.1 Replica plating:....................................................................................................................13
3.4.2 Mutant selectie:...................................................................................................................13
3.4.3 Ames test.............................................................................................................................14
3.5 DNA herstel systemen................................................................................................................15
3.5.1 Proofreading........................................................................................................................15
3.5.2 Excision repair (knippen).....................................................................................................15
3.5.3 Direct herstel.......................................................................................................................15
3.5.4 Mismatch herstel.................................................................................................................16
3.5.5 Recombinanten herstel........................................................................................................17
3.5.6 SOS response.......................................................................................................................17
3.6 DNA uitwisseling.........................................................................................................................18
3.6.1 Recombinatie op moleculair niveau.....................................................................................19
1
, 3.6.2 Bacteriële plasmiden...........................................................................................................22
3.7 Bacteriële transformatie.............................................................................................................23
3.8 Transductie.................................................................................................................................23
3.9 Het genoom achterhalen d.m.v. onderbroken paar proces........................................................24
4. Recombinant-DNA-technologie........................................................................................................25
4.1 Termen.......................................................................................................................................25
4.2 Organismen gebruikt in recombinatie........................................................................................25
4.3 Probleem bij recombinanten......................................................................................................25
4.4 Restrictie enzymen.....................................................................................................................25
4.5 Southern blotting........................................................................................................................26
4.6 cDNA = complementary DNA......................................................................................................27
4.7 Kloneren.....................................................................................................................................28
4.8 Kloneringsvector.........................................................................................................................29
4.8.1 Plasmiden als vector............................................................................................................30
4.8.2 fagen als vectoren................................................................................................................33
4.8.3 cosmids als vectoren............................................................................................................33
4.8.4 artificiële chromosomen als vectoren..................................................................................35
4.9 Expressievectoren.......................................................................................................................36
4.10 Mogelijke promotors................................................................................................................37
4.10.1 Lac-operon.........................................................................................................................37
4.10.2 Arabinose operon PBAD.......................................................................................................37
4.11 Wat wordt er gevormd bij expressievectoren..........................................................................37
4.12 Voorbeeld expressievector oligohistidine-expressievector (pTrcHis) ......................................38
4.13 Eukaryoten als expressiesystemen...........................................................................................39
4.14 Genetische manipulatie van planten........................................................................................39
4.15 Hoe zoek je een bepaald gen....................................................................................................40
4.16 Fenotypische rescue.................................................................................................................40
4.17 Gebruik van probe....................................................................................................................41
4.17.1 Verschil tussen probes & primers......................................................................................41
4.17.2 Genenbank.........................................................................................................................41
4.18 Genetic engineering..................................................................................................................41
4.18.1 Knock-outs.........................................................................................................................41
4.18.2 Reportergenen...................................................................................................................44
4.18.3 RNA-interferentie (RNAi) = gene silencing.........................................................................44
4.19 PCR...........................................................................................................................................45
4.19.1 Reverse PCR.......................................................................................................................45
2
, 4.19.2 Real time PCR.....................................................................................................................45
5. Genomics..........................................................................................................................................46
5.1 Sanger method...........................................................................................................................46
5.2 Next generation sequensing (NGS).............................................................................................47
3
,Toegepaste microbiologie
1. Genen
1.1 Centrale dogma:
Transcriptie: complementaire RNA streng o.b.v. DNA
Translatie: tRNA brengt aminozuur o.b.v. mRNA in de ribosoom
1
,Vernieuwde versie (gevolg van reverse DNA transcriptie en RNA replicatie door virussen):
DNA: structuur? Nucleotiden
Verschil DNA // RNA
Dubbele streng (ds)// enkele streng (ss)
ATGC // AUGC
Desoxyribose suiker // ribose suiker
Suiker + base: nucleoside
Nucleoside + fosfor: nucleotide
DNA en RNA worden gerepliceerd van 5’ naar 3’
Sanger sequencing: https://www.youtube.com/watch?v=9QPt8vQ5OZ4&t=25s
2
,1.2 DNA replicatie
Semiconservatief: moederstreng plus aansluiting van complementaire basen
Bij meesten prokaryoten bi-directioneel: één vork langs elke kant van de ORI-site
Rolling circle principe (bij bacteriële plasmiden of virale genomen):
DNA replicatie kan niet beginnen zonder primer
3
, DNA polymerase: Gamma complex in de replicatievork, beide core enzymen repliceren elk een streng
DNA, rode cirkel zorgt dat DNA open blijft, paarse bollen breekt waterstofbruggen waardoor
replicatievork open gaat
Leading en lagging strand, gevolg van 5’ 3’ replicatie
3’ naar 5’ van de moederstreng
Replicatie stopt op ter-site (terminatie-site)
A bindt met T/U
C bindt met G
4
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
√ Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, Bancontact of creditcard voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper sennedhaens. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €6,49. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 72914 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 15 jaar dé plek om samenvattingen te kopen